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熱ショック応答におけるノンコーディングRNAを含有する新規核内構造体の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16H06743
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 生物系薬学
研究機関東京大学

研究代表者

小野口 玲菜 (水谷玲菜 / 水谷 玲菜)  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)

研究期間 (年度) 2016-08-26 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードノンコーディングRNA / 核内構造体 / 熱ストレス応答 / ストレス応答 / 長鎖ノンコーディングRNA
研究成果の概要

申請者が独自に発見したMALAT1ノンコーディングRNAを含有する熱ストレス応答性の新規核内構造体の機能を解明するために、新規構造体の構成因子をとしてMALAT1結合タンパク質を同定することを目的とした。2016年は、MALAT1結合タンパク質群を網羅的に同定するための手法の確立を行った。2017年は上記手法を用いて、熱処理した細胞におけるMALAT1結合タンパク質群の解析をした結果、70種のタンパク質を同定した。これらには転写因子やスプライシング制御因子が多く含まれていたことから、熱応答性の新規構造体は転写やスプライシングなどの制御に関与する可能性が考えられる。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of Minimal p53 Promoter Region Regulated by MALAT1 in Human Lung Adenocarcinoma Cells.2018

    • 著者名/発表者名
      Tano K, Onoguchi-Mizutani R, Yeasmin F, Uchiumi F, Suzuki Y, Yada T, Akimitsu N
    • 雑誌名

      frontiers in Genetics

      巻: なし ページ: 208-208

    • DOI

      10.3389/fgene.2017.00208

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 5'-Bromouridine IP Chase (BRIC)-Seq to Determine RNA Half-Lives.2018

    • 著者名/発表者名
      Yamada T, Imamachi N, Onoguchi-Mizutani R, Imamura K, Suzuki Y, Akimitsu N.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: 1720 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-7540-2_1

    • ISBN
      9781493975396, 9781493975402
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Techniques for genome-wide expression analysis of non-coding RNA.2017

    • 著者名/発表者名
      Rena Mizutani, Toshimichi Yamada, Nobuyoshi Akimitsu
    • 雑誌名

      Handbook of Epigenetics, 2nd Edition

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 長鎖非コードRNA, MALAT1を含有する新規核内構造体を介した熱ショック応答機構の解明2017

    • 著者名/発表者名
      小野口(水谷)玲菜、 鈴木穣、 川村猛、秋光信佳
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-09-02   更新日: 2019-03-29  

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