環状RNAによるびまん性胃癌の悪性形質獲得とその分子機構の解明

• 研究課題/領域番号: 16H07123
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 京都府立医科大学
• 研究代表者: 庄田 勝俊 京都府立医科大学, 医学部附属病院, 研究員 (70783421)
• 研究期間 (年度): 2016-08-26 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円); 2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: 環状RNA / びまん性胃癌 / 胃癌 / びまん性 / 遊離RNA / Liquid biopsy / Gastric Cancer

研究成果の概要

近年、次世代シークエンサー解析など新たな核酸解析手法の開発により、数百もの環状RNAがヒトで発現し生理的・病態生理的に機能している事が確認されるとともに、その生成機構の一端が報告され、更なる環状RNAの探索と機能解析が癌領域でも注目を集めている。
我々は、びまん性胃がんに特異的に発現する環状RNAを同定するため、癌部・非癌部RNAを抽出し、網羅的解析により環状RNA発現の比較検討を行った。びまん性胃がんでは環状RNAは正常組織と比較し有意に低下しており、癌関連micro RNAのスポンジとして機能している可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Detection of fusion gene in cell-free DNA of a gastric synovial sarcoma. (2018)
  • 著者名/発表者名: Ogino S, Konishi H, Ichikawa D, Hamada J, Shoda K, Arita T, Komatsu S, Shiozaki A, Okamoto K, Yamazaki S, Yasukawa S, Konishi E, Otsuji E.
  • 雑誌名: World J Gastroenterol. 巻: 24 号: 8 ページ: 949-956
  • DOI: 10.3748/wjg.v24.i8.949
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Construction of a combinatorial pipeline using two somatic variant calling methods for whole exome sequence data of gastric cancer (2017)
  • 著者名/発表者名: Kohmoto T, Masuda K, Naruto T, Tange S, Shoda K, Hamada J, Saito M, Ichikawa D, Tajima A, Otsuji E, Imoto I.
  • 雑誌名: The Journal of Medical Investigation 巻: 64 号: 3.4 ページ: 233-240
  • DOI: 10.2152/jmi.64.233
  • NAID: 130006105184
  • ISSN: 1343-1420, 1349-6867
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clinical utility of circulating cell-free Epstein-Barr virus DNA in patients with gastric cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shoda K, Ichikawa D, Fujita Y, Masuda K, Hiramoto H, Hamada J, Arita T, Konishi H, Kosuga T, Komatsu S, Shiozaki A, Okamoto K, Imoto I, Otsuji E.
  • 雑誌名: Oncotarget. 巻: 8 ページ: 28796-28804
  • NAID: 120006306639
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Monitoring the HER2 copy number status in circulating tumor DNA by droplet digital PCR in patients with gastric cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shoda K, Ichikawa D, Fujita Y, Masuda K, Hiramoto H, Hamada J, Arita T, Konishi H, Komatsu S, Shiozaki A, Kakihara N, Okamoto K, Taniguchi H, Imoto I, Otsuji E.
  • 雑誌名: Gastric Cancer 巻: 1 号: 1 ページ: 126-135
  • DOI: 10.1007/s10120-016-0599-z
  • NAID: 40021062596
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Clinical utility of circulating cell-free Epstein-Barr virus DNA in patients with gastric cancer. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shoda K, Ichikawa D, Fujita Y, Masuda K, Hiramoto H, Hamada J, Arita T, Konishi H, Kosuga T, Komatsu S, Shiozaki A, Okamoto K, Imoto I, Otsuji E.
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 17 号: 17 ページ: 28796-28804
  • DOI: 10.18632/oncotarget.15675
  • NAID: 120006306639
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Early thrombomodulin-α administration outcome for acute disseminated intravascular coagulopathy in gastrointestinal surgery. (2017)
  • 著者名/発表者名: Konishi H, Okamoto K, Shoda K, Arita T, Kosuga T, Morimura R, Komatsu S, Murayama Y, Shiozaki A, Kuriu Y, Ikoma H, Nakanishi M, Ichikawa D, Fujiwara H, Otsuji E
  • 雑誌名: World J Gastroenterol. 巻: 23 号: 5 ページ: 891-898
  • DOI: 10.3748/wjg.v23.i5.891
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Risk Stratification According to the Total Number of Factors That Meet the Indication Criteria for Radical Lymph Node Dissection in Patients with Early Gastric Cancer at Risk for Lymph Node Metastasis (2016)
  • 著者名/発表者名: Shoda K, Ichikawa D, Arita T, Kosuga T, Konishi H, Morimura R, Murayama Y, Komatsu S, Shiozaki A, Kuriu Y, Ikoma H, Nakanishi M, Fujiwara H, Okamoto K, Otsuji E
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: Suppl 5 ページ: 792-797
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Tumor exosome-mediated promotion of adhesion to mesothelial cells in gastric cancer cells (2016)
  • 著者名/発表者名: Tomohito Arita, Daisuke Ichikawa, Hirotaka Konishi, Shuhei Komatsu, Atsushi Shiozaki, Shinpei Ogino, Yuji Fujita, Hidekazu Hiramoto, Junichi Hamada, Katsutoshi Shoda, Toshiyuki Kosuga, Hitoshi Fujiwara, Kazuma Okamoto, Eigo Otsuji
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 7(35) 号: 35 ページ: 56855-56863
  • DOI: 10.18632/oncotarget.10869
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり