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テンサイ細胞質雄性不稔性における翻訳後制御過程の研究

研究課題

研究課題/領域番号 16J01146
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 遺伝育種科学
研究機関北海道大学

研究代表者

荒河 匠  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2016-04-22 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2018年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2017年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2016年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード細胞質雄性不稔性 / ミトコンドリア / 分子進化 / 植物ミトコンドリア / 稔性回復遺伝子 / タンパク質間相互作用 / 遺伝子進化
研究実績の概要

本年度は、テンサイ細胞質雄性不稔性(CMS)の翻訳後制御に関する課題のうち、稔性回復遺伝子Rf1の複対立性を利用した解析と分子進化学的な解析を行った。
①多様なRf1対立遺伝子の機能解析
分子構造および作用力の異なる優性Rf1を特徴づけたところ、Rf1の作用力は、CMS関連ミトコンドリア遺伝子preSatp6と翻訳後相互作用する遺伝子コピーのmRNAと正に相関した。さらに、CMS株固有に見られるpreSATP6ホモオリゴマーはRf1保持株において減少し、その減少量は相互作用コピーのmRNAと正に相関した。一方で構造の異なる劣性rf1を調査すると、コードされるコピーはpreSatp6と相互作用しなかった。これらの事実に基づき、相互作用コピーの有無により稔性回復アレルを判別するDNAマーカーの開発に成功した。
②Rf1の分子進化学的解析
系統解析及びシンテニー解析を行ったところ、Rf1は属レベルの系統特異的な重複によって生じたことが示唆された。 次に、Oma1オーソログとRf1の機能を比較した。形質転換カルスを用いた調査によれば、テンサイ及びシロイヌナズナOma1オーソログはいずれもpreSATP6とは相互作用しない。発現解析を行うと、Oma1オーソログは全身で発現するが、Rf1は雄性器官特異的に発現していた。未成熟葯におけるmRNAの発現動態を調べたところ、シロイヌナズナOma1の発現パターンに対し、テンサイではOma1オーソログとRf1が相補的に発現していた。
これらのことから、Rf1の進化に遺伝子重複と機能分化が関わること、およびパラログであるRf1は花粉形成過程においてオーソログの機能を相補していると考えられた。したがって、Rf1が稔性回復以外の機能を保持する可能性が示唆された。今後、Rf1進化に核-細胞質の共進化や中立的な側面がどのように関与したか明らかにする必要がある。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 6件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] A fertility-restoring genotype of beet (Beta vulgaris L.) is composed of a weak restorer-of-fertility gene and a modifier gene tightly linked to the Rf1 locus2018

    • 著者名/発表者名
      Arakawa Takumi、Uchiyama Daisuke、Ohgami Takashi、Ohgami Ryo、Murata Tomoki、Honma Yujiro、Hamada Hiroyuki、Kuroda Yosuke、Taguchi Kazunori、Kitazaki Kazuyoshi、Kubo Tomohiko
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 13 号: 6 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0198409

    • NAID

      120006471032

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification and characterization of a semi-dominant restorer-of-fertility 1 allele in sugar beet (Beta vulgaris)2018

    • 著者名/発表者名
      Arakawa Takumi、Ue Sachiyo、Sano Chihiro、Matsunaga Muneyuki、Kagami Hiroyo、Yoshida Yu、Kuroda Yosuke、Taguchi Kazunori、Kitazaki Kazuyoshi、Kubo Tomohiko
    • 雑誌名

      Theoretical and Applied Genetics

      巻: 132 号: 1 ページ: 227-240

    • DOI

      10.1007/s00122-018-3211-6

    • NAID

      120006776811

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient callus formation and plant regeneration are heritable characters in sugar beet (Beta vulgaris L.)2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroyo Kagami, Kazunori Taguchi, Takumi Arakawa, Yosuke Kuroda, Hideto Tamagake and Tomohiko Kubo
    • 雑誌名

      Hereditas

      巻: 153 号: 1

    • DOI

      10.1186/s41065-016-0015-z

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] テンサイCMSの花粉稔性にはpreSATP6複合体の蓄積量が相関する2018

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 上 幸代, 佐野 千紘, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 北﨑 一義, 久保 友彦
    • 学会等名
      第134回日本育種学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 花粉稔性回復遺伝子の分子進化過程は核-ミトコンドリアコンフリクト仮説に符合するか2018

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • 学会等名
      第2回日本共生生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Molecular interaction of cytoplasmic male sterility in sugar beet2018

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Rika Yui-Kurino, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami, Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      76th The International Institute of Sugar Beet Research (IIRB) Congress
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular basis of nuclear-mitochondrial interaction in cytoplasmic male sterility in sugar beet2018

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Rika Yui-Kurino, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami, Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      25th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化的側面2018

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • 学会等名
      日本育種学会第133回講演会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化には遺伝子重複と機能分化が関わる2018

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Post-translational mechanisms in repression of male sterility-associated mitochondrial gene in sugar beet (Beta vulgaris)2017

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      10th International Conference on Plant Mitochondrial Biology
    • 発表場所
      浙江大学(杭州市・中国)
    • 年月日
      2017-05-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] テンサイRf1の不完全優性対立遺伝子存在下におけるpreSATP6タンパク質複合体の挙動2017

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 上 幸代, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 久保 友彦
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2017-03-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 染色体組換えにより生じたテンサイ新規Rf1アレルの特徴づけ2017

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 大神 貴史, 内山 大輔, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • 学会等名
      日本育種学会第132回講演会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] テンサイ花粉稔性回復遺伝子Rf1の進化過程2017

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 勝山 嵩也, 菅谷 元, 本間 雄二朗, 佐野 千紘, 久保 友彦
    • 学会等名
      第40回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Post-translational mechanisms in repression of male sterility-associated mitochondrial gene in sugar beet (Beta vulgaris)2017

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      The 10th International Conference of Plant Mitochondrial Biology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] テンサイ稔性回復遺伝子Rf1における不完全優性を示す対立遺伝子の同定2016

    • 著者名/発表者名
      上 幸代, 荒河 匠, 鏡 豊代, 吉田 有宇, 久保 友彦
    • 学会等名
      日本育種学会・日本作物学会北海道談話会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-12-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] テンサイ花粉不稔に関わるミトコンドリアタンパク質preSATP6の機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 松永 宗幸, 北﨑 一義 , 久保 友彦
    • 学会等名
      第39回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] テンサイ細胞質雄性不稔性に関わるpreSATP6タンパク質複合体の機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      荒河 匠, 松永 宗幸, 北﨑 一義 , 久保 友彦
    • 学会等名
      日本育種学会第130回講演会
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • 年月日
      2016-10-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Post-translational regulation in nuclear-mitochondrial interaction of cytoplasmic male sterility in sugar beet2016

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Muneyuki Matsunaga, Hiroaki Matsuhira, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
    • 発表場所
      京都府立大学(京都府・京都市)
    • 年月日
      2016-09-13
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Post-translational mechanism is associated with sex determination in sugar beet plant2016

    • 著者名/発表者名
      Takumi Arakawa, Kazuyoshi Kitazaki, Rika Yui-Kurino, Tetsuo Mikami and Tomohiko Kubo
    • 学会等名
      Agriculture biodiversity conference 2016
    • 発表場所
      北海道大学(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2016-08-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 遺伝子制御HPトップ - 北海道大学 農学部

    • URL

      http://lab.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 北海道大学遺伝子制御学研究室のHP

    • URL

      http://www.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 北海道大学遺伝子制御学研究室ホームページ

    • URL

      http://www.agr.hokudai.ac.jp/ikushu/gelab/

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2016-05-17   更新日: 2024-03-26  

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