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次世代型ゲノム編集技術CRISPR/Cas9を用いた低分子量タンパク質の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16J09337
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 実験動物学
研究機関山梨大学

研究代表者

泰松 清人  山梨大学, 大学院総合研究部, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2016-04-22 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2017年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードゼブラフィッシュ / ゲノム編集 / CRISPR/Cas9 / ノックイン / 低分子量タンパク質
研究実績の概要

CRISPR/Cas9による座位特異的ノックインにより、標的遺伝子座位にレポーター遺伝子をノックインし、標的遺伝子の発現をモニターしつつ、ホモ接合体を作製し変異体の表現型を観察することが本来の本研究の目的であった。しかし、レポーター遺伝子のノックインはF0世代では成功したものの、F1世代を得ることは出来なかった。そのため、当該年度より、ノックイン系統作成の過程で得られたcart like遺伝子およびslurp-like遺伝子の変異体系統の表現型解析を行っていた。
これらの標的遺伝子とそのファミリー遺伝子をクローニングし、その発現をwhole mount in situ hybridization法により各発生段階において検出した。また、プラスチック切片の作製により発現部位を詳細に明らかにした。これらの遺伝子の進化系統樹を作成し、その保存性と機能ドメイン・発現部位について考察した。これらの変異体系統の表現型解析および標的遺伝子の発現解析の成果を、Spatiotemporal expression of the cocaine- and amphetamine-regulated transcript-like (cart-like) gene during zebrafish embryogenesis., Gene Expr Patterns.,2018およびDevelopmental expression of slurp-like1 and slurp-like2 during zebrafish early embryogenesis., Gene Expr Patterns.,2018として発表した。これらの標的遺伝子は未解析遺伝子であるため、発表論文が未解析の低分子量タンパク質の機能解析の進展の一助になることを願っている。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 5件、 招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Spatiotemporal expression of the cocaine- and amphetamine-regurated transcript-like (cart-like) gene during zebrafish embryogenesis2018

    • 著者名/発表者名
      Kawahara A, Morita H, Yanagi K, Suzuki H, Mori T, Ohga R, Taimatsu K
    • 雑誌名

      Gene Expression Patterns

      巻: 30 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1016/j.gep.2018.08.002

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Developmental expression of the slurp-like1/ly2.3/ly97.3 and slurp-like2/ly2.2/ly97.2 genes during zebrafish early embryogenesis2018

    • 著者名/発表者名
      Kawahara A, Morita H, Yanagi K, Ishizuka T, Taimatsu K, Ohga R
    • 雑誌名

      Gene Expression Patterns

      巻: 30 ページ: 32-36

    • DOI

      10.1016/j.gep.2018.08.006

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional visualization and disruption of targeted genes using CRISPR/Cas9-mediated eGFP reporter integration in zebrafish2016

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ota *, Kiyohito Taimatsu *, Kanoko Yanagi, Tomohiro Namiki, Rie Ohga, Shin-ichi Higashijima, Atsuo Kawahara *These authors contributed equally to this work
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 34991-34991

    • DOI

      10.1038/srep34991

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] CRISPR/Cas9-mediated eGFP reporter integration into zebrafish genome for functional visualization and disruption of target genes (oral)2017

    • 著者名/発表者名
      Kiyohito Taimatsu, Satoshi Ota, Shin-ichi Higashijima, Atsuo Kawahara
    • 学会等名
      ZEBRAFISH DISEASE MODELS SOCIETY ANNUAL MEETING
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional visualization and disruption of target genes by CRISPR/Cas9-mediated eGFP reporter integration into zebrafish genome (poster)2017

    • 著者名/発表者名
      Kiyohito Taimatsu
    • 学会等名
      ZEBRAFISH DISEASE MODELS SOCIETY ANNUAL MEETING
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] CRISPR/Cas9-mediated eGFP reporter integration into zebrafish genome for functional visualization and disruption of target genes (oral)2017

    • 著者名/発表者名
      Kiyohito Taimatsu, Satoshi Ota, Shin-ichi Higashijima, Atsuo Kawahara
    • 学会等名
      JAPANESE SOCIETY of DEVELOPMENTAL BIOLOGISTS ANNUAL MEETING
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional visualization and disruption of targeted genes using the CRISPR/Cas9-mediated eGFP reporter integration in zebrafish2016

    • 著者名/発表者名
      Kiyohito Taimatsu, Satoshi Ota, Kanoko Yanagi, Tomohiro Namiki, Rie Ohga, Shin-ichi Higashijima, Atsuo Kawahara
    • 学会等名
      The 22nd Japanese medaka and zebrafish meeting
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional disruption of uncharacterized small protein genes using the CRISPR/Cas92016

    • 著者名/発表者名
      Kanoko Yanagi, Tomohiro Namiki, Rie Ohga, Kiyohito Taimatsu, Atsuo Kawahara
    • 学会等名
      The 22nd Japanese medaka and zebrafish meeting
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] Exogenous gene integration mediated by genome editing technologies in zebrafish2017

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Morita, Kiyohito Taimatsu, Kanoko Yanagi, Atsuo Kawahara
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      Bioengineered
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 山梨大学 医学部 医学教育センター 発生生物学

    • URL

      http://www.med.yamanashi.ac.jp/medicine/devbio/home.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-05-17   更新日: 2024-03-26  

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