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ペプチド核酸を利用した転写因子関連タンパク質の新規解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 16K05825
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 分析化学
研究機関東京工科大学

研究代表者

須磨岡 淳  東京工科大学, 工学部, 教授 (10280934)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード転写因子 / ペプチド核酸 / DNA / 核酸 / セリウム / DNA切断
研究成果の概要

これまでに、ペプチド核酸(PNA)を用いて,長鎖DNAから所定DNA断片を切り出す技術,多くのDNA断片から目的DNA断片を精製する技術を開発してきた。本研究では,これら技術を融合し,DNAの特定部位に結合する転写因子関連タンパク質を分析する新たな手法の開発をめざし研究を進めた。その結果,PNAと一本鎖DNAを特異的に切断する酵素を用いて調製したDNA断片を単離精製することに成功した。また,人工酵素系として従来用いていたセリウム(IV)ーエチレンジアミン四酢酸系では,DNA切断活性が不十分であることが明らかとなってきた。触媒系を探索したところ,酸化セリウムナノ粒子が有望であることを見出した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ゲノムDNAの情報がRNAに転写される際には,DNAと結合する転写に関わるタンパク質群(転写因子関連タンパク質)が複雑に相互作用をしている。また,転写の異常はがんや多くの疾患とその病態に深く関わっていることが知られている。したがって,転写に関わる因子を詳細に調べる手法の開発は非常に重要である。本研究で見出されたDNAの特定部位をゲノムDNAから分離精製する技術は,DNAの特定部位と相互作用しているタンパク質を解析する新規手法への応用が期待される。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Affinity Isolation of Defined Genomic Fragments Cleaved by Nuclease S1-based Artificial Restriction DNA Cutter2019

    • 著者名/発表者名
      Arivazhagan Rajendran, Narumi Shigi, Jun Sumaoka, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry

      巻: 76 号: 1

    • DOI

      10.1002/cpnc.76

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Artificial Restriction DNA Cutter Using Nuclease S1 for Site‐Selective Scission of Genomic DNA2019

    • 著者名/発表者名
      Arivazhagan Rajendran, Narumi Shigi, Jun Sumaoka, Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry

      巻: 76 号: 1

    • DOI

      10.1002/cpnc.72

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] One-pot Isolation of Desired Human Genome Fragment by Using Biotinylated pcPNA/S1 Nuclease Combination2018

    • 著者名/発表者名
      Arivazhagan Rajendran, Narumi Shigi, Jun Sumaoka, and Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 57 号: 20 ページ: 2908-2912

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00202

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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