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X染色体再活性化の空間的・経時的解析を通したエピジェネティクス制御開始機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K07244
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関筑波大学

研究代表者

西村 健  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (80500610)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードiPS細胞 / X染色体 / エピジェネティクス / SNP / 再活性化 / 3S reprogramming system
研究成果の概要

メスの体細胞を初期化してiPS細胞を誘導する際、不活化されていたX染色体からの転写の再開(再活性化)が起きるが、多能性が低いiPS細胞では再活性化が不十分であるという報告がある。そこで我々は、X染色体再活性化開始領域を同定し、それらの情報を元に、多能性が高いiPS細胞の誘導方法を構築することを試みた。その結果、X染色体の活性化状態を定量的に解析できるSNP cDNA typing法の構築に成功し、その方法を用いて、X染色体の再活性化段階の異なるiPS細胞を分離した。そして、それらのiPS細胞におけるRNA転写プロファイルの情報から、X染色体の再活性化開始領域の同定に成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究成果を元に、X染色体の再活性化を引き起こす分子の同定を始めとして、X染色体再活性化の分子機構解析が進むと考えられる。そしてその知見を生かして、iPS細胞誘導時にX染色体再活性化を効率良く引き起こすことが可能になり、最終的に、高い多能性を獲得した高品質iPS細胞を効率良く誘導する方法の確立につながることが期待される。このような技術は、iPS細胞を用いた再生医療の実用化に大きく貢献すると考えられることから、大きな学術的、社会的意義があると思われる。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 5件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Live-cell imaging of subcellular structures for quantitative evaluation of pluripotent stem cells2019

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Ken、Ishiwata Hiroshi、Sakuragi Yuta、Hayashi Yohei、Fukuda Aya、Hisatake Koji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 1777-1777

    • DOI

      10.1038/s41598-018-37779-x

    • NAID

      120007128201

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Tcl1による代謝リプログラミングがiPS細胞誘導を促進する2018

    • 著者名/発表者名
      西村健、久武幸司
    • 雑誌名

      医学のあゆみ

      巻: 265 ページ: 293-294

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Live cell imaging of X chromosome reactivation during somatic cell reprogramming2018

    • 著者名/発表者名
      Tran Thi Hai Yen、Fukuda Aya、Aizawa Shiho、Bui Phuong Linh、Hayashi Yohei、Nishimura Ken、Hisatake Koji
    • 雑誌名

      Biochemistry and Biophysics Reports

      巻: 15 ページ: 86-92

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2018.07.007

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Time-course transcriptome analysis of human cellular reprogramming from multiple cell types reveals the drastic change occurs between the mid phase and the late phase2018

    • 著者名/発表者名
      Kuno Akihiro、Nishimura Ken、Takahashi Satoru
    • 雑誌名

      BMC Genetics

      巻: 19 号: 1 ページ: 9-9

    • DOI

      10.1186/s12864-017-4389-8

    • NAID

      120007134583

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simple and effective generation of transgene-free induced pluripotent stem cells using an auto-erasable Sendai virus vector responding to microRNA-3022017

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Ken、Ohtaka Manami、Takada Hitomi、Kurisaki Akira、Tran Nhi Vo Kieu、Tran Yen Thi Hai、Hisatake Koji、Sano Masayuki、Nakanishi Mahito
    • 雑誌名

      Stem Cell Research

      巻: 23 ページ: 13-19

    • DOI

      10.1016/j.scr.2017.06.011

    • NAID

      120007134806

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A role for KLF4 in promoting the metabolic shift via TCL1 during induced pluripotent stem cell generation.2017

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Aizawa S, Nugroho FL, Shiomitsu E, Tran YTH, Bui PL, Borisova E, Sakuragi Y, Takada H, Kurisaki A, Hayashi Y, Fukuda A, Nakanishi M, Hisatake K
    • 雑誌名

      Stem Cell Reports

      巻: 8 号: 3 ページ: 787-801

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2017.01.026

    • NAID

      120007129229

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Quantitative Assessment of Pluripotent Stem Cells by an Improved RM-DIC Imaging System2018

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Ishiwata H, Sakuragi Y, Hayashi Y, Fukuda A, Hisatake K
    • 学会等名
      2018 TERMIS World Congress
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] KLF4-dose dependent metabolic shift through TCL1 during iPSC generation2018

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Kumar BA, Hayashi Y, Fukuda A, Hisatake K
    • 学会等名
      ISSCR2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Mechanistic analysis of the initiation of retroviral gene silencing by reprogramming factors2018

    • 著者名/発表者名
      Bui PL、Nishimura K、Hisatake K
    • 学会等名
      The Exploring identity: lessons from genomes and epigenomes meeting
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] X染色体の再活性化をモデルとしたエピジェネティクス転写制御機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      相澤志穂、Bui PL、西村健、久武幸司
    • 学会等名
      超異分野学会2018
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] iPS細胞誘導機構解明のためのX染色体再活性化状態定量システムの開発2017

    • 著者名/発表者名
      相澤志穂、Bui PL、西村健、久武幸司
    • 学会等名
      第16回日本再生医療学会
    • 発表場所
      仙台国際センター・宮城県・仙台市
    • 年月日
      2017-03-06
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Mechanistic analysis of the initiation of retroviral gene silencing by reprogramming factors2017

    • 著者名/発表者名
      Bui PL, Nishimura K, Hisatake K
    • 学会等名
      The 6th Human Biology Symposium
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] iPS細胞誘導におけるX染色体再活性化機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      相澤志穂、Bui PL、西村健、久武幸司
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] iPS細胞誘導におけるX染色体再活性化を定量化する方法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      相澤志穂、Bui PL、西村健、久武幸司
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜・神奈川県・横浜市
    • 年月日
      2016-12-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] A quantitative method for analysis of X chromosome reactivation in iPSC production2016

    • 著者名/発表者名
      Aizawa S, Bui PL, Nishimura K, Hisatake K
    • 学会等名
      The 5th Human Biology Symposium
    • 発表場所
      つくば国際会議場・茨城県・つくば市
    • 年月日
      2016-09-18
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] iPS 細胞の品質管理を迅速かつ簡便に行える顕微鏡システムの開発

    • URL

      http://www.tsukuba.ac.jp/attention-research/p201902121500.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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