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小分子RNAをガイド鎖とするDNAサイレンシング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K07246
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関松本歯科大学 (2017-2018)
新潟大学 (2016)

研究代表者

三好 智博  松本歯科大学, 歯学部, 講師 (60534550)

研究分担者 伊東 孝祐  新潟大学, 自然科学系, 助教 (20502397)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードArgonaute / small RNA / DNAサイレンシング / ウイルス / Rhodobacter sphaeroides / RNA / DNA / サイレンシング / 小分子RNA
研究成果の概要

Rhodobacter sphaeroidesのArgonaute(RsAgo)は、小分子RNAをガイド鎖としてターゲットDNAに配列特異的に結合する機能を持つ。RsAgoは、新たな遺伝子解析技術の開発に関与する重要なタンパク質であり、本研究では、RsAgoの(1)ガイド鎖の選択メカニズム、(2)各ドメイン構造が核酸認識・機能に与える影響、(3)DNAサイレンシングの機能的役割、に関して新しい成果が得られた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

現在治療が困難である難治性疾患に対して、その原因遺伝子の発現を抑制することで根治治療となり得るのではないかと期待されている。すなわち、RNA-guided DNA interferenceは、小分子RNAにより配列依存的に希望する分子の細胞内での遺伝子発現を特異的に抑制する方法であり、その効果を持つ小分子RNA自体は開発が容易なため究極のテーラーメイド医薬として期待できる。本研究で得られる結果は、RNA干渉では不可能である「塩基配列特異的なDNAサイレンシング機構」の応用によるテーラーメイド医薬の開発を進める上で特に重要なものである。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] The ribosomal stalk protein is crucial for the action of the conserved ATPase ABCE12018

    • 著者名/発表者名
      Imai, H., Abe, T., Miyoshi, T., Nishikawa, S., Ito, K., and Uchiumi, T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 46 号: 15 ページ: 7820-7830

    • DOI

      10.1093/nar/gky619

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The interaction between the ribosomal stalk proteins and translation initiation factor 5B promotes translation initiation2018

    • 著者名/発表者名
      Murakami, R., Singh, C.R., Morris, J., Tang, L., Harmon, I., Azuma, T., Miyoshi, T., Ito, K., Asano, K., and Uchiumi T.
    • 雑誌名

      Mol. Cell Biol.

      巻: 38 号: 16

    • DOI

      10.1128/mcb.00067-18

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nucleic Acid-Binding Assay of Argonaute Protein Using Fluorescence Polarization.2018

    • 著者名/発表者名
      Miyoshi T.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: 1680 ページ: 123-129

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-7339-2_8

    • ISBN
      9781493973385, 9781493973392
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Binding of translation elongation factors to individual copies of the archaeal ribosomal stalk protein aP1 assembled onto aP0.2017

    • 著者名/発表者名
      Honda, T., Imai, H., Suzuki, T., Miyoshi, T, Ito K, Uchiumi T.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 483 号: 1 ページ: 153-158

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.12.175

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the recognition of guide RNA and target DNA heteroduplex by Argonaute.2016

    • 著者名/発表者名
      Miyoshi, T., Ito, K., Murakami, R., Uchiumi T.
    • 雑誌名

      Nature Commun.

      巻: 7 号: 1 ページ: 11846-11846

    • DOI

      10.1038/ncomms11846

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of translation initiation factor 5B from the crenarchaeon Aeropyrum pernix.2016

    • 著者名/発表者名
      Murakami R, Miyoshi T, Uchiumi T, Ito K.
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: in press 号: 5 ページ: 712-717

    • DOI

      10.1002/prot.25009

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] バクテリアの新たな自己防衛システム2018

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      第71回日本細菌学会関西支部総会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成細菌で明らかとなったDNAサイレンシング機構2017

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      第2回光合成細菌ワークショップ
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] リボソームタンパク質aP1による翻訳ATPase因子の認識機構2017

    • 著者名/発表者名
      今井 大達、阿部 高也、三好 智博、伊東 孝祐、内海 利男
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌ArgonauteのRNA-guided DNA interference2017

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      第11回細菌学若手コロッセウム
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Archaeal ribosomal stalk protein aP1 directly binds to the ribosome-recycling factor aABCE1, and promotes ribosome-dependent ATP hydrolysis2017

    • 著者名/発表者名
      Imai H, Abe T, Miyoshi T, Ito K and Uchiumi T
    • 学会等名
      EMBL Meeting
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 微生物におけるArgonauteの新機能2017

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      第5回五大学微生物研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Argonauteタンパク質の新規構造基盤の解明2017

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      第1回オーラルサイエンス研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 翻訳リサイクル因子ABCE1-リボソームストーク間相互作用とその役割2017

    • 著者名/発表者名
      今井 大達、阿部 高也、三好 智博、伊東 孝祐、内海 利男
    • 学会等名
      第40回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌で見つかった「RNAをガイド鎖とするDNAサイレンシング機構」の構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      三好智博
    • 学会等名
      岩手医科大学 構造生物薬学セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 環状ペプチドRA-VIIはEF-2・GTP複合体構造を固定化する2016

    • 著者名/発表者名
      三好智博、片貝勇人、下出朗誠、竹谷孝一、八森章、内海利男
    • 学会等名
      第4回 Ribosome Meeting
    • 発表場所
      大阪医科大学
    • 年月日
      2016-09-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] A possible mechanism for small RNA processing by R. sphaeroides Argonaute2016

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Ryo Murakami and Toshio Uchiumi
    • 学会等名
      RNA 2016
    • 発表場所
      The International Conference Center in Kyoto
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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