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沿岸域におけるSkeletonema属珪藻の群集構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K07508
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生態・環境
研究機関東京海洋大学

研究代表者

片野 俊也  東京海洋大学, 学術研究院, 准教授 (00509820)

研究協力者 山田 真知子  
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2017年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2016年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード珪藻赤潮 / Skeletonema / 競争 / 群集組成 / 種組成解析 / 休眠期細胞 / 定量PCR / 季節変化 / 種間競争 / 珪藻 / Skeletonema属 / PCR / 種遷移 / Skeletonema属珪藻 / 種組成 / リアルタイムPCR / マルチプレックスPCR / FISH法
研究成果の概要

Skeletonema属10種について定量PCRとマルチプレックスPCRのためのプライマーセットを開発した。これらを用いて、種組成の解析、を進めた。その結果、有明海、東京湾ともに、淡水産種S. potamosを含む6種以上のSkeletonema属が検出された。流入河川感潮域底泥には多くのSkeletonema属が存在していて、大雨による出水後には底泥がSkeletonema属による赤潮のタネ場として機能する可能性が示唆された。冬季に出現するS. japonicumとS. marinoi-dohrnii complexの競争は環境条件でなく、殻径によって勝者が替わりうることを実験的に示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

珪藻Skeletonema属は、世界中の多くの内湾に出現し、とりわけ富栄養な水域で優占することが知られている。東京湾とアメリカのナラガンセット湾ではどちらも植物プランクトンの90%以上が、Skeletonemaとされる。2005、2007年のSarnoらの発表によりS. costatumは、8種にも分類された。この新しい分類体系に基づく種同定は、単離と単離株の種同定に依存し多大な労力と時間を要していたが、本研究で開発されたプライマーセットにより迅速な種判別および定量解析が可能になった。世界の内湾で季節を問わず赤潮を起こすSkeletonemaの動態について今後大きく研究が進むことが期待される。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Development of primer sets for a multiplex and a qPCR assays targeting Skeletonema species and its application to field samples2019

    • 著者名/発表者名
      1.Enjoji, N. Katano, T., Yoshinaka, Y., Furuoka, F., Ando, Y., Yamada, M., Hamasaki, T., Miyamura, E., Otsubo, M., Yokoyama, K.
    • 雑誌名

      Journal of Oceanography

      巻: in press 号: 4 ページ: 319-334

    • DOI

      10.1007/s10872-018-00504-3

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of cell size on growth rates of two Skeletonema species and their competitive interactions2018

    • 著者名/発表者名
      Ando, Y. Katano, T.
    • 雑誌名

      Journal of Phycology

      巻: 54 号: 6 ページ: 850-859

    • DOI

      10.1111/jpy.12782

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 東京湾における珪藻Skeletonema属のPCR法による出現種解析2018

    • 著者名/発表者名
      吉中祐紀,片野俊也
    • 学会等名
      日本プランクトン・ベントス合同大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 東京湾の底泥中における珪藻Skeletonema属の qPCR による定量解析2018

    • 著者名/発表者名
      古岡鳳夏,片野俊也
    • 学会等名
      日本プランクトン・ベントス合同大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 河川感潮域から河口域における底泥堆積物と水柱のSkeletonema属珪藻の種組成解析2018

    • 著者名/発表者名
      片野俊也、円城寺夏実、山田真知子、大坪繭子、中島有紀子、横山勝英、吉野健児
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2018年大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 東京湾におけるSkeletonema属珪藻のPCR法による出現種解析2017

    • 著者名/発表者名
      吉中 祐紀、小林あずさ、円城寺夏実、片野俊也
    • 学会等名
      海洋学会 海洋生物学研究会シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2017-03-21
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞サイズの減少ー回復過程が珪藻の増殖速度と競争の結果に及ぼす影響2017

    • 著者名/発表者名
      安東祐太朗、片野俊也
    • 学会等名
      日本プランクトン学会ベントス学会合同大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of multiplex and real-time PCR assays for the detection and quantification of Skeletonema species2017

    • 著者名/発表者名
      T Katano, N Enjoji, Y Yoshinaka, F Furuoka, Y Ando, M Yamada, M Otsubo, K Yokoyama
    • 学会等名
      10th EASTHAB Symposium
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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