| 研究課題/領域番号 |
16K07683
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
応用微生物学
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| 研究機関 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
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研究代表者 |
木村 啓太郎 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 食品研究部門, ユニット長 (20353980)
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| 研究協力者 |
吉川 博文
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2018年度)
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| 配分額 *注記 |
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2018年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2017年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | 挿入配列 / ゲノム進化 / 納豆菌 / 転移 / 遺伝子破壊 / insertion sequnce / transposition / IS256Bsu1 / insertion sequence / 発現制御 / Bacillus subtilis / transposase / trasposition frequency / トランスポゾン / RNA-seq / Insertion sequence / 微生物 / 発酵 |
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| 研究成果の概要 |
挿入配列（以下，ISとする)は転移酵素遺伝子とその両端の繰り返し配列で構成される“動く遺伝子”である．ISはゲノム中を転移し，転移先遺伝子の破壊や断片化を引き起こすことによってゲノムの構造的進化に影響を与えたと考えられる．本研究は，納豆菌で見つかった複数のISの制御機構解明を目的として行った．
本研究で得られた最も興味深い結果は，ヘリカーゼドメインを持つ遺伝子（BSNT_10618）の破壊によりISの転移頻度が高くなったことである．つまり、BSNT_10618が IS転移を抑制する機能を持つことが示唆された．連携研究先と協力しながら研究を継続中である．
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
挿入配列（以下、IS)の発現制御に関する先行研究として，大腸菌で見つかったIS転移促進タンパク質Ieeが挙げられる．本研究では，Ieeと部分的な類似性を持つ納豆菌BSNT_10618が，むしろ転移を抑制する機能を持つことが明らかになった．納豆菌のように非常に多種多コピーのISを有する株が転移を抑制する仕組みを持つ可能性が強く示唆されたことに学術的意義がある．また，RNS-seq解析（DNA配列解析装置による網羅的な遺伝子発現解析）を通じて，東京農大が開発したIS転移頻度測定法（Jumping CAT法）の再現性と妥当性が確認できたことは科学的に意義深く，継続的な研究深化に繋がる成果である.
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