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ゲノム情報に基づくタイラギの遺伝子攪乱リスクの評価

研究課題

研究課題/領域番号 16K07859
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 水圏生産科学
研究機関国立研究開発法人水産研究・教育機構

研究代表者

關野 正志  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

研究分担者 藤原 篤志  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, 主幹研究員 (30443352)
橋本 和正  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 主任研究員 (40372007)
佐々木 猛智  東京大学, 総合研究博物館, 准教授 (70313195)
山田 勝雅  熊本大学, くまもと水循環・減災研究教育センター, 特任助教 (80569195)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 / 遺伝子汚染 / 遺伝子移入 / 集団ゲノミクス / タイラギ / 二枚貝 / 保全遺伝学 / 分子生態学 / 遺伝的多様性保全 / RAD / 分類学 / ゲノム / 遺伝学
研究成果の概要

大型二枚貝のタイラギは,貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域(瀬戸内海)では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と,それに続く遺伝子浸透(雑種F1を介した種間の遺伝子交換)により生じていると考えられるが,十分な検証がなされていない。そこで本研究では,核DNAの一塩基多型解析により、有隣型-無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結果、両者が同所的に生息する瀬戸内海では、F1、F2、有隣型への戻し交配個体および無鱗型への戻し交配個体が認められ、少なくとも瀬戸内海においては、交雑と双方向の遺伝子浸透が起こっていることが立証された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本課題により、瀬戸内海産タイラギの有鱗型と無鱗型間で、交雑と双方向の遺伝子浸透(雑種を介した一方の種から他方の種への遺伝子移入)が生じていることが示された。過去のアイソザイム研究では、両者の雑種第一世代F1が生じていることは推測されていたが、本課題では、さらにF2(F1間の子供)や、両種への戻し交配個体(F1-純種間の子供)も生じていることが明らかになった。これらの結果は、タイラギ類の分類学、進化生物学および分子生態学上の学術的価値が高いだけではなく、種苗生産・放流によるタイラギ増殖の遺伝的攪乱リスクの啓蒙と資源保全・増殖戦略の策定のための重要な知見となる。

報告書

(5件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2019 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Morphological variations among distinct genotypes of the pen shell Atrina pectinata in Japan and Korea2019

    • 著者名/発表者名
      Yamada K, Hashimoto K, Sasaki T, Kobayashi M, Henmi Y, Sekino M
    • 雑誌名

      Proceedings of the 2019 CWMD Conference

      巻: 2019 ページ: 808-813

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lineage specific detection of the scaly form of the pen shell Atrina spp. by a loop-mediated isothermal amplification method2018

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto K, Yamada K, Nagae A, Matsuyama Y
    • 雑誌名

      Fisheries Science

      巻: 84 号: 5 ページ: 837-848

    • DOI

      10.1007/s12562-018-1231-4

    • NAID

      40021650855

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genotyping-by-sequencing for construction of a new genetic linkage map and QTL analysis of growth-related traits in Pacific bluefin tuna2018

    • 著者名/発表者名
      Uchino T, Hosoda E, Nakamura Y, Yasuike M, Mekuchi M, Sekino M, Fujiwara A, Sugaya T, Tanaka Y, Kumon K, Agawa Y, Sawada Y, Sano M, Sakamoto T
    • 雑誌名

      Aquaculture Research

      巻: 49 号: 3 ページ: 1293-1301

    • DOI

      10.1111/are.13584

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Survival time of juvenile pen shell Atrina pectinata (Bivalvia: Pinnidae) in hyposaline water2018

    • 著者名/発表者名
      Kurihara T, Nakano S, Matsuyama Y, Hashimoto K, Yamada K, Ito A, Kanematsu M
    • 雑誌名

      International Aquatic Research

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1007/s40071-017-0183-0

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA多型でみるタイラギ二種の違い2017

    • 著者名/発表者名
      關野正志・藤原篤志・橋本和正・山田勝雅・佐々木猛智
    • 雑誌名

      平成28年度中央水産研究所主要成果集「研究のうごき」

      巻: 15 ページ: 13-13

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] DNA親子判別における一塩基多型(SNPs)の 有効性の検証2017

    • 著者名/発表者名
      關野正志, 中道礼一郎・藤原篤志・西木一生・松原和純・岩崎裕貴・鈴木伸明
    • 雑誌名

      水産育種

      巻: 46 ページ: 79-85

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new resource of single nucleotide polymorphisms in the Japanese eel Anguilla japonica derived from restriction site-associated DNA2016

    • 著者名/発表者名
      Masashi Sekino, Reiichiro Nakamichi, Yuki Iwasaki(他5名)
    • 雑誌名

      Ichthyological Research

      巻: 63 号: 4 ページ: 496-504

    • DOI

      10.1007/s10228-016-0518-7

    • NAID

      40020979345

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Morphological variations among distinct genotypes of the pen shell Atrina pectinata in Japan and East Asia2019

    • 著者名/発表者名
      Yamada K, Hashimoto K, Sasaki T, Kobayashi M, Sekino M
    • 学会等名
      2019 International Conference on Climate Change, Disaster Management and Environmental Sustainability
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 香川県海域で初めて記録されたLineage6タイラギ2019

    • 著者名/発表者名
      橋本和正、關野正志、小林真弓、山本昌幸、山田勝雅、逸見泰久、佐々木猛智
    • 学会等名
      令和元年度 日本水産学会秋季大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 有明海におけるタイラギの移植適水域2018

    • 著者名/発表者名
      栗原健夫, 松山幸彦, 橋本和正, 圦本達也, 長副聡, 岡村和麿, 中野昌次, 速水祐一, 山口創一
    • 学会等名
      2018年日本プランクトン学会・ベントス学会合同大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 貧酸素水塊の移入に対するベントス群集の応答:群集形成パターンの評価2018

    • 著者名/発表者名
      4)山田勝雅, 小森田智大, 宮本 康, 石松将武, Wachirah Jaingam, 堤 裕昭, 逸見泰久
    • 学会等名
      日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 汽水域の漁獲ベントスの時空間動態からメタ個体群動態を推定する2017

    • 著者名/発表者名
      山田勝雅
    • 学会等名
      第130回汽水域懇談会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Community structure of benthic infauna in relation to spatial scale resolutions at Midorikawa-River tidal flats of Ariake Bay, Kyusyu, Japan: focusing on nested community structure.2017

    • 著者名/発表者名
      Yamada K, Komorita T, Takenaka R, Morokuma T, Kuroki Y, Uchikawa J
    • 学会等名
      The 3rd Asian Marine Biology Symposium
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] RAD-SNPに基づく有鱗型・無鱗型タイラギ間の遺伝的差異2017

    • 著者名/発表者名
      関野正志・藤原篤志・中村洋路(他9名)
    • 学会等名
      H29度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] タイラギ外套膜から綿棒で採取できるDNA量の推定2017

    • 著者名/発表者名
      橋本和正・中野昌次・山田勝雅(他2名)
    • 学会等名
      H29度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 状態空間モデルによる個体群動態の推定:有明海の二枚貝資源量はなぜ減少したのか?2017

    • 著者名/発表者名
      山田勝雅, 長田穣, 中野善, 岡村和麿
    • 学会等名
      第64回日本生態学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] タイラギ親貝の非破壊的遺伝子型判別手法の開発2017

    • 著者名/発表者名
      橋本和正・永江 彬・中野昌次・山田勝雅・松山幸彦
    • 学会等名
      H29度日本水産学会春季大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Genotype identification of the pen shell Atrina pectinata by using LAMP method2016

    • 著者名/発表者名
      Kazumasa Hashimoto, Katsumasa Yamada, Masashi Sekino, Takenori Sasaki(他4名)
    • 学会等名
      The 7th World Fisheries Congress
    • 発表場所
      韓国、釜山
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Shell morphs-variations among distinct genotypes of the pen shell Atrina pectinata2016

    • 著者名/発表者名
      Katsumasa Yamada, Kazumasa Hashimoto, Masashi Sekino, Takenori Sasaki
    • 学会等名
      The 7th World Fisheries Congress
    • 発表場所
      韓国、釜山
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2021-02-19  

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