| 研究課題/領域番号 |
16K08084
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
統合動物科学
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
谷口 幸雄 京都大学, 農学研究科, 准教授 (10252496)
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| 研究協力者 |
金子 良則
祝前 博明
山田 宜永
池乗 乃智
依田 澄香
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| 研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2018年度)
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| 配分額 *注記 |
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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| キーワード | 希少動物の保全 / 遺伝的多様性 / トキ / マーカー型判定法 / 次世代シークエンサー / マルチプレックスPCR / SNP / マイクロサテライト / ゲノム |
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| 研究成果の概要 |
希少動物トキの国内集団を対象として、遺伝的多様性を評価するための中規模のマーカー型判定法の開発を実施した。5万以上のDNA多型マーカー候補から日本トキ集団に有効な222のマーカーを選抜し、multiplexPCRと次世代シークエンサー(NGS)を組み合わせた方法によりタイピングデータを得た。データの解析結果から、multiplePCR/NGS法によるマーカー型判は実行可能であり、これらのデータを使用し個体識別や親子鑑定が可能であることが示唆された。しかし、より効率的かつ低コストでの判定法を実現するためには、multiplexPCRやNGSライブラリー調製の条件をさらに検討する必要がある。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
日本トキ集団の遺伝的多様性を維持するためには、DNA多型マーカーを利用した遺伝的管理が求められる。200以上のマーカーを判定する今回の新たな手法の樹立は、個体識別や親子判定を可能にするのに加え、集団の遺伝的多様性を維持する交配計画の策定や野外へ再導入する個体の選定にも有用な情報を提供する。
現在、絶滅の危機に瀕している野生生物は多数存在している。我々が実施してきた大規模なDNA多型マーカー開発から本課題での遺伝的多様性評価法樹立までのプロセスは、他の稀少動物にも適用可能であり、希少動物の遺伝的管理を実施するための標準的な手法として極めて有用なものになると期待される。
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