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LAMP法によるヘルペスウイルス感染症のpoint of care test開発

研究課題

研究課題/領域番号 16K08947
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 病態検査学
研究機関藤田医科大学

研究代表者

井平 勝  藤田医科大学, 保健学研究科, 教授 (10290165)

研究分担者 榎本 喜彦  藤田医科大学, 医学研究科, 研究員 (00387713)
杉山 博子  藤田医科大学, 医学研究科, 研究員 (10387714)
東本 祐紀  藤田医科大学, 医療科学部, 助教 (20569701)
吉川 哲史  藤田医科大学, 医学部, 教授 (80288472)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2018年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードLAMP / PSR / Eprobe / HHV-6 / VZV / Point of Care testing / RPA / HDA / HSV / point of care test
研究成果の概要

LAMP法の高感度検出法構築のためRecombinaseとLAMP法の融合による解決(R-LAMP)を着想した。これによるHHV-6 DNAの検出下限は、10コピー/反応であった。ポリメラーゼスパイラル反応(PSR)によるVZV DNA検出では、LAMPよりも高感度な方法を構築出来たが、、No template control(NTC)の濁度上昇が確認された。このために、Eprobeを使用したが、NTCの蛍光強度の増加があった。しかし、NTC増幅とPSRによるVZV増幅は、融解温度分析により識別可能であった。本研究では、LAMP法の感度の改善を行う手法、あらたな等温増幅法を構築した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

サンプルから病原体遺伝子を検出することにより迅速診断することは重要である。近年、本邦で発明された迅速に病原遺伝子増幅するLAMP方法がよく使われるようになった。LAMP法は優れた遺伝子増幅法であるが、感度に優れた検出法を構築するのは経験と時間を要する。これらの問題に対し本研究は、感度に優れたLAMP法を簡易に構築することを目的に他の遺伝子増幅法(RPA法)との組み合わせ、または近年報告されたLAMPとは異なる等温増幅方法(PSR法)による検出法を検討した。これらによって簡易に高感度検出法が構築出来れば、遺伝子診断によるPOCTとして臨床でより広く利用できるの可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 8件)

  • [雑誌論文] Chromosomally integrated human herpesvirus 6 in the Japanese population.2018

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Kawamura Y, Hattori F, Kozawa K, Ihira M, Ohye T, Kurahashi H, Yoshikawa T.
    • 雑誌名

      J Med Virol.

      巻: 90 号: 10 ページ: 1636-1642

    • DOI

      10.1002/jmv.25244

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Late-phase human herpesvirus 6B reactivation in hematopoietic stem cell transplant recipients.2018

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Kawamura Y, Hattori F, Tanaka M, Kudo K, Ihira M, Yatsuya H, Takahashi Y, Kojima S, Yoshikawa T.
    • 雑誌名

      Transpl Infect Dis

      巻: 20(4) 号: 4

    • DOI

      10.1111/tid.12916

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monitoring shedding of five genotypes of RotaTeq vaccine viruses by genotype-specific real-time RT-PCR assays.2018

    • 著者名/発表者名
      RT-PCR assays. Higashimoto Y, Ihira M, Miyazaki Y, Kuboshiki A, Yoshinaga S, Hiramatsu H, Suzuki R, Miyata M, Miura H, Komoto S, Yukitake J, Taniguchi K, Kawamura Y, Yoshikawa T.
    • 雑誌名

      J Clin Microbiol

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 589-596

    • DOI

      10.1128/jcm.00035-18

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evaluating the effectiveness of the universal immunization program against varicella in Japanese children.2017

    • 著者名/発表者名
      Hattori F, Miura H, Sugata K, Yoshikawa A, Ihira M, Yahata Y, Kamiya H, Tanaka-Taya K, Yoshikawa T; Nagoya VZV study group
    • 雑誌名

      Vaccine

      巻: 35 号: 37 ページ: 4936-4941

    • DOI

      10.1016/j.vaccine.2017.07.090

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of real-time RT-PCR assays for detection of three classes of HHV-6A gene transcripts2017

    • 著者名/発表者名
      Ihira M, Urashima A, Miura H, Hattori F, Kawamura Y, Sugata K, Yoshikawa T
    • 雑誌名

      Journal of Medical Virology

      巻: 89 号: 10 ページ: 1830-1836

    • DOI

      10.1002/jmv.24862

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Rotavirus vaccine strain transmission by vaccinated infants in the foster home2017

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Kawamura Y, Sugata K, Koshiyama N, Yoshikawa A, Komoto S, Taniguchi K, Ihira M, Yoshikawa T
    • 雑誌名

      J Med Virol

      巻: 89(1) 号: 1 ページ: 79-84

    • DOI

      10.1002/jmv.24613

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書 2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cycling probe-based real-time PCR for the detection of human herpesvirus 6A and B.2016

    • 著者名/発表者名
      Ihira M, Yamaki A, Kato Y, Higashimoto Y, Kawamura Y, Yoshikawa T.
    • 雑誌名

      J Med Virol.

      巻: Epub ahead of print 号: 9 ページ: 000-000

    • DOI

      10.1002/jmv.24513

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A simple cytogenetic method to detect chromosomally integrated human herpesvirus-6.2016

    • 著者名/発表者名
      Ohye T, et al.
    • 雑誌名

      J Virol Methods

      巻: 228 ページ: 74-78

    • DOI

      10.1016/j.jviromet.2015.11.001

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Breakthrough varicella診断におけるdirect LAMP法の有用性2018

    • 著者名/発表者名
      東本祐紀、河村吉紀、服部文彦、三浦浩樹、西村尚子、尾崎隆男、井平勝、吉川哲史
    • 学会等名
      日本ワクチン学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Molecular epidemiological analysis of rotaviruses obtained from rotavirus-associated encephalitis/encephalopathy patients2018

    • 著者名/発表者名
      M Ihira, Y Kawamura,F hattori, H, Miura, Y. Higashimoto, K. Sugata, S. Komoto, K Taniguchi, T.Yoshikawa
    • 学会等名
      ESCV
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ロタテックワクチン(RV5)接種後の便中ワクチンウイルス株排泄の解析2018

    • 著者名/発表者名
      東本祐紀、井平 勝、三浦浩樹、平松裕、鈴木竜太、河本聡志、谷口孝喜、河村吉紀、吉川哲史第
    • 学会等名
      日本臨床ウイルス学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 5歳以下の発熱児におけるEBVCMVHHV-6AHHV-6BHHV-7感染の証明と臨床像解析2018

    • 著者名/発表者名
      服部文彦、三浦浩樹、河村吉紀、菅田健、小澤 慶、井平 勝、吉川哲史
    • 学会等名
      日本臨床ウイルス学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 健康なiciHHV-6A姉妹例でのHHV-6Bの重感染の証明2018

    • 著者名/発表者名
      三浦浩樹、服部文彦、河村吉紀、菅田健、小澤 慶、井平 勝、吉川哲史
    • 学会等名
      日本臨床ウイルス学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] ロタウイルス脳炎・脳症分離株の分子疫学的解析2018

    • 著者名/発表者名
      井平勝、東本祐紀、平松裕、鈴木竜太、三浦浩樹、服部文彦、河村吉紀、菅田健、河本聡志、谷口孝喜、吉川哲史
    • 学会等名
      臨床ウイルス学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Inherited chromosomally integrated human herpesvirus 6 in the Japanese population2017

    • 著者名/発表者名
      Masaru Ihira,Hiroki Miura, Yoshiki Kawamura, Fumihiko Hattori, Tamae Ohye, Hiroki Kurahashi, Tetsushi Yoshikawa
    • 学会等名
      10th international coference on HHV-6 and HHV-7
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Analysis for rotavirus vaccine virus shedding after RotaTeq vaccination.2017

    • 著者名/発表者名
      Yuki Higashimoto, Masaru Ihira, Ken Sugata, Satoshi Komoto, Koki Taniguchi, Tetsushi Yoshikawa
    • 学会等名
      The 65th Annual Meeting of the Japanese Society for Virology
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The analysis of the origin of chromosomally integrated fuman herpesvirus 62017

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki kawamura Yamae Ohye Hiroki miura Yuri Kato Masaru Ihira Hiroki Kurahashi Ttsushi Yoshikawa
    • 学会等名
      10th international coference on HHV-6 and HHV-7
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Clinical features of primary human herpesvirus 6B infection in a cohort of acute care vistis2017

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Hattori Misa miyake Hiroki Miura Yoshiki Kawamuea Masaru ihira and Tetsushi Yoshikawa
    • 学会等名
      10th international coference on HHV-6 and HHV-7
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 5価ロタウイルスワクチン(RotaTeq○R)に含まれる5種類のワクチン株特異的real-time RT-PCR法の構築2017

    • 著者名/発表者名
      井平 勝、東本 祐紀 、平松裕之 、鈴木竜太 、服部文彦、三浦浩樹、河村吉紀 ,吉川哲史
    • 学会等名
      第58回臨床ウイルス学会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Detection of HHV-6 specific miRNAs in clinical specimens.2016

    • 著者名/発表者名
      Masaru Ihira, Hiroki Miura, Yuki Higashimoto, Fumihiko Hattori,Yoshiki Kawamura, Ken Sugata, Tetsushi Yoshikawa
    • 学会等名
      International Herpesvirus workshop
    • 発表場所
      MADISON WISCONSIN USA
    • 年月日
      2016-07-23
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The Analysis of the Origin of Chromosomally Integrated Human Herpesvirus 6 in the Japanese population.2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki kawamura, Tamae Ohye, yuri kato, Hiroki Miura, Masaru ihira, Hiroki Kurahashi, Tetsushi Yoshikawa,
    • 学会等名
      International Herpesvirus workshop
    • 発表場所
      MADISON WISCONSIN USA
    • 年月日
      2016-07-23
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Late phase Human herpesvirus 6 reactivation in hematopoietic stem cell transplantation.2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Miura, Yoshiki kawamura, Masaru ihira, Tetsushi Yoshikawa.
    • 学会等名
      International Herpesvirus workshop
    • 発表場所
      MADISON WISCONSIN USA
    • 年月日
      2016-07-23
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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