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メンデル遺伝病の補完遺伝子検査システムの構築と遺伝医療における社会実装

研究課題

研究課題/領域番号 16K08980
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 病態検査学
研究機関金沢医科大学

研究代表者

新井田 要  金沢医科大学, 総合医学研究所, 教授 (40293344)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード遺伝子検査学 / 臨床遺伝学 / 遺伝子診断 / 遺伝子変異 / 遺伝子検査 / 体細胞モザイク / スプライシング変異 / CHIPS 法 / COLD PCR法 / MugCap法 / 次世代シーケンサー / CHIPS法 / 遺伝学
研究成果の概要

本邦ではメンデル遺伝性疾患の遺伝子検査は、検査の原価と保険診療報酬との乖離のため検査会社が供給できず、未だに普及していない。また、従来の翻訳領域配列を決定する方法のみでは検出できない遺伝子変異が存在する。本研究では新たにMugCap (Multiple gene competitive amplification)法とLong-PCR based NGS (Next generation sequencing)法を開発し、補完的に組み合わせることでより網羅的な遺伝子検査システムを構築した。開発した方法は検査原価を低く抑えることが可能であり、本検査システムは実臨床で患者に安価に提供されている。

研究成果の学術的意義や社会的意義

新たな遺伝子検査法を開発し、これをアルゴリズムに従って組み合わせることで網羅的かつ補完的な遺伝子検査システムを構築することが出来た。これにより従来は検出不能であった低頻度モザイク変異や、深部イントロン変異によるスプライシング異常、大欠失のbreak pointの同定などが容易となり、遺伝子検査の精度は飛躍的に向上した。本検査システムは金沢医科大学病院ゲノム医療センターで診断目的の遺伝子検査として導入されており、安価に患者に提供されている。多くの遺伝性疾患を持つ患者および家族の遺伝子診断、遺伝カウンセリングに有用であることは勿論、指定難病や小児慢性特定疾患の申請の際にも役立っている。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (16件) (うち査読あり 16件、 オープンアクセス 6件、 謝辞記載あり 6件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件、 招待講演 2件) 図書 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Autopsy case of right ventricular rhabdomyoma in tuberous sclerosis complex2019

    • 著者名/発表者名
      Kondo Takeshi、Niida Yo、Mizuguchi Masashi、Nagasaki Yasushi、Ueno Yasuhiro、Nishimura Akiyoshi
    • 雑誌名

      Legal Medicine

      巻: 36 ページ: 37-40

    • DOI

      10.1016/j.legalmed.2018.10.001

    • NAID

      120006888555

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel PHEX mutation associated with vitamin D-resistant rickets2019

    • 著者名/発表者名
      Sako Saori、Niida Yo、Shima Kosuke Robert、Takeshita Yumie、Ishii Kiyo-aki、Takamura Toshinari
    • 雑誌名

      Human Genome Variation

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-3

    • DOI

      10.1038/s41439-019-0040-3

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Familial multifocal micronodular pneumocyte hyperplasia with a novel splicing mutation in TSC1: Three cases in one family2019

    • 著者名/発表者名
      Shoji Tetsuaki、Konno Satoshi、Niida Yo、Ogi Takahiro、Suzuki Masaru、Shimizu Kaoruko、Hida Yasuhiro、Kaga Kichizo、Seyama Kuniaki、Naka Tomoaki、Matsuno Yoshihiro、Nishimura Masaharu
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 14 号: 2 ページ: 0212370-0212370

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0212370

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Treatment of a glioblastoma multiforme dural metastasis with stereotactic radiosurgery: A case report and select review of the literature2018

    • 著者名/発表者名
      Hintenlang Lauren L.、Miller Daniel H.、Kaleem Tasneem、Patel Neema、May Byron C.、Tzou Katherine S.、Vallow Laura A.、Buskirk Steven J.、Miller Robert C.、Ko Stephen J.、Jaeckle Kurt A.、Trifiletti Daniel M.、Peterson Jennifer L.
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Neuroscience

      巻: 48 ページ: 118-121

    • DOI

      10.1016/j.jocn.2017.11.003

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human Malformation Syndromes of Defective <b><i>GLI</i></b>: Opposite Phenotypes of 2q14.2 (<b><i>GLI2</i></b>) and 7p14.2 (<b><i>GLI3</i></b>) Microdeletions and a GLIA/R Balance Model2018

    • 著者名/発表者名
      Niida Yo、Inoue Mika、Ozaki Mamoru、Takase Etsuko
    • 雑誌名

      Cytogenetic and Genome Research

      巻: 153 号: 2 ページ: 56-65

    • DOI

      10.1159/000485227

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of Uniparental Isodisomy Patterns that Cause Autosomal Recessive Disorders: Proposed Mechanisms of the Different Proportions and Parental Origin in Each Pattern2018

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Ozaki M, Shimizu M, Ueno K, Tanaka T
    • 雑誌名

      Cytogenet Genome Res

      巻: 印刷中 号: 3 ページ: 137-146

    • DOI

      10.1159/000488572

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] B-cell-specific accumulation of inclusion bodies loaded with HLA class II molecules in patients with mucolipidosis II (I-cell disease)2018

    • 著者名/発表者名
      Yokoi Ayano、Niida Yo、Kuroda Mondo、Imi-Hashida Yoko、Toma Tomoko、Yachie Akihiro
    • 雑誌名

      Pediatric Research

      巻: 87 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/s41390-018-0234-2

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diffusion tensor imaging and magnetic resonance spectroscopy in a patient with adult onset tuberous sclerosis complex2018

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa Hidehiro、Niwa Atsushi、Asahi Masaru、Matsuura Keita、Masuzugawa Satoshi、Niida Yo、Maeda Masayuki、Kondo Mineo、Tomimoto Hidekazu
    • 雑誌名

      J Clin Neurosci

      巻: 48 ページ: 108-110

    • DOI

      10.1016/j.jocn.2017.10.072

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spinal muscular atrophy with respiratory distress type 1 associated with novel compound heterozygous mutations in IGHMBP2: Differential diagnosis in a case with congenital2018

    • 著者名/発表者名
      Yasui Y, Sato H, Niida Y, Kohno M
    • 雑誌名

      Congenit Anom

      巻: 印刷中 号: 1 ページ: 22-23

    • DOI

      10.1111/cga.12280

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Clinical and molecular investigation of 14 Japanese patients with complete TFP deficiency: a comparison with Caucasian cases2017

    • 著者名/発表者名
      Bo Ryosuke、Yamada Kenji、Kobayashi Hironori、Jamiyan Purevsuren、Hasegawa Yuki、Taketani Takeshi、Fukuda Seiji、Hata Ikue、Niida Yo、Shigematsu Yosuke、Iijima Kazumoto、Yamaguchi Seiji
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 62 号: 9 ページ: 809-814

    • DOI

      10.1038/jhg.2017.52

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reply to:Uniparental disomy of chromosome 1 unmasks recessive mutations of PPT1 in a boy with neuronal ceroid lipofuscinosis type 1.2017

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Yokoi A, Kuroda M, Mitani Y, Nakagawa H, Ozaki M.
    • 雑誌名

      Brain Dev.

      巻: 39 号: 2 ページ: 184-185

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2016.08.009

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Cartilage-hair hypoplasia associated with isolated hypoganglionosis: A case report.2017

    • 著者名/発表者名
      Yasui Y, Kohno M, Nishida S, Shironomae T, Satomi M, Kuwahara T, Takahashi S, Niida Y.
    • 雑誌名

      Congenit Anom (Kyoto).

      巻: 57 号: 1 ページ: 32-34

    • DOI

      10.1111/cga.12175

    • NAID

      130008142330

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson variant of Ohdo syndrome with a KAT6B 10-base pair palindromic duplication: a recurrent mutation causing a severe phenotype mixed with genitopatellar syndrome.2017

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Mitani Y, Kuroda M, Yokoi A, Nakagawa H, Kato A.
    • 雑誌名

      Congenit Anom (Kyoto).

      巻: 57 号: 3 ページ: 86-88

    • DOI

      10.1111/cga.12196

    • NAID

      130008142355

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Angelman Syndrome Caused by Chromosomal Rearrangements: A Case Report of 46,XX,+der(13)t(13;15)(q14.1;q12)mat,-15 with an Atypical Phenotype and Review of the Literature.2016

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Sato H, Ozaki M, Itoh M, Ikeno K, Takase E.
    • 雑誌名

      Cytogenet Genome Res.

      巻: 149 号: 4 ページ: 247-257

    • DOI

      10.1159/000450847

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A novel frameshift mutation in the <i>TRPS1</i> gene caused Tricho-rhino-phalangeal syndrome type I and III in a Japanese family2016

    • 著者名/発表者名
      Itoh M, Kittaka Y, Niida Y, Saikawa Y.
    • 雑誌名

      Clinical Pediatric Endocrinology

      巻: 25 号: 3 ページ: 115-118

    • DOI

      10.1297/cpe.25.115

    • NAID

      130005165828

    • ISSN
      0918-5739, 1347-7358
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A girl with infantile neuronal ceroid lipofuscinosis caused by novel PPT1 mutation and paternal uniparental isodisomy of chromosome 1.2016

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Yokoi A, Kuroda M, Mitani Y, Nakagawa H, Ozaki M.
    • 雑誌名

      Brain Dev.

      巻: 38 号: 7 ページ: 674-677

    • DOI

      10.1016/j.braindev.2016.01.004

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 結節性硬化症の遺伝子診断の問題点と意義2018

    • 著者名/発表者名
      新井田要
    • 学会等名
      第60回日本小児神経学会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Mutational Analysis of TSC1 and TSC2 in Japanese Patients with Tuberous Sclerosis Complex2018

    • 著者名/発表者名
      Yo NIIDA, Hiroki Ura, Sumihito Togi, Mamoru Ozaki
    • 学会等名
      International TSC Research Conference 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] がん遺伝子パネル検査 NCC Oncopanel Pilot study2018

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 学会等名
      第38回北陸臨床遺伝研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Mutational Analysis of TSC1 and TSC2 in Japanese Patients with Tuberous Sclerosis Complex2017

    • 著者名/発表者名
      Niida Y, Ozaki M
    • 学会等名
      14th Asian and Oceanian Congress of Child Neurology (AOCCN 2017)
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 常染色体劣性遺伝性疾患発症の原因となる片親性イソダイソミーの分類2017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 学会等名
      第59回日本小児神経学会学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 診療連携における遺伝科(遺伝診療部)の役割 ~ 遺伝性出血性末梢血管拡張症(オスラー病)の事例を通じて考える ~2017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 学会等名
      第56回日本鼻科学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 塗抹標本とは異なる方法で作成した口腔粘膜細胞標本スライドにFISH法を行った染色体モザイクの2症例2017

    • 著者名/発表者名
      尾崎 守、新井田 要
    • 学会等名
      第62回日本人類遺伝学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 日本人結節性硬化症患者のTSC遺伝子解析2016

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 学会等名
      第58回日本小児神経学会学術集会
    • 発表場所
      京王プラザホテル(東京都新宿区)
    • 年月日
      2016-06-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Mutational Analysis of TSC1 and TSC2 in Japanese Patients with Tuberous Sclerosis Complex Revealed Higher Incidence of TSC1 Patients than Previously Reported and unique TSC1 mutational pool2016

    • 著者名/発表者名
      Yo NIIDA, Mamoru Ozaki, Akiko Wakisaka, Takanori Tsuji, Mondo Kuroda, Yusuke Mitani and Ayano Yokoi
    • 学会等名
      The 13th International Congress of Human Genetics
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-04-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] 皮膚科の臨床 Vol.59 No.6 2017 5月臨時増刊号2017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      金原出版
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] 週刊医学のあゆみ Vol.260 No.12 20172017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      医歯薬出版
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] 小児内科 2017 Vol.49 増刊号2017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      東京医学社
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] 小児神経専門医テキスト2017

    • 著者名/発表者名
      新井田 要
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      診断と治療社
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [備考] 金沢医科大学総合医学研究所 先端医療研究領域 遺伝子疾患研究分野

    • URL

      http://mri-genome-medicine.kanazawa-med.labos.ac/one/

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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