エピゲノム制御に関わる疾患アンチセンスRNAの同定とその定量検査法の開発

• 研究課題/領域番号: 16K08984
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 山中 康成 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, 客員主管研究員 (90402859)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2020-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2019年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2018年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2016年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: アンチセンスRNA / 遺伝子検査法 / 遺伝子 / ゲノム / 臨床

研究成果の概要

クロマチン関連蛋白質HMGB2 蛋白質と結合するアンチセンスRNAを同定し、疾患アンチセンスRNAを同定したのち、同RNA 定量の検査試薬を作製するなかで、HMGB2 蛋白質と結合するアンチセンスRNA の候補を挙げたが、疾患アンチセンスRNA を同定するにはいたらなかった。測定系の開発のため国産プローブを用いて疾患関連遺伝子を定量PCR法で測定したところ、既存の米国のTaqManプローブと同等の感度と特異度を得ることができた（doi: 10.1371/journal.pone.0202429）。これは、国産技術を用いた研究開発結果であり、遺伝子関連検査の向上に寄与すると期待される。

研究成果の学術的意義や社会的意義

国産プローブを用いた定量PCR法は、既存の米国のTaqManプローブと同等の感度と特異度を得ることができた。これは我が国の遺伝子関連検査の向上に寄与すると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Eprobe mediated RT-qPCR for the detection of leukemia-associated fusion genes (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya K, Tabe Y, Ai T, Ohkawa T, Usui K, Yuri M, Misawa S, Morishita S, Takaku T, Kakimoto A, Yang H, Matsushita H, Hanami T, Yamanaka Y, Okuzawa A, Horii T, Hayashizaki Y, Ohsaka A
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 13(10) 号: 10 ページ: e0202429-e0202429
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0202429
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Bone Marrow Adipocytes Facilitate Fatty Acid Oxidation Activating AMPK and a Transcriptional Network Supporting Survival of Acute Monocytic Leukemia Cells. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tabe Y, et al.
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 77 ページ: 1453-1464
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Novel biomarkers that assist in accurate discrimination of squamous cell carcinoma from adenocarcinoma of the lung. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takamochi K, et al.
  • 雑誌名: BMC Cancer 巻: 16 ページ: 760-769
  • 査読あり