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毛様細胞性星細胞腫微小残存病変の検出と臨床応用

研究課題

研究課題/領域番号 16K10011
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 小児科学
研究機関国立研究開発法人国立がん研究センター (2019-2020)
東北大学 (2016-2018)

研究代表者

渡辺 祐子  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (40610671)

研究分担者 市村 幸一  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (40231146)
中野 嘉子  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (00796005)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2019年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2018年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2016年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワードリキッドバイオプシー / 神経膠腫 / BRAF V600E / BNAクランプ法 / BNAクランプ / Liquid Biopsy / digital PCR法 / BNA Clamp法 / 毛様細胞性星細胞腫 / 微小残存病変 / 次世代シークエンス / バイオマーカー / 血漿核酸 / 微小残存病変(MRD)
研究成果の概要

BRAF V600E変異退形成性星細胞腫の髄液cfDNAを用いたリキッドバイオプシーに内容変更した。低頻度変異を検出するためdigital PCR法とBNAクランプ法、サンガーシークエンンスの両者の評価法を用いた。検体はBRAF V600E陽性の退形成性星細胞腫髄液で、陰性コントロールは原発性中枢リンパ腫、BRAF陰性脳腫瘍の髄液、陽性コントロールはBRAF陽性腫瘍由来ctDNAを用いた。髄液上清からcfDNA抽出され、腫瘍由来と考えられるBRAF V600EがdPCRで検出された。BNA添加では変異頻度の低いBRAF V600Eを検出できたが、BNA添加しない場合は変異検出されなかった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

小児脳腫瘍では生検困難もしくは高リスクの場合があり、生検では腫瘍の一部しか評価できないためliquid biopsyではこれらを克服できる可能性がある。低頻度変異を検出するためdigital PCR法とBNAクランプ法、サンガーシークエンンスの両評価法を用い、BNA添加では変異頻度の低いBRAF V600Eを検出できたがBNA添加しない場合は変異検出されなかった。今回、BNAクランプ法を用いることでBRAF V600E変異退形成性星細胞腫の髄液cfDNAを用いたリキッドバイオプシーが可能であった。今後は画像診断困難な術後変化や放射線治療後と腫瘍との鑑別、再発の早期発見に利用できる可能性がある。

報告書

(6件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2020

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Utility of a bridged nucleic acid clamp for liquid biopsy: Detecting BRAF V600E in the cerebrospinal fluid of a patient with brain tumor2020

    • 著者名/発表者名
      Nakano Yoshiko、Watanabe Yuko、Honda‐Kitahara Mai、Yamagishi Yuki、Niizuma Hidetaka、Niihori Tetsuya、Sasahara Yoji、Sonoda Yukihiko、Narita Yoshitaka、Nagane Motoo、Kure Shigeo、Ichimura Koichi
    • 雑誌名

      Pediatric Blood & Cancer

      巻: 67 号: 10

    • DOI

      10.1002/pbc.28651

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2022-01-27  

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