研究課題/領域番号 |
16K14656
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研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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配分区分 | 基金 |
研究分野 |
システムゲノム科学
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研究機関 | 九州大学 |
研究代表者 |
三浦 史仁 九州大学, 医学研究院, 講師 (50447348)
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研究期間 (年度) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2017年度)
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配分額 *注記 |
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2016年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
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キーワード | ゲノム配列決定 / 1本鎖DNA / ニッキングエンドヌクレアーゼ / TACSライゲーション / ゲノム配列 / 1本鎖DNA / 1細胞 / 次世代シークエンサー |
研究成果の概要 |
ニッキングエンドヌクレアーゼで消化することにより2本鎖DNAのフォワード鎖とリバース鎖のそれぞれの鎖に対し上下互い違いに切断を導入する。このDNAを加熱変性して1本鎖にした後、独自の1本鎖DNA同士のライゲーション技術によりアダプターを付加するとフォワード鎖とリバース鎖のそれぞれで読み出し開始位置の異なるライブラリーが調製可能となる。本開発ではこのようなユニークな特性をもつライブラリー調製法の開発を進めた。これまでにイルミナ社のシークエンサーで読み出し可能なライブラリーの調製を実現できている。今後、本手法をロングリードタイプのシークエンサーへ応用する予定である。
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