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時計タンパク質KaiCの立体構造とATPase活性に基づく古地球自転周期の考察

研究課題

研究課題/領域番号 16K14685
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 構造生物化学
研究機関分子科学研究所

研究代表者

古池 美彦  分子科学研究所, 協奏分子システム研究センター, 助教 (70757400)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2018年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワード概日時計 / 時計タンパク質 / KaiC / X線結晶構造解析 / シアノバクテリア / ATPase / 時計タンパク質KaiC / 生物時計 / タンパク質進化
研究成果の概要

多くの生物は24時間周期の地球自転に対応するため体内時計システムを有しています。光合成生物のシアノバクテリアにおいて中心的な役割を担っているのが二重リング構造をもつKaiCというタンパク質です。KaiCは一方のリングでATPを加水分解してシステム全体の速度を調節しながら、もう一方のリングで自己リン酸化と脱リン酸化を繰り返すことで24時間周期の振動を生み出しています。KaiCは反応に伴い様々な構造をとって刻々と時間を表現するはずですが、その詳細は分かっていません。本課題によって太古の昔からKaiCが多様な化学状態を内包するための柔軟な構造特性をもっていることが明らかになりつつあります。

研究成果の学術的意義や社会的意義

体内時計の仕組みを解明するためには、ナノサイズの構成部品である遺伝子やタンパク質の構造変化(空間情報)に基づき化学反応機構(空間情報から時間情報への変換)を明らかにして、そこから地球自転周期という時間情報を抽出する必要があります。したがって体内時計研究の進展そのものは、これまで空間情報の収集に関心の高かった構造生物学に時間方向への視点の転換を促すことに繋がります。放射光施設等を活用した本課題の一定の進捗により、少なくとも10億年以上前には成立した多様で特異なKaiC構造が明らかになりつつありますが、今後は他の手法を組み合わせて多角的に議論を深める必要があります。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2019 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] KaiC from a cyanobacterium Gloeocapsa sp. PCC 7428 retains functional and structural properties required as the core of circadian clock system.2019

    • 著者名/発表者名
      Mukaiyama A, Ouyang D, Furuike Y, Akiyama S
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 131 ページ: 67-73

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2019.03.051

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Conformational rearrangements of the C1 ring in KaiC measure the timing of assembly with KaiB2018

    • 著者名/発表者名
      Mukaiyama A, Furuike Y, Abe J, Yamashita E, Kondo T, Akiyama S
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 8803-8803

    • DOI

      10.1038/s41598-018-27131-8

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 変化し続ける概日時計研究のかたち2018

    • 著者名/発表者名
      秋山修志、古池美彦、向山厚
    • 雑誌名

      時間生物学

      巻: 24-2 ページ: 92-99

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyanobacterial circadian clock system: how and why can it be so slow and stable?2017

    • 著者名/発表者名
      Shuji Akiyama, Atsushi Akiyama, Jun Abe, Yoshihiko Furuike
    • 雑誌名

      Biological Clocks: with reference to suprachiasmatic nucleus

      巻: - ページ: 73-77

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Accelerating in vitro studies on circadian clock systems using an automated sampling device2016

    • 著者名/発表者名
      Furuike Y, Abe J, Mukaiyama A, Akiyama S
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 号: 0 ページ: 235-241

    • DOI

      10.2142/biophysico.13.0_235

    • NAID

      130005249808

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] ADP-Ribose Pyrophosphatase Reaction in Crystalline State Conducted by Consecutive Binding of Two Manganese(II) Ions as Cofactors2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Yuka Akita, Ikuko Miyahara, and Nobuo Kamiya
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 55(12) 号: 12 ページ: 1801-1812

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b00886

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mn(II)イオンの結合によって誘起される結晶相ADPリボース加水分解酵素反応の観察2016

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、宮原郁子、神谷信夫
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 58 号: 4 ページ: 186-192

    • DOI

      10.5940/jcrsj.58.186

    • NAID

      130005261612

    • ISSN
      0369-4585, 1884-5576
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 好熱性藍藻に由来する時計タンパク質KaiCの活性部位における水和構造2019

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、向山厚、山下栄樹、近藤孝男、秋山修志
    • 学会等名
      日本生物物理学会中部支部例会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 時計タンパク質KaiCに組み込まれたアロステリック制御2018

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、向山厚、 山下栄樹、 近藤孝男、 秋山修志
    • 学会等名
      CyanoClock 1.0
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Searching Allosteric Pathways in Clock Protein KaiC Responsible for Temperature Compensation2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Eiki Yamashita, Takao Kondo, and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 時計タンパク質 KaiC に組み込まれたアロステリック制御2018

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、向山厚、山下栄樹、近藤孝男、秋山修志
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Identification of Clock Protein KaiC Mutants Losing Temperature Compensation Ability2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Eiki Yamashita, Takao Kondo, and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] リン酸化および脱リン酸化した時計タンパク質KaiCの結晶構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      古池美彦,向山厚, 山下栄樹, 近藤孝男, 秋山修志
    • 学会等名
      平成29年度日本結晶学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] リン酸化および脱リン酸化した時計タンパク質KaiCの結晶構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      古池美彦,向山厚, 山下栄樹, 近藤孝男, 秋山修志
    • 学会等名
      クライオ電子顕微鏡によるタンパク質の高分解能単粒子構造解析
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification of Clock Protein KaiC Mutants Losing Temperature Compensation Ability2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Eiki Yamashita, Takao Kondo, and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      平成29年度生物物理学会中部支部講演会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification of Clock Protein KaiC Mutants Losing Temperature Compensation Ability2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Eiki Yamashita, Takao Kondo, and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      第二回名古屋リズム研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] シアノバクテリア時計タンパク質KaiCにおける主鎖異性化反応の意義2017

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、阿部淳、向山厚、山下栄樹、近藤孝男、秋山修志
    • 学会等名
      日本生物物理学会中部支部例会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市名古屋大学
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Functional and Structural Study on Peptide Isomerization in KaiC2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko FURUIKE, Jun ABE, Atsushi MUKAIYAMA1, Eiki YAMASHITA, Takao KONDO and Shuji AKIYAMA
    • 学会等名
      Circadian Clock of Cyanobacteria during 1991-2017
    • 発表場所
      愛知県名古屋市名古屋大学
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural Differences between Phosphorylated and Dephosphorylated States of Clock Protein KaiC2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Furuike, Jun Abe, Eiki Yamashita, Takao Kondo, and Shuji Akiyama
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      茨城県つくば市つくば国際会議場
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] KaiCにおける主鎖異性化反応の意義2016

    • 著者名/発表者名
      古池美彦、阿部淳、向山厚、山下栄樹、近藤孝男、秋山修志
    • 学会等名
      時間生物学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市名古屋大学
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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