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胚乳発達制御に関わる父性インプリント遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 16K14903
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 応用生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

高山 誠司  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (70273836)

研究協力者 和田 七夕子  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教 (50379541)
土松 隆志  千葉大学, 大学院理学研究院, 准教授 (60740107)
木下 哲  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 教授 (60342630)
伊藤 寿朗  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (90517096)
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2017年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード植物 / 遺伝子 / 発生 / 生殖 / ゲノムインプリンティング / 胚乳
研究成果の概要

胚乳発達を制御する父性インプリント遺伝子の同定を目的として探索を進めた。
1.母性インプリント遺伝子とのコンフリクトに着目した探索:シロイヌナスナCol-0株に各種野生系統の花粉を受粉させて得た種子の多様性を指標にGWASを行い、種子サイズに影響を与える複数の遺伝子座と、複数の父性インプリント遺伝子候補を同定した。
2.DNAメチル化による発現制御に着目した探索:目的とする遺伝子の発現のDNAメチル化依存性に着目し、DNAメチル化変異株のトランスクリプトーム解析データをもとに候補遺伝子を抽出した。さらに、epiRIL系統との交配データをもとに種子サイズに影響を与えるメチル化ゲノム領域を絞り込んだ。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2017 その他

すべて 学会発表 (1件) 備考 (2件)

  • [学会発表] 母方インプリント異常による種子崩壊に拮抗的に作用するゲノム領域の探索2017

    • 著者名/発表者名
      山口京、和田七夕子、高山誠司、伊藤寿朗
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻生物有機化学研究室

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/seiyu/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科細胞間情報学研究室

    • URL

      http://bsw3.naist.jp/takayama/

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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