B細胞分化における１細胞転写ネットワーク解析

• 研究課題/領域番号: 16K15506
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 血液内科学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 伊川 友活 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60450392)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2017年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: B細胞分化 / 1細胞発現解析 / 運命決定 / 転写因子 / 造血幹細胞 / B細胞 / 分化 / 1細胞

研究成果の概要

造血幹細胞は様々な系列決定過程を経て最終的にB細胞にしかなれない前駆細胞となる。この運命制御には転写因子が重要な働きをしているが、詳細は明らかでない。特に、1細胞レベルでの遺伝子発現制御機構は不明である。我々は独自に開発したB細胞分化誘導系を用いて個々の細胞の網羅的遺伝子発現解析を行った。その結果、1細胞レベルの遺伝子発現パターンは複数の細胞を用いて得られた結果と類似していた。また、骨髄の前駆細胞を用いた1細胞RNA発現解析結果もこれを支持していた。このことから、モデル系を用いて明らかとなった転写ネットワークは通常のB細胞分化においても重要であることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Kelch-like protein 14 promotes B-1a but suppresses B-1b cell development. (2018)
  • 著者名/発表者名: 1.Li S, Liu J, Min Q, Ikawa T, Yasuda S, Yang Y, Wang YQ, Tsubata T, Zhao Y, Wang JY.
  • 雑誌名: Int Immunol 巻: 印刷中
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Three-step transcriptional priming that drives the commitment of multipotent progenitors toward B cells. (2018)
  • 著者名/発表者名: 2.Miyai T, Takano J, Endo TA, Kawakami E, Agata Y, Motomura Y, Kubo M, Kashima Y, Suzuki Y, Kawamoto H, Ikawa T.
  • 雑誌名: Genes Dev 巻: 32 ページ: 112-126
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] CAGE profiles of human and mouse samples. (2017)
  • 著者名/発表者名: 3.Noguchi S, Arakawa T,…, Ikawa T (75 out of 178),…, Kawaji H*, Carninci P, Forrest ARR, Hayashizaki Y.
  • 雑誌名: Sci Data. 4: 170112 巻: 4 ページ: 170112-170112
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Conversion of T cells to B cells by inactivation of polycomb-mediated epigenetic suppression of the B-lineage program (2016)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T, Masuda K, Endo TA, Endo M, Isono K, Koseki Y, Nakagawa R, Kometani K, Takano J, Agata Y, Katsura Y, Kurosaki T, Vidal M, Koseki H, Kawamoto H
  • 雑誌名: Genes & Development 巻: 30 ページ: 2475-2485
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transient Tcf3 gene repression by TALE-tanscription factor targeting (2016)
  • 著者名/発表者名: Masuda J, Kawamoto H, Strober W, Takayama-E, Mizutani A, Murakami H, Ikawa T, Kitani A, Maeno N, Shigehiro T, Satoh A, Seno A, Arun V, Kasai T, Fuss IJ, Katsura Y, Seno M
  • 雑誌名: Appl Biochem Biotechnol 巻: 180 ページ: 1559-1573
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [学会発表] Immunosystem development (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Three-step transcriptional priming that drives multipotent progenitors toward B cells. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T, Miyai T, Takano J
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Epigenetic maintenance of T cell identity by Polycomb-mediated suppression of Pax5. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: BMB2017
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] “リンパ球分化とエピジェネティクス.” 大阪大学 微研・部員会共催セミナー (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: 大阪大学
  • 招待講演
• [学会発表] A road map that guides the development of B cells. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T, Miyai T and Takano J.
  • 学会等名: The 3rd Tsinghua-RIKEN Joint Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Transcriptional networks during B lymphocyte commitment. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T, Miyai T and Takano J
  • 学会等名: FASEB meeting
• [学会発表] A challenge as a young chief investigator in IMS (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: RIKEN Sakura Symposium 2017.
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Identification of gene regulatory networks during hematopoietic stem cell differentiation by the single-cell analysis (2017)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: RIKEN Single Cell Workshop 2017.
  • 国際学会
• [学会発表] A critical role of non-canonical PRC1 for specification to lymphoid lineage (2017)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: KTCC 2017
  • 発表場所: 京都大学（京都府・京都市）
  • 国際学会
• [学会発表] 異性型ポリコーム複合体による造血幹細胞分化制御 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊川 友活
  • 学会等名: さきがけ終了領域報告会
  • 発表場所: 九州大学（福岡県・福岡市）
• [学会発表] Dynamic transcriptional cascades and epigenetic regulation that orchestrate B cell fate determination (2016)
  • 著者名/発表者名: Junichiro Takano, Tomohiro Miyai, Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本免疫学会総会
  • 発表場所: 沖縄コンベンションセンター（沖縄県・宜野湾市）
  • 国際学会
• [学会発表] Dynamic transcriptional cascades and epigenetic regulation that orchestrate B cell fate determination (2016)
  • 著者名/発表者名: Junichoro Takano, Tomohiro Miyai, Haruhiko Koseki, Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本血液学会学術集会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
  • 国際学会
• [学会発表] Transcriptional networks that establish B cell identity (2016)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: International Congress of Immunology 2016
  • 発表場所: Melbourne (Australia)
  • 国際学会
• [学会発表] 異性型Polycomb repressive complexは造血幹細胞からリンパ球系列への運命決定に重要である (2016)
  • 著者名/発表者名: 高野 淳一郎、古関 明彦、伊川 友活
  • 学会等名: 第26回KTCC
  • 発表場所: 延暦寺会館（京都府・京都市）
• [学会発表] Transcriptional reglatory networks that regulate B cell fate determination (2016)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: CSHL meeting
  • 発表場所: Cold Spring Harbor (USA)
  • 国際学会