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遠隔エンハンサーとクロマチンドメインTADsの異常による新規遺伝病発症機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K15547
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 皮膚科学
研究機関名古屋大学

研究代表者

秋山 真志  名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (60222551)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワード皮膚科学 / 臨床遺伝学 / 遺伝学 / 先天性角化異常症 / ゲノム構造 / 遺伝性疾患 / ゲノム
研究成果の概要

ABCA12にヘテロ接合性のみに変異を認める道化師様魚鱗癬4症例について全エクソームシークエンス(WES)を行い、3例においてはABCA12のコーディング領域に新規の病原性変異を同定した。残り1例ではWESにてもABCA12の病原性変異を同定できなかった。この家系でABCA12のtopologically associating domainの5M塩基長についてゲノム構造を解析したが、明らかな異常は同定されなかった。ABCA12発現低下との関連が疑われる配列のデータについて、公開されているクロマチン修飾、および、HI-Cデータベースを用いて関連性推定を行ったが、有力な情報は得られなかった。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] St John’s Institute of Dermatology(英国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Deficient stratum corneum intercellular lipid in a Japanese patient with lamellar ichthyosis by a homozygous deletion mutation in SDR9C7.2017

    • 著者名/発表者名
      Takeichi T, Nomura T, Takama H, Kono M, Sugiura K, Watanabe D, Shimizu H, Simpson MA, McGrath JA, Akiyama M.
    • 雑誌名

      Br J Dermatol

      巻: 印刷中 号: 3

    • DOI

      10.1111/bjd.15315

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Corneocyte lipid envelope (CLE), the key structure for skin barrier function and ichthyosis pathogenesis.2017

    • 著者名/発表者名
      Akiyama M.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci

      巻: 88 号: 1 ページ: 3-9

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2017.06.002

    • NAID

      120006382253

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Congenital ichthyosis and recurrent eczema associated with a novel ALOXE3 mutation.2017

    • 著者名/発表者名
      Takeichi T, Okuno Y, Saito C, Kojima D, Kono M, Morita A, Sugiura K, Akiyama M.
    • 雑誌名

      Acta Dermato-Venereol

      巻: 97(4) 号: 4 ページ: 532-533

    • DOI

      10.2340/00015555-2549

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 拡大する角化症の臨床:新規疾患概念:自己炎症性角化症(autoinflammatory keratinization diseases)2017

    • 著者名/発表者名
      秋山真志
    • 学会等名
      第116回日本皮膚科学会総会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 教育講演:皮膚のバリア機能を担う分子と構造(かたち)2016

    • 著者名/発表者名
      秋山真志
    • 学会等名
      第43回皮膚かたち研究学会学術大会
    • 発表場所
      ヒューリックホール(東京都台東区)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シンポジウム1 皮膚難病克服への挑戦:魚鱗癬・魚鱗癬症候群の病態解明と克服への挑戦2016

    • 著者名/発表者名
      秋山真志
    • 学会等名
      第67回日本皮膚科学会中部支部学術大会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪府大阪市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 先天性魚鱗癬の病態解明2016

    • 著者名/発表者名
      秋山真志
    • 学会等名
      平成28年度愛知県難病教育講演会
    • 発表場所
      愛知県医師会館(愛知県名古屋市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 名古屋大学大学院医学系研究科皮膚科学分野のホームページ

    • URL

      https://www.med.nagoya-u.ac.jp/derma/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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