階層ベイズモデルによるメタゲノムデータからの腸内ファージの感染細菌予測法の開発

研究課題

研究課題/領域番号	16K16144
研究種目	若手研究(B)
配分区分	基金
研究分野	生命・健康・医療情報学
研究機関	東京大学
研究代表者	木村恭将東京大学, 医科学研究所, 特任助教 (30632913)
研究期間 (年度)	2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス	完了 (2017年度)
配分額 *注記	3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円) 2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円) 2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード	細菌・ファージ感染関係 / メタゲノム / ウイルス分類 / プロファージ / CRISPR / 腸内ウイルス / ウイルス / 細菌 / ゲノム / モデル化
研究成果の概要	腸内には常在ウイルスが存在し、その大部分は未知のファージ（細菌に感染するウイルス）である。メタゲノムシークエンスされたゲノム断片からウイルスゲノムを再構築することで、多くの未知ファージゲノムを見出した。その未知のファージがどの細菌に感染するかについて、感染によって宿主細菌ゲノム内に残るファージの配列を基にして、感染関係を予測する方法を開発した。感染関係予測法の検証を行った後、ヒト健常人における腸内細菌・ファージの感染関係について解析し、共生関係に関する知見を得た。