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水環境DNAを活用した迅速で網羅的な水生昆虫の流域内種多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 16K18174
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 土木環境システム
研究機関山梨大学 (2017)
愛媛大学 (2016)

研究代表者

八重樫 咲子  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (30756648)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード水生昆虫 / 環境DNA / メタバーコーディング / 河川生態 / NGS
研究成果の概要

これまで多くの地点で水域の生物モニタリングが盛んに行われてきた.従来のモニタリングでは生物採集や目視による生息確認を基本としているが,種名同定の困難さや現場調査の労力などの問題点がある.近年,従来の生物採集を基本とした生物モニタリングにかわり,生物が環境中に放出している環境DNAに着目されている.そこで本研究では,環境DNAの次世代シーケンス(NGS)解析による水生昆虫の種多様性評価を実現することを目的とし,NGS解析を利用した環境DNA分析による水生昆虫の種多様性解析,止水域由来の環境DNAを利用した環境DNAの流下距離の解明,環境DNA抽出方法の検討を行った.

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] 河川水中の環境DNAの次世代シーケンス解析を利用した水生昆虫の群集構造および生息個体数推定の可能性:従来型定量評価手法と比較して2017

    • 著者名/発表者名
      八重樫 咲子、細川 大樹、渡辺 幸三
    • 雑誌名

      土木学会論文集G(環境)

      巻: 73 号: 7 ページ: III_139-III_147

    • DOI

      10.2208/jscejer.73.III_139

    • NAID

      130006602908

    • ISSN
      2185-6648
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 次世代シーケンス解析による瀬切れ河川の水生昆虫複数種を対象とした流域内交流パターンの網羅的評価2016

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,泉昴佑,三宅洋,渡辺幸三
    • 雑誌名

      土木学会論文集G(環境)

      巻: 27 ページ: 489-496

    • NAID

      130005530461

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 環境DNAを利用したヒゲナガカワトビケラの生息地検索2018

    • 著者名/発表者名
      村松和十、金子栄廣、平山けい子、八重樫咲子
    • 学会等名
      第45回関東支部技術研究発表会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ETABARCODING ANALYSIS OF WATER ENVIRONMENTAL DNA TO REVEAL SPECIES DIVERSITY OF AQUATIC INSECTS USING NEXT GENERATION SEQUENCING2017

    • 著者名/発表者名
      YAEGASHI, S. WATANABE, K.
    • 学会等名
      ASLO 2017 AQUATIC SCIENCES MEETING
    • 発表場所
      ホノルル(アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2017-02-26
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Metabarcoding-based assessment on the influence of sediment bypass tunnel on the macroinvertebrates community structure in dam-fragmented rivers2017

    • 著者名/発表者名
      Joeselle SERRANA, Sakiko YAEGASHI, Kozo WATANABE
    • 学会等名
      2nd International Workshop on Sediment Bypass Tunnels
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAのメタバーコーディングによる水生昆虫の流域内種多様性の評価2017

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,渡辺幸三
    • 学会等名
      第4回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 河川水中の環境 DNA の次世代シーケンス解析を利用した水生昆虫の群集構造および生息個体数推定の可能性:従来型定量評価:手法と比較して2017

    • 著者名/発表者名
      八重樫 咲子、細川 大樹、渡辺 幸三
    • 学会等名
      第54回環境工学研究フォーラム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 河川水中の環境DNAメタバーコーディングを利用した流域内の水生昆虫多様性調査2017

    • 著者名/発表者名
      八重樫 咲子、渡辺 幸三
    • 学会等名
      ELR2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Metabarcoding-based assessment of the influence of sediment bypass tunnels on the macroinvertebrate communities in dam-fragmented rivers2017

    • 著者名/発表者名
      Joeselle SERRANA, Sakiko YAEGASHI, Kozo WATANABE
    • 学会等名
      第4回環境水質工学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンス解析による瀬切れ河川の水生昆虫複数種を対象とした流域内交流パターンの網羅的評価2016

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,泉昴佑,三宅洋,渡辺幸三
    • 学会等名
      第53回環境工学研究フォーラム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2016-12-06
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 河川水中に存在するDNAを活用した重信川の流域内水生昆虫種多様性解析2016

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第20回大会
    • 発表場所
      東京大学農学部弥生講堂(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-09-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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