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グリシンを結合するイソロイシンtRNAは翻訳以外で機能するか?

研究課題

研究課題/領域番号 16K18493
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 分子生物学
研究機関愛媛大学

研究代表者

冨川 千恵  愛媛大学, 理工学研究科(工学系), 特任講師 (60527696)

研究協力者 吉澤 聡子  
高井 和幸  
堀 弘幸  
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2018年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2017年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードRNA / 非コードRNA / 翻訳 / タンパク質合成 / 乳酸菌 / プロバイオティクス / タンパク質 / ゲノム
研究成果の概要

乳酸菌Lactobacillus plantarumには、イソロイシンではなくグリシンを受容するtRNAIle(UAU)様分子が存在する。第一の目的として、当該RNAが翻訳に利用されているのか明らかにするため解析を進めた。当該RNAは、AUAコドンのみとリボソーム上で結合するが、翻訳伸長因子EF-Tuとの結合性を確認することができていない。tRNAIle(UAU)様分子の翻訳外機能を調査するため、当該RNA親和性を示すタンパク質を複数同定した。また、乳酸菌に2つ存在するtRNAIle(UAU)遺伝子の二重遺伝子破壊株が得られないことから、両遺伝子の欠損は致死的であると考えられる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

現在のところ、少なくとも栄養十分な条件下ではtRNAIle様のRNAが翻訳に使われていないことが示された。しかし、初歩実験の結果ではあるが、貧栄養な条件下でわずかに翻訳に利用されることが検出できている。当該RNAは、栄養条件次第では、タンパク質制御に関わっている可能性がある。本研究を発展させることで、新たなRNA機能を提示できると考える。

報告書

(4件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (23件) (うち国際学会 6件、 招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] フランス国立科学研究センター(フランス)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] フランス国立科学研究センター(フランス)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [国際共同研究] フランス国立科学研究所(フランス)

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 7-Methylguanosine Modifications in Transfer RNA (tRNA)2018

    • 著者名/発表者名
      Tomikawa Chie
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 19 号: 12 ページ: 4080-4080

    • DOI

      10.3390/ijms19124080

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transfer RNA Modification Enzymes from Thermophiles and Their Modified Nucleosides in tRNA.2018

    • 著者名/発表者名
      Hori H, Kawamura T, Awai T, Ochi A, Yamagami R, Tomikawa C, Hirata A
    • 雑誌名

      Microorganism

      巻: 6 号: 4 ページ: 110-155

    • DOI

      10.3390/microorganisms6040110

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of redundant tRNAIles with CAU and UAU anticodons in Lactobacillus plantarum2017

    • 著者名/発表者名
      Tomikawa Chie、Auxilien Sylvie、Guerineau Vincent、Yoshioka Yuya、Miyoshi Kiyo、Hori Hiroyuki、Fourmy Dominique、Takai Kazuyuki、Yoshizawa Satoko
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 163 号: 3 ページ: 233-241

    • DOI

      10.1093/jb/mvx075

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Kinetic characterization of substrate-binding sites of thermostable tRNA methyltransferase (TrmB)2017

    • 著者名/発表者名
      Tomikawa Chie、Takai Kazuyuki、Hori Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 163 号: 2 ページ: 133-142

    • DOI

      10.1093/jb/mvx068

    • NAID

      40021471064

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO) from Thermus thermophilus regulates the other modifications in tRNA at low temperatures2016

    • 著者名/発表者名
      R. Yamagami, C. Tomikawa, N. Shigi, A. Kazayama, S. Asai, H. Takuma, A. Hirata, D. Fourmy, H. Asahara, K. Watanabe, S. Yoshizawa and H. Hori
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 21 号: 7 ページ: 740-754

    • DOI

      10.1111/gtc.12376

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 大腸菌タンパク質合成系への導入に向けたコムギ由来シャペロニンの調製2018

    • 著者名/発表者名
      加藤凌平、冨川千恵、高井和幸
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 乳酸菌Lactobacillus plantarumに存在する tRNAIle(UAU)-like small RNAの機能解明に向けて2018

    • 著者名/発表者名
      榊原健吾,冨川千恵,吉澤聡子,高井和幸
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of tRNAIle(UAU)-like small RNAs in Lactobacillus plantarum2018

    • 著者名/発表者名
      Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guerineau, Yuya Yoshioka, Kiyo Miyoshi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, and Satoko Yoshizawa
    • 学会等名
      11th Structure Integration Function and Reactivity of RNA
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] コムギCCTを組み合わせた大腸菌無細胞タンパク質合成系の調製2018

    • 著者名/発表者名
      加藤凌平、冨川 千恵、高井和幸
    • 学会等名
      第13回無細胞生命科学研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] コムギ由来CCTは動物由来CCTと異なる性質を持つ2018

    • 著者名/発表者名
      加藤凌平、冨川千恵、高井和幸
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会11.0
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Long and branched polyamines are required for maintenance of the ribosome, tRNAHis, and tRNATyr in Thermus thermophilus cells at high temperatures2018

    • 著者名/発表者名
      Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Chie Tomikawa, Yuki Ochi, Toshiyuki Moriya, Haruichi Asahara, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima and Hiroyuki Hori
    • 学会等名
      27th tRNA conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of tRNAIle(UAU)-like small RNAs in Lactobacillus plantarum2018

    • 著者名/発表者名
      Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guerineau, Kengo Sakakibara, Gakuto Uesugi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, Satoko Yoshizawa
    • 学会等名
      27th tRNA conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional analysis of tRNA-like small RNA through gene disruptants in L. plantarum2018

    • 著者名/発表者名
      冨川 千恵、堀田康弘、Sylvie Auxilien、Vincent Guerineau、林 実、堀 弘幸、Dominique Fourmy, 高井 和幸、吉澤 聡子
    • 学会等名
      第20回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 高度好熱菌の長鎖・分岐鎖ポリアミンは、高温環境下での リボソーム、tRNAHis、tRNATyrの維持に必要である2018

    • 著者名/発表者名
      中嶋美沙、山上龍太、冨川千恵、越智裕貴、森屋利幸、朝原治一、 Dominique Fourmy、吉澤聡子、大島泰郎、堀 弘幸
    • 学会等名
      第20回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] 乳酸菌由来tRNAIle(UAU)様small RNAを導入した枯草菌の表現型観察2018

    • 著者名/発表者名
      堀田康弘、冨川千恵、相馬亜希子、榊原健吾、稲葉 希、上杉岳人、谷本奈那、吉澤聡子、高井和幸
    • 学会等名
      第20回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Thermus thermophilusの長鎖・分岐鎖ポリアミンは、高温環境下でのリボソーム、tRNAHis、tRNATyrの維持に必要である2017

    • 著者名/発表者名
      中嶋美沙、山上龍太、冨川千恵、越智裕貴、森屋利幸、朝原治一、 Dominique Fourmy、吉澤聡子、大島泰郎、堀 弘幸
    • 学会等名
      日本ポリアミン学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 乳酸菌Gly-tRNAIle(UAU)の機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      冨川 千恵、Sylvie Auxilien、Vincent Guerineau、吉岡 裕也、三好 規代、林 実、堀 弘幸、Dominique Fourmy, 高井 和幸、吉澤 聡子
    • 学会等名
      ConBio2017 生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌無細胞タンパク質合成系への導入のためのコムギ由来シャペロニンの調製2017

    • 著者名/発表者名
      加藤凌平、冨川千恵、高井和幸
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会10.0
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳酸菌にあるtRNA様分子の解析2017

    • 著者名/発表者名
      冨川 千恵、Sylvie Auxilien、Vincent Guerineau、吉岡 裕也、三好 規代、林 実、堀 弘幸、Dominique Fourmy, 高井 和幸、吉澤 聡子
    • 学会等名
      グラム陽性菌ゲノム機能会議
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳酸菌に存在する異様なtRNAIle(UAU)の解析2017

    • 著者名/発表者名
      冨川 千恵、Sylvie Auxilien、Vincent Guerineau、吉岡 裕也、三好 規代、林 実、堀 弘幸、Dominique Fourmy, 高井 和幸、吉澤 聡子
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳酸菌Lactobacillus plantarumのtRNAIle(UAU)に対して親和性を持つ因子は存在するか2017

    • 著者名/発表者名
      榊原健吾、冨川千恵、吉澤聡子、高井和幸
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusの長鎖・分岐鎖ポリアミンは主に高温環境下でのリボソームの維持に必要である2016

    • 著者名/発表者名
      Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori
    • 学会等名
      第39回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川・横浜)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] コムギ由来ペプチド鎖解離因子複合体の調製2016

    • 著者名/発表者名
      阿賀健、久松啓伍、冨川千恵、高井和幸
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会9.0
    • 発表場所
      早稲田大学(東京都・新宿)
    • 年月日
      2016-11-21
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] コムギ胚芽からのシャペロニンを含む画分の調製2016

    • 著者名/発表者名
      加藤凌平、冨川千恵、高井和幸
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会9.0
    • 発表場所
      早稲田大学(東京都・新宿)
    • 年月日
      2016-11-21
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] The long and branched polyamines of Thermus thermophilus, an extremely thermophilic eubacterium, are required for maintenance of ribosome at high temperatures.2016

    • 著者名/発表者名
      Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori
    • 学会等名
      11th Extremophiles
    • 発表場所
      京都大学(京都府・京都市)
    • 年月日
      2016-09-12
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of tRNAIle(UAU) in lactobacilli2016

    • 著者名/発表者名
      Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guerineau, Yuya Yoshioka, Kiyo Miyoshi, Minoru Hayashi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, Satoko Yoshizawa
    • 学会等名
      tRNA conference 2016
    • 発表場所
      ロッテホテル済州(大韓民国・済州島)
    • 年月日
      2016-09-04
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Functional Analysis of tRNAIle(UAU) in Lactic Acid Bacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guerineau, Yuya Yoshioka, Kiyo Miyoshi, Minoru Hayashi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, Satoko Yoshizawa
    • 学会等名
      RNA2016
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府・京都市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Takuma, Natsumi Ushio, Masayuki Minoji, Ai Kazayama, Naoki Shigi, Akira Hirata, Chie Tomikawa, Anna Ochi, and Hiroyuki Hori
    • 学会等名
      RNA2016
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府・京都市)
    • 年月日
      2016-06-28
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] RNA Technologies "Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine"2016

    • 著者名/発表者名
      H. Hori, R. Yamagami and C. Tomikawa
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2020-03-30  

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