研究課題
若手研究(B)
植物細胞の持つ多種のオルガネラ・細胞骨格系について、顕微鏡画像からフェノーム解析を行う上で必須な画像解析手法の統合化を実現する実験系と画像処理ソフトウェアの開発に取り組んだ。また、顕微鏡画像から得られたオルガネラ・細胞骨格系のデータを規範として、細胞骨格系の動態をシミュレートするソフトウェアを開発した。材料には主としてタバコ培養細胞BY-2ならびにその形質転換体を用いた。また、国内の複数の研究機関と協力してオルガネラ・フェノーム研究で得られた顕微鏡画像を収集し分析に供した。
研究の結果、光学的特性等が自ずと異なる複数の顕微鏡撮影系に対して、オルガネラ等を認識し個数や面積を測定する、といった細胞レベルのフェノーム解析を高精度高効率に実施するソフトウェアを開発することができた。その基礎を形づくる画像解析ソフトウェア群については国内企業によるユーザインタフェイス等の改良等を受け、アップデートと提供を続けていけるような体制を整えている。
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すべて 雑誌論文 (16件) (うち国際共著 1件、 査読あり 16件、 オープンアクセス 9件、 謝辞記載あり 8件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 2件、 招待講演 6件) 備考 (1件)
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