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エンハンサーの共有と遮蔽を支える染色体ダイナミクス

研究課題

研究課題/領域番号 16K18589
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 遺伝・染色体動態
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

天野 孝紀  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任研究員 (20419849)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2016年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード遺伝子発現 / エンハンサー / マウス / 染色体動態 / ゲノム / 遺伝子発現制御 / インシュレーター / 形態形成
研究成果の概要

ゲノムは、エンハンサーとプロモーターが密に相互作用するTADという小区画を形成し、遺伝子発現を組織化している。本研究は、Shh遺伝子が存在するTADをモデルとし、エンハンサーが対象遺伝子と適切に相互作用するメカニズムを明らかにする目的で行った。
Shhと同じTADに含まれるLmbr1遺伝子のプロモーター周辺60 kbを欠失させたところ、そのノックアウトマウスは指の形態異常を示した。このマウスでは、Shhの発現低下と周辺の別遺伝子であるMnx1の発現上昇が同時に起きており、この欠失領域がTADの組織化に関与し、近隣遺伝子の発現を正にも負にも制御する新規シス因子を含むことが明らかになった。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Upstream Enhancer Elements of Shh Regulate Oral and Dental Patterning2018

    • 著者名/発表者名
      Seo H.、Amano T.、Seki R.、Sagai T.、Kim J.、Cho S.W.、Shiroishi T.
    • 雑誌名

      Journal of Dental Research

      巻: - 号: 9 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1177/0022034518758642

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] SHH signaling directed by two oral epithelium-specific enhancers controls tooth and oral development2017

    • 著者名/発表者名
      Sagai Tomoko、Amano Takanori、Maeno Akiteru、Kiyonari Hiroshi、Seo Hyejin、Cho Sung-Won、Shiroishi Toshihiko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-017-12532-y

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enhancer adoption caused by genomic insertion elicits interdigitalShhexpression and syndactyly in mouse2017

    • 著者名/発表者名
      Mouri Kousuke、Sagai Tomoko、Maeno Akiteru、Amano Takanori、Toyoda Atsushi、Shiroishi Toshihiko
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 115 号: 5 ページ: 1021-1026

    • DOI

      10.1073/pnas.1713339115

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Two Types of Etiological Mutation in the Limb-Specific Enhancer of Shh2017

    • 著者名/発表者名
      Amano Takanori、Sagai Tomoko、Seki Ryohei、Shiroishi Toshihiko
    • 雑誌名

      G3

      巻: 7 号: 9 ページ: 2991-2998

    • DOI

      10.1534/g3.117.044669

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] A novel CRE positively and negatively influences the expression of Shh and its bystander genes2017

    • 著者名/発表者名
      天野孝紀
    • 学会等名
      第50回日本発生生物学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マウス亜種系統間の胃形態差に寄与するShh遺伝子のシス多型2016

    • 著者名/発表者名
      天野孝紀、城石俊彦
    • 学会等名
      日本遺伝学会第88回大会
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [図書] 遺伝単2017

    • 著者名/発表者名
      日本遺伝学会
    • 総ページ数
      371
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860434991
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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