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ペプチドライゲースオルソログの機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K18692
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生物有機化学
研究機関北海道大学

研究代表者

小笠原 泰志  北海道大学, 工学研究院, 助教 (20732986)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2016年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードペプチドリガーゼ / 酵素 / アミド結合 / 天然物 / 疑似ペプチド / 生合成 / 放線菌 / 二次代謝 / シュードペプチド / 抗生物質
研究成果の概要

本研究では、新規アミド結合形成酵素(ペプチドライゲース, PGM1)の相同遺伝子について解析を行った。Micromonospora属放線菌の相同遺伝子(KtmD)が、新規シュードペプチドとして単離したケトメミシンの生合成中のアミド結合に関わることを明らかにした。ケトメミシンのメチレンケトン部の生合成について、アルドラーゼ(KtmA)、脱水酵素(KtmC)、PLP依存-オキソアミン合成酵素(KtmB)、還元酵素(KtmF)の関与で生合成されることを明らかにした。
その他の相同遺伝子についても周辺の遺伝子クラスターと共に異種宿主発現し、特異的に生産された代謝産物をいくつか確認した。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] 放線菌が生み出した疑似ペプチド化合物2018

    • 著者名/発表者名
      小笠原 泰志、大利 徹
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 56 号: 2 ページ: 76-78

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.56.76

    • NAID

      130007563335

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
    • 年月日
      2018-01-20
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Peptide Epimerization Machineries Found in Microorganisms2018

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      Front. Microbiol.

      巻: 9 ページ: 1-9

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.00156

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biosynthesis of Oligopeptides Using ATP-Grasp Enzymes2017

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara Yasushi、Dairi Tohru
    • 雑誌名

      Chemistry

      巻: 23 号: 45 ページ: 10714-10724

    • DOI

      10.1002/chem.201700674

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biosynthesis of the Carbonylmethylene Structure Found in the Ketomemicin Class of Pseudotripeptides2017

    • 著者名/発表者名
      J. Kawata, T. Naoe, Y. Ogasawara, and T. Dairi
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 56 号: 8 ページ: 2026-2029

    • DOI

      10.1002/anie.201611005

    • NAID

      120006383813

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Characterization of three amidinotransferases involved in the biosynthesis of ketomemicins2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Ogasawara, M. Fujimori, J. Kawata, and T. Dairi
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 26 号: 15 ページ: 3662-3664

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2016.05.090

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] ポリグルタミン酸生合成の解析2018

    • 著者名/発表者名
      重松 真由子、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ペプチドの構造に多様性を与える新規酵素の探索2018

    • 著者名/発表者名
      小笠原 泰志
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring novel peptide ligase orthologs - Discovery and biosynthetic studies of carbonylmethylene-containing pseudotripeptides ketomemicins2017

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Ogasawara, Junpei Kawata, Taiki Naoe, Michiko Fujimori, and Tohru Dairi
    • 学会等名
      Directing Biosynthesis V
    • 発表場所
      Warwick University, Warwick, UK
    • 年月日
      2017-03-22
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ケトメミシンの生合成に関わるアミジノ基転移酵素の機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      小笠原 泰志、藤盛 道子、川田 純平、大利 徹
    • 学会等名
      2017年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都女子大学、京都
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 放線菌に見出されたペプチドリガーゼオルソログの機能解析2017

    • 著者名/発表者名
      藤村 祐子、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2017年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都女子大学、京都
    • 年月日
      2017-03-17
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Biosynthesis of the Carbonylmethylene Containing Pseudopeptides, Ketomemicins2017

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Ogasawara, Junpei Kawata, Taiki Naoe, Michiko Fujimori, and Tohru Dairi
    • 学会等名
      2nd US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products For Young Researchers
    • 発表場所
      Tokyo Institute of Technology, Tokyo
    • 年月日
      2017-03-04
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ケトメミシンにみられるカルボニルメチレン型シュードペプチドの生合成2017

    • 著者名/発表者名
      直江 大樹、川田 順平、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      生合成リデザイン第一回若手セミナー
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ペプチド系天然化合物 JBIR-78および JBIR95 の生合成研究2017

    • 著者名/発表者名
      37.竹田 薫平、見目 晃平、佐藤 康治、小笠原 泰志、新家 一男、大利 徹
    • 学会等名
      第59回 天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] カルボニルメチレン構造を持つシュードトリペプチド(ケトメミシン)の発見と酵素的全合成2016

    • 著者名/発表者名
      小笠原 泰志、川田 純平、野池 基義、藤盛 道子、佐藤 康治、降旗 一夫、大利 徹
    • 学会等名
      第58回 天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      東北大学百周年記念会館、仙台
    • 年月日
      2016-09-14
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] ケトメミシンにみられるシュードペプチド部の生合成解析2016

    • 著者名/発表者名
      川田 純平、直江 大樹、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      2016年度 日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京大学 弥生講堂、東京都文京区
    • 年月日
      2016-09-08
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 放線菌に見出された新規ペプチドライゲースオルソログの機能解析2016

    • 著者名/発表者名
      藤村 祐子、小笠原 泰志、大利 徹
    • 学会等名
      平成28年度 日本農芸化学会 北海道支部第2回講演会
    • 発表場所
      北海道大学農学部、札幌
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [図書] ペプチド医薬品のスクリーニング・安定化・製剤化技術2017

    • 著者名/発表者名
      小笠原 泰志、大利 徹、他(合計110名)
    • 総ページ数
      557
    • 出版者
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861046872
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 北海道大学応用生物化学研究室ウェブサイト

    • URL

      http://www.eng.hokudai.ac.jp/labo/tre/ABCLab_jp/

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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