近縁種の連鎖不平衡マッピング ―ブリ属性決定遺伝子の同定にむけて―

• 研究課題/領域番号: 16K18741
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 水圏生産科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 小山 喬 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任研究員 (40749701)
• 研究協力者: 中本 正俊 東京海洋大学, 学術研究院, 博士研究員 ; 山下 雄史 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 ; 水野 直樹 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 技術専門職員 ; 田角 聡志 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教 ; 細谷 将 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 ; 宇野 誠一 鹿児島大学, 水産学部, 准教授 ; 豊田 敦 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 特任教授 ; 坂本 崇 東京海洋大学, 学術研究院, 教授 ; 菊池 潔 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2016年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: ブリ属 / 性決定遺伝子 / ステロイド

研究成果の概要

本研究で、カンパチの性がステロイド代謝酵素の一つであるHsd17b1上の1つのSNPで決められていることを遺伝学的に見出した。このSNPはブリにも存在し、その遺伝子型はブリの性とも100%一致していた。オス型HSD17B1は派生型で、性決定SNPにより144番目のグリシンがグルタミン酸へ置換されるために活性中心の水素結合が阻害され、メス型よりもエストラジオール（E2）合成能が低いことが判明した。よってブリ属では、遺伝的メスはメス型HSD17B1により十分量のE2が作られるためメス化し、遺伝的オスはオス型HSD17B1が十分なE2合成能を持たないためにオス化すると考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of the sex-determining locus in grass puffer (Takifugu niphobles) provides evidence for sex-chromosome turnover in a subset of Takifugu species (2018)
  • 著者名/発表者名: Risa Ieda, Sho Hosoya, Shota Tajima, Kazufumi Atsumi, Takashi Kamiya, Aoi Nozawa, Yuma Aoki, Satoshi Tasumi, Takashi Koyama, Osamu Nakamura, Yuzuru Suzuki, Kiyoshi Kikuchi
  • 雑誌名: PLOSONE 巻: 13 号: 1 ページ: e0190635-e0190635
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0190635
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A novel C-type lectin gene is a strong candidate gene for Benedenia disease resistance in Japanese yellowtail, Seriola quinqueradiata (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakamoto Masatoshi、Takeuchi Yusuke、Akita Kazuki、Kumagai Ryo、Suzuki Junpei、Koyama Takashi、Noda Tsutomu、Yoshida Kazunori、Ozaki Akiyuki、Araki Kazuo、Sakamoto Takashi
  • 雑誌名: Developmental & Comparative Immunology 巻: 76 ページ: 361-369
  • DOI: 10.1016/j.dci.2017.07.010
  • 査読あり
• [学会発表] ブリ属の性決定遺伝子はステロイド代謝酵素である (2018)
  • 著者名/発表者名: 小山喬、森島輝、山下量平、豊田敦、内野翼、坂本崇、鈴木萌、細谷将、菊池潔
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] ブリ属性決定遺伝子の機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 小山喬、山下雄史、佐々木皓平、宇野誠一、小山次朗、田角聡志、菊池潔
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] ブリ属性決定遺伝子の発現解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 中本正俊、小山喬、水野直樹、菊池潔、坂本崇
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] ゼブラフィッシュを用いたブリ属性決定遺伝子の機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 車遥介、小山喬、岡田恵治、 家田梨櫻、朝比奈潔、菊池潔
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] クサフグ性決定遺伝子の探索 ―少数個体を用いたGWAS の発見的利用― (2018)
  • 著者名/発表者名: 家田梨櫻、小山喬、細谷将、大木駿、水野直樹、藤田真志、菊池潔
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] ショウサイフグ性決定遺伝子の探索 ―Pool-seq による表現型原因遺伝子の特定― (2018)
  • 著者名/発表者名: 家田梨櫻、細谷将、小山喬、城夕香、菊池潔
  • 学会等名: 平成３０年度日本水産学会春季大会
• [学会発表] ターゲットキャプチャー法によるブリW染色体塩基配列決定の試み (2017)
  • 著者名/発表者名: 小山喬・森島輝・鈴木穣・内野翼・坂本崇・菊池潔
  • 学会等名: 平成２９年度日本水産学会春季大会
  • 発表場所: 東京海洋大学（東京都港区）
  • 年月日: 2017-03-26
• [学会発表] ターゲットエンリッチメント法と長鎖シーケンサーによる領域特異的塩基配列決定の試み (2017)
  • 著者名/発表者名: 小山喬、森島輝、鈴木穣、内野翼、坂本崇、菊池潔
  • 学会等名: NGS現場の会第五回研究会
• [学会発表] ブリ属性決定遺伝子の同定と性染色体進化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 菊池潔、小山喬、車遥介
  • 学会等名: DMY研究会
• [学会発表] NGSを用いたフグ類の性決定遺伝子の探索 (2016)
  • 著者名/発表者名: 家田梨櫻・細谷将・小山喬・田角聡志・鈴木重則・小林久人・菊池潔
  • 学会等名: 生物資源ゲノム解析拠点シンポジウム
  • 発表場所: 東京農業大学（東京都世田谷区）
• [学会発表] 遡河回遊の進化に伴う淡水適応能獲得の遺伝基盤 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐藤耕平・伊藤洸太朗・小山喬・城夕香・細谷将・菊池潔
  • 学会等名: 浜名湖をめぐる研究者の会
  • 発表場所: 東京大学大学院農学生命科学研究科附属水産実験所（静岡県浜松市）
• [学会発表] 浜名湖を中心とした日本近海のフグにおける性決定遺伝子の進化 (2016)
  • 著者名/発表者名: 浜名湖を中心とした日本近海のフグにおける性決定遺伝子の進化
  • 学会等名: 浜名湖をめぐる研究者の会
  • 発表場所: 東京大学大学院農学生命科学研究科附属水産実験所（静岡県浜松市）