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次世代シーケンサーを利用した混合試料におけるミトコンドリアDNA分析

研究課題

研究課題/領域番号 16K19301
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 法医学
研究機関東海大学

研究代表者

落合 恵理子  東海大学, 医学部, 助教 (60760270)

研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2017年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード混合試料 / ミトコンドリアDNA / 次世代シーケンス / DNA鑑定 / 遺伝子
研究成果の概要

複数人分のDNAが混入している「混合試料」の分析は,法医学領域における重要な課題のひとつであるが,各個人のDNA型を分離する技術的な方法は未だ確立されていない.そこで,次世代シーケンサー(NGS)を用いたミトコンドリア(mt)DNA解析を行い,1分子毎のDNA鎖(リード)の塩基配列の違いを比較することで複数人のDNA型の分離を試みた.増幅産物を350 bp程度にしてNGS解析したところ,HV1,HV2ともに増幅領域全体を1本のリードで検出することができた.得られたリード上には複数の塩基多型が確認され,その組み合わせからは異なるmtDNA型のパターンが区別でき,2名分のDNA型と判断できた.

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] 混合試料のミトコンドリアDNA型判定における次世代シーケンサーの応用2018

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,松島裕,水口清,垣内康宏,垣本由布,大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 26

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] 次世代シーケンサーを用いた死後遺伝学的検査:突然死例に対する循環器系疾患関連遺伝子解析2017

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,松島裕,垣本由布,大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 25 ページ: 164-166

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Evaluation of Y chromosomal SNP haplogrouping in the HID-Ion AmpliSeqTM Identity Panel.2016

    • 著者名/発表者名
      Ochiai E, Minaguchi K, Nambiar P, Kakimoto Y, Satoh F, Nakatome M, Miyashita K, Osawa M
    • 雑誌名

      Leg Med (Tokyo)

      巻: 22 ページ: 58-61

    • DOI

      10.1016/j.legalmed.2016.08.001

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 次世代シーケンサーを用いたY染色体ハプログループ解析2016

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,宮下京子,水口清,垣本由布,佐藤文子,大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 24 ページ: 169-171

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 次世代シークエンサーを利用したSNP解析の血縁関係推定への応用2016

    • 著者名/発表者名
      宮下京子,落合恵理子,田村友紀,大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 24 ページ: 200-203

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Mitochondrial DNA typing in mixtures using massive parallel sequencing2018

    • 著者名/発表者名
      Ochiai E, Matsushima Y, Minaguchi K, Kakiuchi Y, Kakimoto Y, Osawa M
    • 学会等名
      24th Congress of the International Academy of Legal Medicine
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた死後遺伝学的検査:循環器系疾患解析パネルの評価2017

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,垣本由布,瀬戸良久,坪井秋男,松島裕,大澤資樹
    • 学会等名
      第101次日本法医学会学術全国集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたY-SNPハプログループ解析2017

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹,落合恵理子,水口清,垣本由布
    • 学会等名
      日本アンドロロジー学会第36回学術大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Postmortem genetic testing using the next generation sequencing system: Evaluation of cardiovascular disease analysis panel2017

    • 著者名/発表者名
      Ochiai E, Kakimoto Y, Seto Y, Tsuboi A, Matsushima Y, Osawa M
    • 学会等名
      10th International Symposium Advances in Legal Medicine
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 骨様および軟組織様断片のDNA鑑定2017

    • 著者名/発表者名
      水口清,落合恵理子,松島裕,大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第26回学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 日本人の姓とY染色体DNA多型の関連性2017

    • 著者名/発表者名
      佐藤栞,落合恵理子,水口清,垣本由布,大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第26回学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 混合試料のミトコンドリアDNA型判定における次世代シーケンサーの応用2017

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,松島裕,水口清,垣内康宏,垣本由布,大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第26回学術集会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたY-SNP解析とハプログループ判定2016

    • 著者名/発表者名
      落合恵理子,水口清,垣本由布,大澤資樹
    • 学会等名
      日本法科学技術学会第22回学術集会
    • 発表場所
      中野サンプラザ(東京都中野区)
    • 年月日
      2016-11-10
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Y chromosome haplogrouping using the next generation sequencing system2016

    • 著者名/発表者名
      Ochiai E, Miyashita K, Minaguchi K, Kakimoto Y, Satoh F, Osawa M
    • 学会等名
      ICHG2016 The13th International Congress of Human Genetics
    • 発表場所
      Kyoto International Conference Center (Kyoto, Japan)
    • 年月日
      2016-04-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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