網羅的遺伝子解析を利用したAlport症候群の診断体系の確立

• 研究課題/領域番号: 16K19642
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 山村 智彦 神戸大学, 医学部附属病院, 特定助教 (30770242)
• 研究協力者: 飯島 一誠 神戸大学, 大学院医学研究科内科系講座小児化学分野, 教授 (00240854) ; 野津 寛大 神戸大学, 大学院医学研究科内科系講座小児化学分野, 准教授 (70362796) ; 南川 将吾 神戸大学, 医学部付属病院, 特定助教 (10772634)
• 研究期間 (年度): 2016-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: Alport症候群 / 次世代シークエンサー / 網羅的遺伝子解析 / 体細胞モザイク / 高い診断能力 / 修飾遺伝子 / 診断

研究成果の概要

我々は、次世代シークエンサー（NGS）を用いたtargeted sequencingにより既知のポドサイト関連45遺伝子を網羅的に解析できる診断体制を確率し、研究期間内にAlport症候群（AS）が疑われた185家系に対して解析を施行、147家系で原因遺伝子変異を同定した。多数の症例の解析を行った結果、X染色体連鎖型ASの女性患者における臨床像と遺伝子型の関係を解析することが可能となり報告を行った。また、AS疑い患者の中に含まれる他の遺伝性腎疾患の患者の診断や、コピー数異常や体細胞モザイクを有するAS患者の診断もNGSを用いて行うことが可能であることを明らかとし、報告を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Detection of copy number variations by pair analysis using next-generation sequencing data in inherited kidney diseases (2018)
  • 著者名/発表者名: Nagano C, Nozu K, Morisada N, Yazawa M, Ichikawa D, Numasawa K, Kourakata H, Matsumura C, Tazoe S, Tanaka R, Yamamura T, Minamikawa S, Horinouchi T, Nakanishi K, Fujimura J, Sakakibara N, Nozu Y, Ye MJ, Kaito H, Iijima K
  • 雑誌名: Clinical and Experimental Nephrology 巻: 印刷中 号: 4 ページ: 881-888
  • DOI: 10.1007/s10157-018-1534-x
  • NAID: 120006624236
  • 査読あり
• [雑誌論文] Natural History and Genotype?Phenotype Correlation in Female X-Linked Alport Syndrome (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamamura Tomohiko、Nozu Kandai、Fu Xue Jun、Nozu Yoshimi、Ye Ming Juan、Shono Akemi、Yamanouchi Satoko、Minamikawa Shogo、Morisada Naoya、Nakanishi Koichi、Shima Yuko、Yoshikawa Norishige、Ninchoji Takeshi、Morioka Ichiro、Kaito Hiroshi、Iijima Kazumoto
  • 雑誌名: Kidney Int Rep. 巻: 2 号: 5 ページ: 850-855
  • DOI: 10.1016/j.ekir.2017.04.011
  • NAID: 120006373817
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Female X-linked Alport syndrome with somatic mosaicism (2016)
  • 著者名/発表者名: Yokota K, Nozu K, Minamikawa S, Yamamura T, Nakanishi K, Kaneda H, Hamada R, Nozu Y, Shono A, Ninchoji T, Morisada N, Ishimori S, Fujimura J, Horinouchi T, Kaito H, Nakanishi K, Morioka I, Taniguchi-Ikeda M, Iijima K.
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol. 巻: 印刷中 号: 5 ページ: 877-883
  • DOI: 10.1007/s10157-016-1352-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたAlport症候群の網羅的診断法の確立 (2018)
  • 著者名/発表者名: 山村智彦
  • 学会等名: 第121回日本小児科学会学術集会
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたAlport症候群の網羅的診断法の確立 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山村智彦
  • 学会等名: 第60回日本腎臓学会学術集会
• [学会発表] Establishment of a comprehensive diagnostic method using next generation sequencer for Alport syndrome (2017)
  • 著者名/発表者名: 山村智彦
  • 学会等名: 第52回日本小児腎臓病学会学術集会
• [学会発表] Establishment of a comprehensive diagnostic method using next generation sequencer for Alport syndrome (2017)
  • 著者名/発表者名: 山村智彦
  • 学会等名: 13th Asian Congress of Pediatric Nephrology
  • 国際学会