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構造情報を突破口とした 6 量体 ATPase の構造機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 16K21472
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 機能生物化学
生物物理学
研究機関京都産業大学

研究代表者

岸川 淳一  京都産業大学, 総合生命科学部, 研究助教 (80599241)

研究協力者 光岡 薫  
内橋 貴之  
研究期間 (年度) 2016-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2017年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2016年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
キーワード6 量体 ATPase / V-ATPase / 回転分子モーター / 単粒子解析 / 1分子観察 / 電子顕微鏡 / 低温電子顕微鏡 / 6量体 ATPase / AAA+-ATPase / 6量体ATPase / 高速原子間力顕微鏡
研究成果の概要

6量体ATP分解酵素は生体内で様々な反応を担う重要な蛋白質である。6量体で形成されるリングがATP分解に伴い構造変化を起こすことで、基質の認識や切断を行う。その6量体の構造変化の機構は、いまだ不明な点が多い。電子顕微鏡による構造解析や1分子観察を用いて、その機構を明らかにすることを目的とした。
電子顕微鏡による構造解析により、6量体ATP分解酵素の1種であるV-ATPaseの状態の異なる3つ構造を明らかにした。この結果から、反応機構の一部を明らかにした。
人工的な基質を設計し、6量体 ATPaseとの相互作用を観察した結果、両者の相互作用が厳密なものではなく、大雑把なものだということが分かった。

報告書

(3件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Cryo EM structure of intact rotary H+-ATPase/synthase from Thermus thermophilus.2018

    • 著者名/発表者名
      #Nakanishi A, #Kishikawa J (#共同筆頭著者), Tamakoshi M, Mitsuoka K, Yokoyama K.
    • 雑誌名

      Nat Commun.

      巻: 9 号: 1 ページ: 89-89

    • DOI

      10.1038/s41467-017-02553-6

    • NAID

      40021660371

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] General anesthetics cause mitochondrial dysfunction and reduction of intracellular ATP levels.2018

    • 著者名/発表者名
      Kishikawa JI, Inoue Y, Fujikawa M, Nishimura K, Nakanishi A, Tanabe T, Imamura H, Yokoyama K.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 13 号: 1 ページ: e0190213-e0190213

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0190213

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 低温電子顕微鏡を用いた回転分子モーター V 型 ATPase の単粒子解析.2018

    • 著者名/発表者名
      岸川 淳一
    • 雑誌名

      顕微鏡

      巻: 印刷中

    • NAID

      130007686938

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] クライオ電子顕微鏡による液胞型 ATPase (VoV1) の構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一、中西温子、横山謙
    • 雑誌名

      京都産業大学 総合学術研究所所報

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Single particle analysis of V-type ATP synthase2017

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Kishikawa, Atsuko Nakanishi, Kaoru Mitsuoka, Ken Yokoyama
    • 学会等名
      The 1st ABiS Symposium
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター(愛知県・岡崎市)
    • 年月日
      2017-02-19
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 低温電子顕微鏡を用いたトモグラフィ法によるミトコンドリア膜タンパク質複合体の構造解析の試み2017

    • 著者名/発表者名
      岸川 淳一、中西 温子、光岡 薫、横山 謙
    • 学会等名
      第43回生体エネルギー研究会討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] クライオ EM による好熱菌由来 V 型 ATP 合成酵素の単粒子解析2017

    • 著者名/発表者名
      岸川 淳一、中西 温子、光岡 薫、横山 謙
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] de novo 設計した人工コイルドコイルは回転子として機能する2017

    • 著者名/発表者名
      岸川 淳一、 馬場 みほ里、 中西 温子、 横山 謙
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Artificial design of rotary axis reveals the rotation mechanism of rotary motor.2017

    • 著者名/発表者名
      岸川 淳一、馬場 みほ里、中西 温子、横山 謙
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Single Particle Analysis of V-type ATP Synthase.2017

    • 著者名/発表者名
      Jun-cihi Kishikawa
    • 学会等名
      he 1st ABiS Symposium -Towards the Future of Advanced Bioimaging for Life Sciences-
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 人工回転軸の設計とその回転2016

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一
    • 学会等名
      第42回日本生体エネルギー研究会
    • 発表場所
      名古屋工業大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2016-12-19
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 全身麻酔薬は細胞内ATPレベルを減少させる2016

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一、井上勇奎、藤川誠、中西温子、今村博臣、横山謙
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] De novo 設計軸の回転から明らかになったトルク発生機構2016

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一、馬場みほ里、中西温子、横山謙
    • 学会等名
      第54回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The relationship between general anesthetic effects and ATP level in cells.2016

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Kishikawa, Yuki Inoue, Atsuko Nakanishi, Makoto Fujikawa, Hiromi Imamura, Ken Yokoyama
    • 学会等名
      European Bioenergetics Conference 2016
    • 発表場所
      イタリア・リーヴァ・デル・ガルダ
    • 年月日
      2016-07-02
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] De novo 設計人工軸の回転とそこから明らかになったトルク発生の仕組み2016

    • 著者名/発表者名
      岸川淳一、馬場みほ里、中西温子、横山謙
    • 学会等名
      第16回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県・福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 京都産業大学 生体膜エネルギー研究室

    • URL

      http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~yokoken/index-j.htm

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 京都産業大学 研究者データベース

    • URL

      https://gyoseki.kyoto-su.ac.jp/ktsuhp/KgApp?kyoinId=ymbygdoeggy

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書

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公開日: 2016-04-21   更新日: 2019-03-29  

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