• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

オオムギ種子におけるmRNA選択的スプライシングパターンの網羅的解析(国際共同研究強化)

研究課題

研究課題/領域番号 16KK0160
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)

配分区分基金
研究分野 植物分子・生理科学
研究機関東京農工大学

研究代表者

梅澤 泰史  東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (70342756)

研究期間 (年度) 2017 – 2019
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円)
キーワードオオムギ / 種子休眠 / 後熟 / アブシシン酸 / 選択的スプライシング / プロテオーム / リン酸化 / 穂発芽 / スプライシング
研究成果の概要

オオムギをはじめとする穀物種子に見られる穂発芽は、可食部の減少や品質の低下を招くため、農業上大きな問題となっている。植物の種子が発芽するかどうかは、種子休眠の深さに左右される。オオムギの種子は、収穫直後は休眠が深い状態にあるが、後熟期間を経て休眠性が低下する。この休眠制御のメカニズムを調べるために、オーストラリアCSIROの研究者との共同研究を行った。CSIROで保管されていた休眠性の異なるオオムギ種子を用いて比較リン酸化プロテオーム解析やRNA-seq解析を行い、種子の内部で進行するシグナル伝達や遺伝子発現制御の実態を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で行ったオオムギ種子のリン酸化プロテオーム解析によって、オオムギ種子におけるリン酸化タンパク質のデータをこれまでにない規模で収集することに成功した。したがって、種子休眠以外の様々な研究にも有用なデータとなることが期待される。また、これまで種子休眠の研究は遺伝子発現のレベルで行うことが多かったが、本研究ではRNA-seq解析のデータから選択的スプライシングを検出している点が特徴となっている。
オオムギをはじめとする穀物種子の休眠性は、穂発芽等の農業上の問題に関わってくるため重要である。本研究によって、オオムギの種子休眠機構の理解が進めば、将来的に穂発芽の被害軽減につながる可能性がある。

報告書

(2件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 4件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (7件)

  • [国際共同研究] オーストラリア連邦科学産業研究機構(オーストラリア)2018

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Arabidopsis Raf‐like kinases act as positive regulators of subclass III SnRK2 in osmostress signaling2020

    • 著者名/発表者名
      Shohei Katsuta 、Goro Masuda、Hyeokjin Bak、Akihisa Shinozawa、Yoshiaki Kamiyama、Taishi Umezawa、Daisuke Takezawa、Izumi Yotsui、Teruaki Taji、Yoichi Sakata
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 324 号: 2 ページ: 1064-1064

    • DOI

      10.1111/tpj.14756

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A role for PM19-Like 1 in seed dormancy in Arabidopsis2019

    • 著者名/発表者名
      Barrero Jose M.、Dorr Marie M.、Talbot Mark J.、Ishikawa Shinnosuke、Umezawa Taishi、White Rosemary G.、Gubler Frank
    • 雑誌名

      Seed Science Research

      巻: 29 号: 3 ページ: 184-196

    • DOI

      10.1017/s0960258519000151

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparative Phosphoproteomic Analysis Reveals a Decay of ABA Signaling in Barley Embryos during After-Ripening2019

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa Shinnosuke、Barrero Jose M、Takahashi Fuminori、Nakagami Hirofumi、Peck Scott C、Gubler Frank、Shinozaki Kazuo、Umezawa Taishi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 号: 12 ページ: 2758-2768

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz163

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] SnRK2 protein kinases represent an ancient system in plants for adaptation to a terrestrial environment2019

    • 著者名/発表者名
      Shinozawa Akihisa、Otake Ryoko、Takezawa Daisuke、Umezawa Taishi、Komatsu Kenji、Tanaka Keisuke、Amagai Anna、Ishikawa Shinnosuke、Hara Yurie、Kamisugi Yasuko、Cuming Andrew C.、Hori Koichi、Ohta Hiroyuki、Takahashi Fuminori、Shinozaki Kazuo、Hayashi Takahisa、Taji Teruaki、Sakata Yoichi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 2 号: 1 ページ: 30-30

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0281-1

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparative Phosphoproteomic Analysis of Barley Embryos with Different Dormancy during Imbibition2019

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa S, Barrero J, Takahashi F, Peck S, Gubler F, Shinozaki K, Umezawa T.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 20 号: 2 ページ: 451-451

    • DOI

      10.3390/ijms20020451

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] アブシジン酸応答に関わるグループC Raf型タンパク質リン酸化酵素の機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      神山佳明、廣谷美咲、峯岸芙有子、野元美佳、多田安臣、坂田洋一、竹澤大輔、Scott Peck、梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] SnRK2-substrate 1は植物の開花期制御に関与する2019

    • 著者名/発表者名
      片桐壮太郎、鈴木梨沙、飯泉沙良、石塚梢、神山佳明、梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] アブシジン酸応答に関与するSnRK2プロテインキナーゼの活性阻害剤のスクリーニング2019

    • 著者名/発表者名
      松岡頌子、佐藤花綸、今村理世、能年義輝、岡部隆義、梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物学会第83回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ABAシグナル伝達の主要経路に関わるグループC Raf型タンパク質リン酸化酵素の機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      神山佳明、廣谷美咲、峯岸芙有子、野元美佳、多田安臣、坂田洋一、竹澤大輔、Scott Peck、梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物生理学会第60回年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 後熟期におけるオオムギ種子胚の比較リン酸化プロテオーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      "石川慎之祐,Jose Barrero,高橋史憲,中神弘史,Scott Peck,Frank Gubler,篠崎一雄,梅澤 泰史"
    • 学会等名
      日本植物生理学会第60回年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 開花時期の調節におけるSnRK2 substrate1 の機能解析2019

    • 著者名/発表者名
      片桐壮太郎,鈴木梨沙,神山佳明,梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物生理学会第60回年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 低分子化合物スクリーニングによるSnRK2プロテインキナーゼ活性化剤の探索2019

    • 著者名/発表者名
      松岡頌子,佐藤花綸,今村理世,能年義輝,岡部隆義,梅澤泰史
    • 学会等名
      日本植物生理学会第60回年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

URL: 

公開日: 2017-03-15   更新日: 2021-02-19  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi