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近縁種間の遺伝子循環による次世代植物資源の開発と持続的作物生産力の向上

研究課題

研究課題/領域番号 16KT0034
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金
応募区分特設分野
研究分野 食料循環研究
研究機関佐賀大学

研究代表者

藤田 大輔  佐賀大学, 農学部, 准教授 (80721274)

研究分担者 山形 悦透  九州大学, 農学研究院, 准教授 (00600446)
石川 亮  神戸大学, 農学研究科, 准教授 (70467687)
小出 陽平  北海道大学, 農学研究院, 助教 (70712008)
研究期間 (年度) 2016-07-19 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円)
2018年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2017年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2016年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
キーワードイネ / アフリカイネ / 生殖的隔離 / 遺伝子循環 / GWAS / O.glaberrima / ゲノムワイド関連解析 / トビイロウンカ抵抗性 / 出穂性 / 脱粒性 / 次世代植物資源 / 収量構成要素 / 生物的ストレス / 持続的生産力
研究成果の概要

本研究は、(課題1)として、国際稲研究所で維持されているアフリカイネO. glaberrima 150 系統に関して、次世代シークエンサーにより、全ゲノム領域の解読を行い、多数のSNP情報を検出した。(課題2)として、アフリカイネ150系統の生物的ストレス・収量関連形質の特性評価を行った。課題1で得られたSNP情報を用いてゲノムワイド関連解析により、これらの形質に関して関連する遺伝子座を複数検出した。 (課題3)として、次世代植物資源を作出するために、インド型品種Peikuの不稔緩和系統とO. glaberrimaを交雑し、複数の交雑組み合わせにおいてBC1F1種子を得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

研究成果で得られたアフリカイネO.glaberrima150系統のゲノムワイドSNPにより、他の有用形質(耐病性、耐乾性、耐暑性など)に関してもゲノムワイド関連解析が可能となる。また、本研究では、収量関連形質(出穂性、分げつ数、脱粒性など)と耐虫性に関する遺伝的変異が確認され、関連する遺伝子座が推定された。ゲノムワイド関連解析から推定された各形質に関する遺伝子座の情報をもとに、遺伝子特定に向けた研究が促進する。これらの有用遺伝子が関連する領域が詳細に特定され、将来的に、アフリカイネやアジアイネの生産性改良へ貢献することが期待される。

報告書

(5件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件)

  • [国際共同研究] 国際稲研究所(フィリピン)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [国際共同研究] カメルーンJICA/UNVDA(カメルーン)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Lineage-specific gene acquisition or loss is involved in interspecific hybrid sterility in rice2018

    • 著者名/発表者名
      Koide Yohei、Ogino Atsushi、Yoshikawa Takanori、Kitashima Yuki、Saito Nozomi、Kanaoka Yoshitaka、Onishi Kazumitsu、Yoshitake Yoshihiro、Tsukiyama Takuji、Saito Hiroki、Teraishi Masayoshi、Yamagata Yoshiyuki、Uemura Aiko、Takagi Hiroki、Hayashi Yoriko、Abe Tomoko、Fukuta Yoshimichi、Okumoto Yutaka、Kanazawa Akira
    • 雑誌名

      PNAS

      巻: 115 号: 9

    • DOI

      10.1073/pnas.1711656115

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Duplication and Loss of Function of Genes Encoding RNA Polymerase III Subunit C4 Causes Hybrid Incompatibility in Rice2017

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Giao Ngoc、Yamagata Yoshiyuki、Shigematsu Yuko、Watanabe Miyako、Miyazaki Yuta、Doi Kazuyuki、Tashiro Kosuke、Kuhara Satoru、Kanamori Hiroyuki、Wu Jianzhong、Matsumoto Takashi、Yasui Hideshi、Yoshimura Atsushi
    • 雑誌名

      G3

      巻: 7 号: 8 ページ: 2565-2575

    • DOI

      10.1534/g3.117.043943

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり

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公開日: 2016-07-20   更新日: 2023-03-08  

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