水分子によるヘム核酸複合体の酸化触媒作用調節機構の解明と機能設計への応用

• 研究課題/領域番号: 16KT0048
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 特設分野
• 研究分野: 遷移状態制御
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 山本 泰彦 筑波大学, 数理物質系, 教授 (00191453)
• 研究期間 (年度): 2016-07-19 – 2020-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2019年度)
• 配分額: 18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円); 2019年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円); 2018年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2017年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2016年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
• キーワード: 四重鎖DNA / ヘム / G-カルテット / 酸化触媒作用 / テロメア / 機能性核酸 / 触媒機構 / 軸配位子 / 水分子

研究成果の概要

グアニンを豊富に含むDNAが形成する四重鎖DNAとヘムタンパク質の補欠分子族として自然界に遍在するヘムが形成するヘム核酸複合体の酸化触媒作用の分子機構を明らかにした。ヘム核酸複合体のヘムと四重鎖DNAの接触界面に孤立して存在し、ヘム鉄に軸配位子として結合する水分子の解析を通して、水分子からヘム鉄への電子供与が、ヘム核酸複合体のヘム鉄に結合した過酸化水素のO-O結合のヘテロリシスを促進し、結果的に酸化反応活性種である鉄４価オキソポルフィリンπカチオンラジカルの生成を促進することを明かにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ヘム核酸複合体の酸化触媒作用の遷移状態が軸配位子H2Oの電子的性質により調節される機構の解明を通して、H2Oの新しい機能が発見された。当該H2Oは、電子的性質が特異であるだけでなく、ヘム核酸複合体のヘムと四重鎖DNAの接触界面で孤立しているため、その運動性も特異である。これらの知見は、H2Oを利用する新しい反応の発見に役立つことが期待される。また、ヘムが核酸の補欠分子族として機能することから、ヘムタンパク質の機能を変えずにタンパク質部分を核酸で置換することが可能であることが示された。

研究成果

• [国際共同研究] Simon Fraser University(カナダ)
• [国際共同研究] Simon Fraser Univsrsity(Canada)
• [雑誌論文] Characterization of Structure and Catalytic Activity of a Complex between Heme and an All Parallel-Stranded Tetrameric G-Quadruplex Formed from DNA/RNA Chimera Sequence d(TTA)r(GGG)dT (2020)
  • 著者名/発表者名: Hayasaka Kosuke、Shibata Tomokazu、Sugahara Aya、Momotake Atsuya、Matsui Toru、Neya Saburo、Ishizuka Takumi、Xu Yan、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Bulletin of the Chemical Society of Japan 巻: 93 号: 5 ページ: 621-629
  • DOI: 10.1246/bcsj.20200013
  • NAID: 130007842975
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific Binding of an Anionic Phthalocyanine Derivative to G-Quadruplex DNAs (2020)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama Mami、Momotake Atsuya、Kobayashi Nagao、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Chemistry Letters 巻: 49 号: 5 ページ: 530-533
  • DOI: 10.1246/cl.200110
  • NAID: 130007840180
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multimodal Multiphoton Imaging of the Lipid Bilayer by Dye-Based Sum-Frequency Generation and Coherent Anti-Stokes Raman Scattering (2020)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi Takaha、Momotake Atsuya、Hishida Mafumi、Yasui Masato、Yamamoto Yasuhiko、Saiki Toshiharu、Nuriya Mutsuo
  • 雑誌名: Analytical Chemistry 巻: 92 号: 8 ページ: 5656-5660
  • DOI: 10.1021/acs.analchem.0c00673
  • 査読あり
• [雑誌論文] Monitoring the morphological evolution of giant vesicles by azo dye-based sum-frequency generation (SFG) microscopy (2020)
  • 著者名/発表者名: Momotake Atsuya、Mizuguchi Takaha、Hishida Mafumi、Yamamoto Yasuhiko、Yasui Masato、Nuriya Mutsuo
  • 雑誌名: Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 巻: 186 ページ: 110716-110716
  • DOI: 10.1016/j.colsurfb.2019.110716
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of Intermediates in Peroxidase Catalytic Cycle of a DNAzyme Possessing Heme (2019)
  • 著者名/発表者名: Shinomiya Ryosuke、Araki Haruka、Momotake Atsuya、Kotani Hiroaki、Kojima Takahiko、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Bulletin of the Chemical Society of Japan 巻: 92 号: 10 ページ: 1729-1736
  • DOI: 10.1246/bcsj.20190157
  • NAID: 130007728639
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structures and Catalytic Activities of Complexes between Heme and All Parallel-Stranded Monomeric G-Quadruplex DNAs (2018)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto Yasuhiko、Araki Haruka、Shinomiya Ryosuke、Hayasaka Kosuke、Nakayama Yusaku、Ochi Kentaro、Shibata Tomokazu、Momotake Atsuya、Ohyama Takako、Hagihara Masaki、Hemmi Hikaru
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 57 号: 41 ページ: 5938-5948
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00792
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of Catalytic Activities and Heme Coordination Structures of Heme?DNA Complexes Composed of Some Chemically Modified Hemes and an All Parallel-Stranded Tetrameric G-Quadruplex DNA Formed from d(TTAGGG) (2018)
  • 著者名/発表者名: Shinomiya Ryosuke、Katahira Yuya、Araki Haruka、Shibata Tomokazu、Momotake Atsuya、Yanagisawa Sachiko、Ogura Takashi、Suzuki Akihiro、Neya Saburo、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 57 号: 41 ページ: 5930-5937
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00793
  • 査読あり
• [雑誌論文] An Intramolecular Antiparallel G-quadruplex Formed by Human Telomere RNA (2018)
  • 著者名/発表者名: Chao-Da Xiao, Tomokazu Shibata, Yasuhiko Yamamoto, and Yan Xu
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 54 号: 32 ページ: 3944-3946
  • DOI: 10.1039/c8cc01427b
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synergistic Effect of Distal Polar Interactions in Myoglobin and Their Structural Consequences (2018)
  • 著者名/発表者名: Watanabe Miho、Kanai Yuki、Nakamura Shunpei、Nishimura Ryu、Shibata Tomokazu、Momotake Atsuya、Yanagisawa Sachiko、Ogura Takashi、Matsuo Takashi、Hirota Shun、Neya Saburo、Suzuki Akihiro、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 57 号: 22 ページ: 14269-14279
  • DOI: 10.1021/acs.inorgchem.8b02302
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Nuclear Resonance Vibrational Spectroscopic Study of Oxy Myoglobins Reconstituted with Chemically Modified Heme Cofactors: Insights into the Fe?O2 Bonding and Internal Dynamics of the Protein (2018)
  • 著者名/発表者名: Ohta Takehiro、Shibata Tomokazu、Kobayashi Yasuhiro、Yoda Yoshitaka、Ogura Takashi、Neya Saburo、Suzuki Akihiro、Seto Makoto、Yamamoto Yasuhiko
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 57 号: 48 ページ: 6649-6652
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00829
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR of Paramagnetic Compounds (2018)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Yamamoto and Tomokazu Shibata
  • 雑誌名: Experimental Approaches of NMR Spectroscopy, Methodology and Application to Life Science and Materials Science ページ: 491-518
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of Heme Orientational Disorder in a Myoglobin Reconstituted with a Trifluoromethyl-Group-Substituted Heme Cofactor (2017)
  • 著者名/発表者名: 1.Yuki Kanai, Ayaka Harada, Tomokazu Shibata, Ryu Nishimura, Kosuke Namiki, Miho Watanabe, Shunpei Nakamura, Fumiaki Yuymoto, Toshiya Senda, Akihiro Suzuki, Saburo Neya, and Yasuhiko Yamamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: ５６ 号: 34 ページ: 4500-4508
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.7b00457
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of Heme Electronic Structure and Distal Polar Interaction on Functional and Vibrational Properties of Myoglobin (2016)
  • 著者名/発表者名: Y. Kanai, R. Nishimura, K. Nishiyama, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, T. Matsuo, S. Hirota, S. Neya, A. Suzuki, Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Inorg. Chem. 巻: 55 号: 4 ページ: 1613-1622
  • DOI: 10.1021/acs.inorgchem.5b02520
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Ferrous Heme Iron in Deoxy Myoglobin Reconstitutedwith Trifluoromethyl Group-Substituted Heme Cofactors (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, Y. Kanai, R. Nishimura, L. Xu, Y. Moritaka, A. Suzuki, S. Neya, M. Nakamura, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 巻: 55 号: 23 ページ: 12128-12136
  • DOI: 10.1021/acs.inorgchem.6b01360
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Characterization of the interaction between heme and a parallel G-quadruplexDNA formed from d(TTGAGG) (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, Y. Nakayama, Y. Katahira, H. Tai, Y.Moritaka, Y. Nakano, and Y. Yamamoto
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta 巻: - 号: 5 ページ: 1264-1270
  • DOI: 10.1016/j.bbagen.2016.11.005
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] メソ位にトリフルオロメチル基を導入したヘムをもつミオグロビンの研究 (2020)
  • 著者名/発表者名: 村田莉恵、百武篤也、山本泰彦、鈴木秋弘、松尾貴史、廣田俊、根矢三郎
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] 四重鎖DNAとフタロシアニン誘導体の複合体 (2020)
  • 著者名/発表者名: 内山真見、柴田友和、百武篤也、池上崇久、松井亨、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] カチオン性共重合体によるヘム-DNA 複合体のペルオキシダーゼ活性の増大 (2020)
  • 著者名/発表者名: 荒木はるか、百武篤也、山本泰彦、落合拓郎、嶋田直彦、丸山厚
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] ヒトテロメア関連塩基配列のDNA が2 分子で形成する平行型四重鎖DNA およびそのヘムとの複合体の研究 (2020)
  • 著者名/発表者名: 岡本千奈、篠宮僚介、山田果央、百武篤也、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] ヘム-DNA 複合体のペルオキシダーゼ活性におけるPush 効果とPull 効果の相関関係の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 萩原翔太、篠宮僚介、百武篤也、鈴木秋弘、根矢三郎、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] ヘム－DNA 複合体のイミダゾール付加物の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 中島優輔、百武篤也、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会第100春季年会 (2020)
• [学会発表] Deoxyribozyme Possessing Heme (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, H. Araki, K. Hayasaka, S. Nakamura,T. Shibata, A. Momotake, and H. Hemmi
  • 学会等名: 61st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 国際学会
• [学会発表] Structures and Catalytic Activities of DNA Complexes Consisting of Chemically Modified Heme and Tetrameric G-Quadruplex DNA (2019)
  • 著者名/発表者名: R. Shinomiya, A. Momotake, Y. Katahira, H. Araki, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, A. Suzuki, S. Neya, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry (ISABC15)
  • 国際学会
• [学会発表] Heme-DNAzyme (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, R. Shinomiya, H. Araki, T. Shibata, A. Momotake, S. Yanagisawa, T. Ogura, A. Suzuki, S. Neya, and H. Hemmi
  • 学会等名: Commemorative International Symposium of the Japan Society of Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Heme Meets DNA. (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, R. Shinomiya, H. Kotani, H. Araki, A. Momotake, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, H. Hemmi, A. Suzuki, S. Neya, and T. Kojima
  • 学会等名: 19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC-19)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] DNAzyme Possessing Heme (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, R. Shinomiya, H. Araki, T. Shibata, A. Momotake, S. Yanagisawa, T. Ogura, A. Suzuki, and S. Neya
  • 学会等名: The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Enhancement of Peroxidase Activity of Heme-DNAzyme through Interaction with Cationic Copolymers (2019)
  • 著者名/発表者名: H. Araki, A. Momotake, Y. Yamamoto, T. Ochiai, N. Shimada, and A. Maruyama
  • 学会等名: The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Complexes between G-quadruplex DNA and Phthalocyanines (2019)
  • 著者名/発表者名: M. Uchiyama, T. Shibata, A. Momotake, T. Ikeue, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Electronic Control of Myoglobin Function (2019)
  • 著者名/発表者名: T. Sugita, T. Matsuo, S. Hirota, S. Yanagisawa, T. Ogura, O. Shoji, Y. Watanabe, A. Suzuki, S. Neya, A. Momotake, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 17th International Symposium on Blood Substitutes & Oxygen Therapeutics (XVII-ISBS-2019)
  • 国際学会
• [学会発表] ヘムをもつ DNA 酵素 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦、 篠宮僚介、小谷弘明、 荒木はるか、柴田友和、 百武篤也、 柳澤幸子、小倉尚志、逸見光、鈴木秋弘、根矢三郎、小島隆彦
  • 学会等名: 第46回生体分子科学討論会
• [学会発表] 非線形光学イメージングに向けた無蛍光性分子プローブの開発と応用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 百武篤也、水口高翔、塗谷睦生、安井正人、山本泰彦
  • 学会等名: 第46回生体分子科学討論会
• [学会発表] 四重鎖 DNA の形成様式がヘムをもつ DNA 酵素の性質に与える影響 (2019)
  • 著者名/発表者名: 荒川和基、山田果央、片平裕弥、越智健太郎、中山優作、荒木はるか、篠宮僚介、百武篤也、山本泰彦
  • 学会等名: 第46回生体分子科学討論会
• [学会発表] 3'末端に I-カルテットをもつ四重鎖 DNA とヘムの複合体の研究 (2019)
  • 著者名/発表者名: 菅原綾、篠宮僚介、木下真志、柴田友和、百武篤也、山本泰彦、 柳澤幸子、小倉尚志、鈴木秋弘、根矢三郎
  • 学会等名: 第46回生体分子科学討論会
• [学会発表] ヘム鉄の軸配位子としてイミダゾールをもつミオグロビンの研究 (2019)
  • 著者名/発表者名: 杉田達郎、百武篤也、山本泰彦、松尾貴史、廣田俊、鈴木秋弘、根矢三郎、荘司長三、渡辺芳人
  • 学会等名: 第46回生体分子科学討論会
• [学会発表] ヘムをもつDNA 酵素の酸化触媒機構 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦、篠宮僚介、小谷弘明、荒木はるか、柴田友和、百武篤也、柳澤幸子、小倉尚志、鈴木秋弘、根矢三郎、小島隆彦
  • 学会等名: 第13回バイオ関連化学シンポジウム2019
• [学会発表] Structural characterization of deoxyribozyme possessing heme (2019)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, Y. Suzuki, Y. Nakajima, T. Shibata, A. Momotake, S. Neya, and A. Suzuki
  • 学会等名: 第58回NMR討論会(2019)
• [学会発表] 四重鎖DNAとヘムの複合体の酸化触媒機構 (2019)
  • 著者名/発表者名: 菅原綾、篠宮僚介、小谷弘明、荒木はるか、柴田友和、百武篤也、柳澤幸子、小倉尚志、鈴木秋弘、根矢三郎、小島隆彦、山本泰彦
  • 学会等名: 第52回酸化反応討論会
• [学会発表] 四重鎖DNAの形成様式がヘムをもつDNA酵素の性質に与える影響 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山田果央、荒川和基、篠宮僚介、荒木はるか、柴田友和、百武篤也、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第99春季年会 (2019)
• [学会発表] ヘムをもつDNA酵素のヘム鉄に軸配位子として結合する水分子の性質 (2019)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦、篠宮僚介、荒木はるか、柴田友和、百武篤也、柳澤幸子、小倉尚志、鈴木秋弘、根矢三郎、逸見光
  • 学会等名: 日本化学会 第99春季年会 (2019)
• [学会発表] ヘムをもつDNA酵素におけるペルオキシダーゼ活性発現機構の解明 (2019)
  • 著者名/発表者名: 篠宮僚介、百武篤也、柳澤幸子、鈴木秋弘、根矢三郎、小谷弘明、小島隆彦、Sen Dipankar、山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第99春季年会 (2019)
• [学会発表] Redox-catalyzing Deoxyribozymes Composed of Heme and DNAs (2018)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, H. Araki, R. Shinomiya, K. Hayasaka, T. Shibata, A. Momotake, S. Yanagisawa, T. Ogura, H. Hemmi, A. Suzuki, and S. Neya
  • 学会等名: 9th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBiC9)
• [学会発表] Deoxyribozymes Composed of Heme and G-quadruplex DNAs (2018)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, H. Araki, M. Uchiyama, K. Hayasaka, R. Shinomiya, T. Shibata, A. Momotake, M. Hagihara, and H. Hemmi
  • 学会等名: Advances in Noncanonical Nucleic Acids 2018 (ANNA2018)
• [学会発表] ヒトテロメア類似塩基配列の四重鎖DNAとヘムとの複合体の構造と機能の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 荒木はるか、篠宮僚介、柴田友和、逸見光、萩原正規、小倉尚志、柳澤幸子、鈴木秋弘、根矢三郎、Sen Dipankar、山本泰彦
  • 学会等名: 第12回バイオ関連化学シンポジウム2018
• [学会発表] Structure-function investigation of deoxyribozymes composed of heme and G-quadruplex DNAs (2018)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, H. Araki, K. Hayasaka, R. Shinomiya, Y. Nakayama, K. Ochi, T. Shibata, A. Momotake, M. Hagihara, D. Sen, and H. Hemmi
  • 学会等名: 第57回NMR討論会(2018)
• [学会発表] キメラ塩基配列d(TTA)r(GGG)d(T)の四重鎖とヘムの複合体 (2018)
  • 著者名/発表者名: 早坂 公佑、柴田 友和、松井 亨、山本 泰彦、逸見 光、石塚 匠、徐 岩
  • 学会等名: 第20回 RNA学会年会 (RNA2018 OSAKA)
• [学会発表] ヘムの化学修飾がミオグロビンの酸化還元電位に与える影響 (2018)
  • 著者名/発表者名: 中村 朝香、中村 俊平、柴田 友和、山本 泰彦、鈴木 秋弘、根矢 三郎、三重 安弘
  • 学会等名: 第45回生体分子科学討論会
• [学会発表] Characterization of Peroxidase Activities and Structures of Complexes between Chemically Modified Hemes and G-quadruplex DNA Formed from d(TTAGGG) (2018)
  • 著者名/発表者名: R. Shinomiya, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, S. Neya, A. Suzuki, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 43rd International Conference on Coordination Chemistry (ICCC2018)
• [学会発表] Characterization of Catalytic Activities and Heme Coordination Structures of Heme-DNA complexes Composed of Chemically-modified Hemes and an All Parallel G-quadruplex DNA [d(TTAGGG)]4 (2018)
  • 著者名/発表者名: R. Shinomiya, T. Shibata, S. Yanagisawa, T. Ogura, S. Neya, A. Suzuki, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: Tsukuba Global Science Week 2018 (TGSW2018)
• [学会発表] Characterization of G-quadruplex formed from Chimeric Sequence d(TTA)r(GGG)d(T) and its Complex with Heme (2018)
  • 著者名/発表者名: K. Hayasaka, T. Shibata, T. Matsui, Y. Yamamoto, H. Hemmi, T. Ishizuka, and Y. Xu
  • 学会等名: Tsukuba Global Science Week 2018 (TGSW2018)
• [学会発表] Structural Characterization of G-Quadruplex DNAs Formed from Human Telomere-Related Sequences and Their Complexes with Heme (2017)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, K. Ochi, T. Shibata, H. Hemmi, and M. Hagihara
  • 学会等名: 58th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference (ENC)
  • 発表場所: Asilomar Conference Center (California, USA)
  • 年月日: 2017-03-26
• [学会発表] DNA塩基配列がヘム-DNA複合体の構造と機能に与える影響 (2017)
  • 著者名/発表者名: 片平祐弥，柴田友和, 松井亨, 守橋健二, 渡部明莉, 中尾知美, 柳澤幸子, 小倉尚志, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第97春季年会(2017)
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] 種々のフッ素化ヘムと四重鎖DNA[d(TTAGGG)]4の複合 体の機能と構造 (2017)
  • 著者名/発表者名: 篠宮僚介, 片平祐弥, 柴田友和, 小倉尚志, 柳澤幸 子, 中尾知美, 鈴木秋弘, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第97春季年会(2017)
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] ヘムの系統的化学修飾および遠位アミノ酸置換がミオグロビンの機能に与える影響 (2017)
  • 著者名/発表者名: 渡邉美帆, 金井佑生, 西村龍, 柴田友和, 松尾貴史, 廣田俊, 柳澤幸子, 小倉尚志, 鈴木秋弘, 根矢三郎, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第97春季年会(2017)
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] デオキシミオグロビンとデオキシ西洋わさびペルオキシダーゼにおけるヘムの電子状態の比較 (2017)
  • 著者名/発表者名: 並木孝介, 柴田友和, 鈴木秋弘, 根矢三郎, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第97春季年会(2017)
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] ヘムと四重鎖DNAの複合体の構造解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 越智健太郎, 山本泰彦, 柴田友和, 萩原正規, 逸見光
  • 学会等名: 日本化学会 第97春季年会(2017)
  • 発表場所: 慶応義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2017-03-16
• [学会発表] Characterization of peroxidase cycle through a change in electron density of heme atom (2017)
  • 著者名/発表者名: 1.Kosuke Namiki, Tomokazu Shibata, Saburo Neya, Akihiro Suzuki, and Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: 6th Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry
  • 国際学会
• [学会発表] Heme-DNA Complexes (2017)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Yamamoto, Tomokazu Shibata, Yuya Katahira, Kentaro Ochi, Yusaku Nakayama, Hulin Tai, Akari Watanabe, Tomomi Nakao, Sachiko Yanagisawa, Takashi Ogura, Hikaru Hemmi, Masaki Hagihara, Akihiro Suzuki, and Saburo Neya
  • 学会等名: 14th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry(ISABC14)
  • 国際学会
• [学会発表] ミオグロビンにおけるヘム配向の決定機構の解明 (2017)
  • 著者名/発表者名: 中村俊平、金井佑生、原田彩佳、柴田友和、西村龍、並木孝介、渡邉美帆、湯本史明、千田俊哉、鈴木秋弘、根矢三郎、山本泰彦
  • 学会等名: 第44回生体分子科学討論会
• [学会発表] ヘムの電子構造および遠位アミノ酸変異がミオグロビンの機能調節に与える影響 (2017)
  • 著者名/発表者名: 渡邉美帆、金井佑生、西村龍、柴田友和、松尾貴史、廣田俊、柳澤幸子、小倉尚志、鈴木秋弘、根矢三郎、山本泰彦
  • 学会等名: 錯体化学会 第67回討論会
• [学会発表] ミオグロビンのオキシ体における共鳴混成体の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 長谷川和康、齋藤真器名、瀬戸誠、小林康浩、太田雄大、柳澤幸子、小倉尚志、山本泰彦、柴田友和、根矢三郎、鈴木秋弘
  • 学会等名: 錯体化学会 第67回討論会
• [学会発表] Heme as a Prosthetic Group of DNAzymes (2017)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: The First University of Tsukuba and University of Grenoble-Alpes Joint Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヘム軸配位子ヒスチジンの電子構造における共鳴がミオグロビンの外部配位子識別に与える影響 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦、田口耕太朗、鳥澤真鈴、渡邉美帆、西村龍、柴田友和、鈴木秋弘、根矢三郎、逸見光
  • 学会等名: 第56回 NMR討論会(2017)
• [学会発表] 四重鎖DNAとヘムが拓く物質科学 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦
  • 学会等名: エネルギー物質科学研究センター（TREMS）スタートアップミーティング
  • 招待講演
• [学会発表] 四重鎖DNAとヘムの相互作用が拓く物質科学 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦
  • 学会等名: 第一回プレ戦略研究会「次世代物質・デバイス戦略開発拠点」
  • 招待講演
• [学会発表] Characterization of Complexes between heme and G-Quadruplex DNAs Formed from Human Telomere-Related Sequences (2017)
  • 著者名/発表者名: Tomokazu Shibata, Kentaro Ochi, Haruka Araki, Yusaku Nakayama, Ryosuke Shinomiya, Sachiko Yanagisawa, Takashi Ogura, Hikaru Hemmi, Dipankar Sen, and Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: The second international symposium on biofunctional chemistry(ISBC2017)
• [学会発表] Characterization of Peroxidase Activities and Structures of Complexes, between Chemically Modified Hemes and All Parallel G-Quadruplex DNA, formed from d(TTAGGG) (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryosuke Shinomiya, Tomokazu Shibata, Sachiko Yanagisawa, Takashi Ogura, Akihiro Suzuki, Saburo Neya, Dipankar Sen, and Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: The second international symposium on biofunctional chemistry(ISBC2017)
• [学会発表] ヘムタンパク質の電子論 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦
  • 学会等名: 生命の機能とかたち、連携セミナーシリーズ第４回
  • 招待講演
• [学会発表] Characterization of Complexes between Heme and G-quadruplex DNAs (2017)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko Yamamoto Tomokazu Shibata, Yusaku Nakayama Ryosuke Shinomiya and Haruka Araki
  • 学会等名: 2018 Joint Symposium on Energy Materials Science and Technology (Workshop of Pre-Strategic Initiatives)
  • 招待講演
• [学会発表] Characterization of Peroxidase Activities and Heme Coordination Structures of Complexes between Chemically Modified Hemes and G-quadruplex DNA formed from d(TTAGGG) (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryosuke Shinomiya, Tomokazu Shibata, Takashi Ogura, Sachiko Yanagisawa, Akihiro Suzuki, Saburo Neya, Dipankar Sen, and Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: 2018 Joint Symposium on Energy Materials Science and Technology (Workshop of Pre-Strategic Initiatives)
• [学会発表] Characterization of Heme Orientational Disorder in a Myoglobin Reconstituted with a fluorinated Heme Cofactor (2017)
  • 著者名/発表者名: Shunpei Nakamura, Yuki Kanai, Ayaka Harada, Tomokazu Shibata, Ryu Nishimura, Fumiaki Yumoto, Toshiya Senda, Akihiro Suzuki, Saburo Neya, and Yasuhiko Yamamoto
  • 学会等名: 2018 Joint Symposium on Energy Materials Science and Technology (Workshop of Pre-Strategic Initiatives)
• [学会発表] 化学修飾ヘムと四重鎖DNA [d(TTAGGG)]4 の複合体のペルオキシダーゼ活性およびヘム配位構造の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 篠宮僚介, 柴田友和, 小倉尚志, 柳澤 幸子, 鈴木秋弘, 根矢三郎, Sen Dipankar, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第98春季年会 (2018)
• [学会発表] ヒトテロメア類似塩基配列の四重鎖DNAとヘム複合体のNMR分光法による構造解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 山本泰彦, 荒木はるか, 中山優作, 越智健太郎, 柴田友和, 逸見光, 萩原正規、Sen Dipankar
  • 学会等名: 日本化学会 第98春季年会 (2018)
• [学会発表] ヒトテロメア類似塩基配列の四重鎖DNAとヘム複合体のペルオキシダーゼ活性と構造の関係の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 荒木はるか, 中山優作, 越智健太郎, 篠宮僚介, 柴田友和, 逸見光, 萩原正規, 小倉尚志, 柳澤幸子, 鈴木秋弘, 根矢三郎、Sen Dipankar, 山本泰彦
  • 学会等名: 日本化学会 第98春季年会 (2018)
• [学会発表] Characterization of Complexes between Hemes and Parallel G-Quadruplex DNAs (2016)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamamoto, T. Shibata, Y. Katahira, Y. Nakayama, H. Tai, T. Matsui, K. Morihashi, A. Watanabe, T. Nakao, S. Yanagisawa, T. Ogura, A. Suzuki, S. Neya
  • 学会等名: 8th Asian Bioligical Inorganic Chemistry Conference(AsBIC 8)
  • 発表場所: The University of Auckland (Auckland, New Zealand)
  • 年月日: 2016-12-04
  • 国際学会
• [学会発表] ヘムと四重鎖DNAの複合体の構造解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 越智健太郎, 柴田友和, 逸見光, 萩原正規, 山本泰彦
  • 学会等名: 第55回NMR討論会(2016)
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島県広島市）
  • 年月日: 2016-11-16
• [学会発表] Structural characterization of Catalytic DNAs Composed of Heme and Parallel G-quadruplexes (2016)
  • 著者名/発表者名: Katahira, T. Shibata, T. Matsui, K. Morihashi, A. Watanabe, T. Nakao, S. Yanagisawa, T. Ogura, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: 第43回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC 2016)
  • 発表場所: 熊本大学工学部百周年記念館（熊本県熊本市）
  • 年月日: 2016-09-27
  • 国際学会
• [学会発表] Effects of DNA Sequence Alteration on Structure of a Complex between Heme and All-Parallel G-Quadruplex (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, Y. Nakano, Y. Moritaka, Y. Nakayama, Y. Katahira, H. Tai, and ○Y. Yamamoto
  • 学会等名: 第43回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC 2016)
  • 発表場所: 熊本大学工学部百周年記念館（熊本県熊本市）
  • 年月日: 2016-09-27
  • 国際学会
• [学会発表] ヘムと平行型四重鎖DNAの複合体の構造および機能の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 柴田 友和，片平 祐弥，山本 泰彦
  • 学会等名: 第17回若手NMR研究会
  • 発表場所: 箱根高原ホテル（神奈川県足柄下郡箱根町）
  • 年月日: 2016-09-10
• [学会発表] ヘムと四重鎖DNAの複合体の触媒機能測定と構造解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山本 泰彦，片平 祐弥，中山 優作，柴田 友和，渡部 明莉，中尾 知美，柳澤 幸子，小倉 尚志，鈴木 秋弘，根矢 三郎
  • 学会等名: 第10回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 石川県立音楽堂（石川県金沢市）
  • 年月日: 2016-09-07
• [学会発表] Structural and Functional Characterization of Complexes between Heme and G-quadruplex DNAs Formed from Human Telomere-related Sequences (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Shibata, Y. Katahira, H. Hemmi, and Y. Yamamoto
  • 学会等名: The 27th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems(ICMRBS2016)
  • 発表場所: 京都国際会館（京都府京都市）
  • 年月日: 2016-08-21
  • 国際学会
• [図書] Experimental Approaches of NMR Spectroscopy, Methodology and Application to Life Science and Materials Science (2018)
  • 著者名/発表者名: Akira Naito, Tetsuo Asakura, Ichio Shimada, Kiyonori Takegoshi, and Yasuhiko Yamamoto
  • 総ページ数: 636
  • 出版者: Springer
  • ISBN: 9789811059650
• [備考] 筑波大学 数理物質系 生物無機化学研究室
  • URL: http://www.chem.tsukuba.ac.jp/yamamoto/
• [備考] http://www.chem.tsukuba.ac.jp/yamamoto/