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核酸鋳型化学反応の遷移状態制御に基づく触媒回転数の向上

研究課題

研究課題/領域番号 16KT0052
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金
応募区分特設分野
研究分野 遷移状態制御
研究機関名古屋大学

研究代表者

阿部 洋  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (80415067)

研究分担者 木村 康明  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (80769977)
研究期間 (年度) 2016-07-19 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2018年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2017年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2016年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
キーワード核酸プローブ / 蛍光プローブ / 核酸鋳型反応 / 触媒回転数 / RNAプローブ / RNA / 鋳型反応 / DNA / 蛍光 / センサー / 遷移状態 / 触媒 / 増幅
研究成果の概要

核酸鋳型反応に基づく発蛍光反応は、RNA検出プローブの最も基本的な作用原理の一つである。この方法では、反応性官能基を持つ核酸プローブと、保護基で蛍光を抑えた蛍光前駆体を持つ核酸プローブが、標的RNA上で会合し、保護基除去反応が進行することで蛍光を発する。この発蛍光反応は、標的RNA存在下で特異的に起こるため、RNA検出プローブの作用原理となる。本研究では高感度な細胞内RNA検出を目指し、①核酸鋳型反応の高速化、②リポフェクションを用いない核酸プローブの細胞内投与法の開発に取り組んだ。①では反応の求核剤を適切に選択することで、②では核酸のリン酸部をチオ化することで、有望な結果が得られた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

RNA検出法は、病気の診断、ウイルスの検出、細胞現象の解明など、様々な分野で重要な技術である。RNA検出では、いかに微量な標的RNAを検出できるか、すなわち検出感度の高感度化が重要な課題である。核酸検出プローブの作用原理である核酸鋳型反応の高速化により、高感度化が可能になるが、本研究ではその反応の高速化の指針を見出すことに成功した。また、核酸プローブの細胞投与において、既存の手法では望みでない蛍光シグナルを発してしまう問題があるが、本研究で開発した新たな投与法により、その問題を回避することが可能になった。両成果は、細胞内で微量なRNAの検出を可能にする技術の開発において重要な結果である。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Disulfide-Unit Conjugation Enables Ultrafast Cytosolic Internalization of Antisense DNA and siRNA2019

    • 著者名/発表者名
      Shu Zhaoma、Tanaka Iku、Ota Azumi、Fushihara Daichi、Abe Naoko、Kawaguchi Saki、Nakamoto Kosuke、Tomoike Fumiaki、Tada Seiichi、Ito Yoshihiro、Kimura Yasuaki、Abe Hiroshi
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 印刷中 号: 20 ページ: 6611-6615

    • DOI

      10.1002/anie.201900993

    • NAID

      130007841763

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural optimization of pseudorotaxane-forming oligonucleotides for efficient and stable complex formation2018

    • 著者名/発表者名
      Onizuka Kazumitsu、Miyashita Takuya、Chikuni Tomoko、Ozawa Mamiko、Abe Hiroshi、Nagatsugi Fumi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 46 号: 17 ページ: 8710-8719

    • DOI

      10.1093/nar/gky744

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 高効率な核酸検出を可能にする核酸鋳型反応の開発2017

    • 著者名/発表者名
      伊藤真央 柴田綾 阿部奈保子 木村康明 阿部洋
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2017-03-26
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書

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公開日: 2016-07-20   更新日: 2023-03-08  

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