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人工遺伝子回路を用いた細胞パターン形成機構の構成的理解

研究課題

研究課題/領域番号 16KT0080
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金
応募区分特設分野
研究分野 構成的システム生物学
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

戎家 美紀  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, ユニットリーダー (00544933)

研究期間 (年度) 2016-07-19 – 2019-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2018年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2019年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2018年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2017年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2016年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワードパターン形成 / 反応拡散 / Nodal-Lefty / 人工遺伝子回路
研究実績の概要

本研究では、反応拡散機構で哺乳類培養細胞上に空間パターンを作ることを目指して、Nodal-Leftyシグナルの反応拡散系を単純化した人工遺伝子回路をHEK293細胞上に作製した。この人工遺伝子回路は、Nodal(アクチベーター)、Lefty(インヒビター)、Co-receptor、下流の転写因子、ルシフェラーゼレポーター、という5つの遺伝子部品から成っており、いわゆるアクチベーター・インヒビター型の反応拡散回路になっている。この人工遺伝子回路を組み込んだ細胞では、レポーター陽性ドメインと陰性ドメインから成るパターンが自発的に形成され、維持される様子が観察できた。そこでこのパターン形成の機構を調べるため、NodalとLeftyの細胞外分布を測定したところ、Nodalの細胞外分布は、Leftyにくらべて3分の1程度と非常に狭いことがわかった。これは、Nodalタンパク質内のFinger1と呼ばれるドメインのせいだとわかった。実際、NodalのFinger1ドメインをLeftyに移植すると、Leftyの分布が狭くなり、パターン形成も阻害された。さらに、実測・推定した生化学パラメーターを用いて数理モデルを構築し、パターン形成の条件を考察した。以上の結果は、世界初の哺乳類細胞における人工反応拡散パターンの作成例と言え、これらの成果は2018年12月にNature Communications誌上で発表した(Sekine et al, Nat Commun, 9, 5456, 2018)。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 2016 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2019 2018 2017 2016 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 8件、 招待講演 11件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Synthetic developmental biology: build and control multicellular systems2019

    • 著者名/発表者名
      Ebrahimkhani MR、戎家美紀
    • 雑誌名

      Curr Opin Chem Biol

      巻: 52 ページ: 9-15

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthetic mammalian pattern formation driven by differential diffusivity of Nodal and Lefty2018

    • 著者名/発表者名
      関根亮二、柴田達夫、戎家美紀
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 5456-5456

    • DOI

      10.1038/s41467-018-07847-x

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] What does time mean in development?2018

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀、James Briscoe
    • 雑誌名

      Development

      巻: 145 号: 12

    • DOI

      10.1242/dev.164368

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Human Time vs. Mouse Time with in vitro Segmentation Clock2019

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      EMBLEMBO symposium: Synthetic morphogenesis
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Human time vs. Mouse time: in vitro segmentation clock as a model system2019

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      RIKEN BDR Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mouse time vs. Elephant time: in vitro segmentation clock as a model2018

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      EMBO workshop: Size and Shape
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Human Time vs. Mouse Time in the Segmentation Clock2018

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      EMBO workshop: Molecular Mechanisms of Regenerative and Developmental Biology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 人工遺伝子回路で発生現象を培養細胞上に再構成する2018

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      分子ロボティクス研究会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 発生現象を細胞「で」つくる2017

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      細胞を創る会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Reconstitution of developmental mechanisms with synthetic gene circuits2017

    • 著者名/発表者名
      Miki Ebiusya
    • 学会等名
      Morphogenetic Engineering
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 発生現象を培養細胞上で再構成する2017

    • 著者名/発表者名
      戎家美紀
    • 学会等名
      バイオエンジニアリング講演会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synthetic cell-cell communications mimicking multicellular development2017

    • 著者名/発表者名
      Miki Ebisuya
    • 学会等名
      aDVANCES IN SYSTEMS AND SYNTHETIC BIOLOGY
    • 発表場所
      リヨン(フランス)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Reconstitution of developmental mechanisms in cell culture2016

    • 著者名/発表者名
      Miki Ebisuya
    • 学会等名
      International Conference on Systems Biology
    • 発表場所
      バルセロナ(スペイン)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synthetic cell pattern formation2016

    • 著者名/発表者名
      Miki Ebisuya
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(筑波)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考]

    • URL

      https://www.embl.es/research/unit/ebisuya/index.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

URL: 

公開日: 2016-07-20   更新日: 2025-02-13  

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