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線虫ゲノム機能解析情報に基づく発生メカニズムの解析

研究課題

研究課題/領域番号 17017038
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

杉本 亜砂子  独立行政法人理化学研究所, 発生ゲノミクス研究チーム, チームリーダー (80281715)

研究分担者 大浪 修一  独立行政法人理化学研究所, 発生システムモデル化研究チーム, チームリーダー (50348843)
木村 暁  慶應義塾大学, 大学院・理工学研究科, 助手 (10365447)
京田 耕司  独立行政法人理化学研究所, 合成ゲノミクス研究チーム, 研究員 (30415145)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
101,800千円 (直接経費: 101,800千円)
2009年度: 19,200千円 (直接経費: 19,200千円)
2008年度: 19,100千円 (直接経費: 19,100千円)
2007年度: 18,900千円 (直接経費: 18,900千円)
2006年度: 18,600千円 (直接経費: 18,600千円)
2005年度: 26,000千円 (直接経費: 26,000千円)
キーワードゲノム / 遺伝子 / 発生・分化 / モデル化 / ライブイメージング / 画像処理 / バイオイメージインフォマティクス / 線虫 / RNAi / 細胞分裂 / 表現型 / 胚発生
研究概要

個体発生を制御する遺伝子ネットワークを明らかにするために、線虫C.elegansの初期発生をモデル系として、1)表現型を定量的に解析するためのツール(蛍光標識タンパク質発現株、抗体ライブラリー等)およびイメージング技術の確立とイメージングデータ取得、2)表現型データのコンピューター解析、3)定量的表現型解析とシミュレーションを組み合わせた研究戦略の開発、を実施した。

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (109件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (34件) (うち査読あり 24件) 学会発表 (59件) 図書 (12件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] The Role of Protein Phosphatase 4 (PP4) in Regulating Microtubule Severing in the Caenorhabditis elegans Embryo.2009

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto A. (6名中5番目)
    • 雑誌名

      Genetics 181

      ページ: 933-943

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clearance of germ granules in the soma2009

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 雑誌名

      F1000 Biology Reports 2009 1:49

      ページ: 1-3

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] 線虫における生殖顆粒の形成と配分2009

    • 著者名/発表者名
      花澤桃世
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 54巻

      ページ: 2147-2152

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] A new mechanism controlling kinetochore-microtubule interactions revealed by comparison of two dynein-targeting components: SPDL-1 and the Rod/Zwilch/Zw10 complex.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto A. (13名中6番目)
    • 雑誌名

      Genes Dev 22

      ページ: 2385-2399

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient production of monoclonal antibodies recognizing specific structures in Caenorhabditis elegans embryos using an antigen subtraction method2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto A. (5名中5番目)
    • 雑誌名

      Genes Cells 13

      ページ: 653-665

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Caenorhabditis elegans DDX-23, a homolog of yeast splicing factor PRP28, is required for the sperm-oocyte switch and differentiation of various cell types2008

    • 著者名/発表者名
      Konishi, T., Uodome, N., Sugimoto A.
    • 雑誌名

      Dev Dyn 237

      ページ: 2367-2377

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new mechanism controlling kinetochore-microtubule interactions revealed by comparison of two dynein-targeting components : SPDL-1 and the Rod/Zwilch/ZW1O complex2008

    • 著者名/発表者名
      Reto Gassmann
    • 雑誌名

      Genes and Development 22

      ページ: 2385-2399

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Caenorhabditis elegans DDX-23, a homolog of yeast splicing factor PRP28, is required for the sperm-oocyte switch and differentiation of various cell types2008

    • 著者名/発表者名
      Takafumi Konishi
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics 237

      ページ: 2367-2377

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient production of monoclonal antibodies recognizing specific structures in Caenorhabditis elegans embryos using an antigen subtraction method2008

    • 著者名/発表者名
      Kazumasa Takeda
    • 雑誌名

      Genes to Cells 13

      ページ: 653-665

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Role of Protein Phosphatase 4 (PP4) in Regulating Microtubule Severing in the Caenorhabditis elegans Embryo.2008

    • 著者名/発表者名
      Xue Han
    • 雑誌名

      Genetics (in press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] EGG-3 regulates cell-surface and cortex rearrangements during egg activation in Caenorhabditis elegans.2007

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto A. (14名中13番目)
    • 雑誌名

      Curr Biol 17

      ページ: 1555-1560

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A system for measuring cell division patterns of early Caenorhabditis elegans embryos by using image processing and object tracking2007

    • 著者名/発表者名
      Hamahashi, S., Kitano, H., Onami, S.
    • 雑誌名

      Systems and Computers in Japan 38(11)

      ページ: 12-24

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 線虫Caenorhabditis elegans初期胚の細胞分裂パターン計測システムのリコンフィギャラブルシステムによる高速化2007

    • 著者名/発表者名
      大浪修一(6名中5番目)
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌D J90-D

      ページ: 2970-2980

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Local cortical pulling-force repression switches centrosomal centration and posterior displacement in C. elegans2007

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., Onami, S.
    • 雑誌名

      J. Cell Biol. 179

      ページ: 1347-1354

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] EGG-3 regulates cell-surface and cortex rearrangements during egg activation in Caenorhabditis elegans.2007

    • 著者名/発表者名
      Maruyama, R., A. Sugimoto, et. al.
    • 雑誌名

      Current Biology 17

      ページ: 1555-1560

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A system for measuring cell division patterns of early Caenorhabditis elegans embryos by using image processing and object tracking.2007

    • 著者名/発表者名
      Hamahashi, S., Kitano, H., and Onami, S.
    • 雑誌名

      Systems and Computers in Japan 38(11)

      ページ: 12-24

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 線虫Caenorhabditis elegans初期胚の細胞分裂パターン計測システムのリコンフィギャラブルシステムによる高速化2007

    • 著者名/発表者名
      福島知紀, 大浪修一, 他4名
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌D J90-D

      ページ: 2970-2980

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Local cortical pulling-force repression switches centrosomal centration and posterior displacement in C. elegans2007

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., and Onami, S.
    • 雑誌名

      The Journal of Cell Biology 179

      ページ: 1347-1354

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two phases of astral microtubule activity during cytokinesis in C. elegans embryos2006

    • 著者名/発表者名
      Motegi, F., Velarde, N.V., Piano, F., Sugimoto A.
    • 雑誌名

      Dev. Cell 10

      ページ: 509-20

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequential functioning of ECT-2/RhoGEF, RHO-1 and CDC-42 establishes cell polarity in C. elegans embryos2006

    • 著者名/発表者名
      Motegi, F., Sugimoto A.
    • 雑誌名

      Nat Cell Biol 8

      ページ: 978-985

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 画像処理とオブジェクトトラッキングを用いた線虫の初期胚の細胞分裂パターン計測システム2006

    • 著者名/発表者名
      濱橋秀互, 北野宏明, 大浪修一
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌D J89-D

      ページ: 1248-1259

    • NAID

      110007385841

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Genome-wide prediction of genetic interactions in a metazoan.2006

    • 著者名/発表者名
      Onami, S., Kitano, H.
    • 雑誌名

      Bioessays 28

      ページ: 1087-1090

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequential functioning of ECT-2 RhoGEF, RHO-1 and CDC-42 establishes cell polarity in Caenorhabditis elegans embryos.2006

    • 著者名/発表者名
      Motegi, F., Sugimoto, A.
    • 雑誌名

      Nature Cell Biology 8

      ページ: 978-985

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Two Phases of Astral Microtubule Activity during Cytokinesis in C. elegans Embryos.2006

    • 著者名/発表者名
      Motegi, F., Velarde, N.V., Piano, F., Sugimoto, A.
    • 雑誌名

      Developmental Cell 10

      ページ: 509-520

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 画像処理とオブジェクトトラッキングを用いた線虫の初期胚の細胞分裂パターン計測システム2006

    • 著者名/発表者名
      濱橋秀互, 北野宏明, 大浪修一
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 D, J89-D

      ページ: 1248-1259

    • NAID

      110007385841

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome-wide prediction of genetic interactions in a metazoan2006

    • 著者名/発表者名
      Onami, S., Kitano, H.
    • 雑誌名

      Bioessays 28

      ページ: 1087-1090

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The C. elegans eyes absent ortholog EYA-1 is required for tissue differentiation and plays partially redundant roles with PAX-6.2005

    • 著者名/発表者名
      Furuya, M., Qadota, H., Chisholm, A.D., Sugimoto A.
    • 雑誌名

      Dev Biol 286

      ページ: 452-463

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Objective measurement of spindle orientation in early Caenorhabditis elegans embryos.2005

    • 著者名/発表者名
      Hamahashi, S., Onami, S.
    • 雑誌名

      Genome Inform 16

      ページ: 86-93

    • NAID

      130003997415

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2005 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of nuclei in 4D Nomarski DIC microscope images of early Caenorhabditis elegans embryos using local image entropy and object tracking.2005

    • 著者名/発表者名
      Hamahashi, S., Onami, S., Kitano, H.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 6

      ページ: 125-125

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2005 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Computer simulations and image processing reveal length-dependent pulling force as the primary mechanism for C. elegans male pronuclear migration.2005

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., Onami, S.
    • 雑誌名

      Dev Cell 8

      ページ: 765-75

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Caenorhabditis elegans geminin homologue participates in cell cycle regulation and germ line development.2005

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto A. (9名中6番目)
    • 雑誌名

      J Biol Chem 280

      ページ: 19689-94

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The C.elegans eyes absent ortholog EYA-1 is required for tissue differentiation and plays partially redundant roles with PAX-6.2005

    • 著者名/発表者名
      Furuya, M., Qadota, H., Chisholm, A.D., Sugimoto, A.
    • 雑誌名

      Dev Biol 286

      ページ: 452-463

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Computer simulations and image processing reveal length-dependent pulling force as the primary mechanism for C.elegans male pronuclear migration.2005

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., Onami, S.
    • 雑誌名

      Dev Cell 8

      ページ: 765-775

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Caenorhabditis elegans geminin homologue participates in cell cycle regulation and germ line development.2005

    • 著者名/発表者名
      Yanagi, K., Mizuno, T., Tsuyama, T., Tada, S., Iida, Y., Sugimoto, A., Eki, T., Enomoto, T., Hanaoka, F.
    • 雑誌名

      J Biol Chem 280

      ページ: 19689-19694

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] Assembly of germ granules in C.elegans2010

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      Temasek Life Science Laboratory Seminar
    • 発表場所
      Singapore, Singapore
    • 年月日
      2010-02-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 画像解析を活用した細胞・発生生物学研究の可能性2010

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      定量生物学の会第二回年会
    • 発表場所
      大阪府吹田市 大阪大学
    • 年月日
      2010-01-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide collection of quantitative information about cell division dynamics in RNAi-treated C. elegans embryo.2010

    • 著者名/発表者名
      Onami, S.
    • 学会等名
      Sino-Japan Workshop, Systems Biology and Complex Diseases
    • 発表場所
      Shanghai, China.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Quantitative cell division dynamics information from early C.elegans embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-14
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Live cell imaging and image-processing enable quantitative and computational analysis of the development2009

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-11
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 定量・計算解析による発生ダイナミクスの理解2009

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      日本機械学会第22回計算力学講演会CMD2009
    • 発表場所
      石川県金沢市 金沢大学
    • 年月日
      2009-12-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] C.elegans PGL proteins mediate germ granule formation via their RNA-binding and self-aggregation abilities2009

    • 著者名/発表者名
      Momoyo Hanazawa
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜、神奈川
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Structure-function analysis of PGL-3 that play a crucial role in germ granule formation in C.elegans2009

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Yonetani
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative measurement and analysis of cell division dynamics information of early C.elegans embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative analysis of cell division pattern of C.elegans early RNAi embryo from time-lapse 2-D DIC microscope images in public database by using image processing2009

    • 著者名/発表者名
      Takuya Maeda
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Physical mechanism of cell rounding in C.elegans embryo2009

    • 著者名/発表者名
      Masashi Fujita
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      Yokohama, Kanagawa
    • 年月日
      2009-12-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 線虫C.elegans初期胚の細胞分裂ダイナミクスの定量解析2009

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      第19回日本数理生物学会大会
    • 発表場所
      東京都目黒区 東京大学
    • 年月日
      2009-09-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Computational analysis of quantitative information of cell division dynamics of early embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      17th International C.elegans Meeting
    • 発表場所
      Los Angels, California, USA
    • 年月日
      2009-06-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Self-aggregation of PGL proteins plays a crucial role in P granule assembly.2009

    • 著者名/発表者名
      Hanazawa, M., M. Yonetani, A. Sugimoto.
    • 学会等名
      17th International C. elegans Meeting.
    • 発表場所
      Los Angeles, California, USA.
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Self-aggregation of PGL proteins plays a crucial role in P granule assembly2009

    • 著者名/発表者名
      Momoyo Hanazawa
    • 学会等名
      17th International C.elegans Meeting
    • 発表場所
      Los Angels, California USA
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Structure-function analysis of PGL-3 that play a crucial role in P granule formation2009

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Yonetani
    • 学会等名
      17th International C.elegans Meeting
    • 発表場所
      Los Angels, California USA
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Identification of γ-tubulin complexes in C.elegans embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Terasawa
    • 学会等名
      17th International C.elegans Meeting
    • 発表場所
      Los Angels, California, USA
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative measurements and computer simulations of C.elegans embryonic cell morphology2009

    • 著者名/発表者名
      Masashi Fujita
    • 学会等名
      17th International C.elegans Meeting
    • 発表場所
      Los Angels, California, USA
    • 年月日
      2009-06-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanism of development in C.elegans2009

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      The 9th NIBB-EMBL Symposium
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center, Okazaki, Japan
    • 年月日
      2009-04-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 細胞・発生生物学の超ペタフロップス級コンピュータへの展開2009

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      超ペタフロップス級コンピュータと実験生物学の連携による生命現象への挑戦
    • 発表場所
      理化学研究所横浜研究所
    • 年月日
      2009-02-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Live cell imaging and image-processing enable quantitative and computational analysis of the development.2009

    • 著者名/発表者名
      Onami, S.
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 定量・計算解析による発生ダイナミクスの理解2009

    • 著者名/発表者名
      大浪修一
    • 学会等名
      日本機械学会計算力学講演会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス, 金沢.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 線虫C. elegans初期胚の細胞分裂ダイナミクスの定量解析2009

    • 著者名/発表者名
      京田耕司、足立絵瑠、倉持順子、島田久美子、大浪修一
    • 学会等名
      第19回日本数理生物学会大会
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス, 東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Computational analysis of quantitative information of cell division dynamics of early embryos.2009

    • 著者名/発表者名
      Kyoda, K., Adachi, E., Shimada, K., Kuramochi, J., Onami, S.
    • 学会等名
      17th International C. elegans Meeting.
    • 発表場所
      LA, USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanisms of development in C. elegans.2009

    • 著者名/発表者名
      Onami, S.
    • 学会等名
      The 2nd RIKEN-University of Edinburgh Joint Workshop.
    • 発表場所
      British Embassy, Tokyo, Japan.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanisms of development in C. elegans.2009

    • 著者名/発表者名
      Onami, S.
    • 学会等名
      The 9th NIBB-EMBL Symposium, Functional Imaging from Atoms to Organisms.
    • 発表場所
      Okazaki Conference Center, Okazaki, Japan.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanism of development in C. elegans.2009

    • 著者名/発表者名
      Onami, S.
    • 学会等名
      International Symposium on System Biology and Proteomics in Biomedical Science
    • 発表場所
      Kolkata, India.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞・発生生物学の超ペタフロップス級コンピュータへの展開2009

    • 著者名/発表者名
      大浪修一
    • 学会等名
      超ペタフロップス級コンピュータと実験生物学の連携による生命現象への挑戦
    • 発表場所
      理化学研究所横浜研究所, 横浜
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] C. elegans RNAi 初期胚のタイムラプス顕微鏡画像からの画像処理システムを用いた細胞分裂パターンの大量測定2008

    • 著者名/発表者名
      Takuya Maeda
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 線虫初期胚の細胞形状を決定する力学的因子の計算機解析2008

    • 著者名/発表者名
      Masashi Fujita
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 培養細胞系を用いたC. elegans生殖顆粒構成因子 PGL-3 のドメイン解析2008

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Yonetani
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 線虫C. elegansの細胞分裂パターンの定量的計測と計算解析2008

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Assembly and positioning of mitotic spindles in early C. elegans embryos. BMB20082008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A quantitative and computational approach to dynamic nuclear positioning in C. elegans embryos2008

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      文部科学省ナショナルバイオリソースプロジェクト線虫・シンポジウム -Nematode: An ideal Model Organism for Functional Genomics-
    • 発表場所
      東京女子医科大学
    • 年月日
      2008-11-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Reconstituting C. elegans Germ Granules in Mammalian Cells2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      The 17th CDB Meeting
    • 発表場所
      CDB, Kobe
    • 年月日
      2008-10-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Reconstituting C. elegans germ granules in mammalian cells.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting on Germ Cells.
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY.
    • 年月日
      2008-10-03
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Reconstituting C. elegans germ granules in mammalian cells2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting on Germ Cells
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor, NY
    • 年月日
      2008-10-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 画像処理を用いた線虫初期発生における細胞分裂パターンの網羅的測定2008

    • 著者名/発表者名
      Takuya Maeda
    • 学会等名
      第18回日本数理生物学会大会
    • 発表場所
      同志社大学
    • 年月日
      2008-09-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Frontiers in Developmental Biology.
    • 発表場所
      Presqu'ile de Giens, Southern France.
    • 年月日
      2008-09-14
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans.2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      Frontiers in Developmental Biology
    • 発表場所
      Presqu'ile de Giens, Southern France
    • 年月日
      2008-09-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 初期胚の構造と形態のダイナミクスに対する定量的計算科学的アプローチ2008

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      細胞・発生研究への数理科学的アプローチ-先端研究から探るアクションプラン-
    • 発表場所
      理化学研究所神戸研究所
    • 年月日
      2008-09-02
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 画像処理を活用した線虫C. elegans胚の定量的計算科学的解析2008

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      第3回 NIBB バイオイメージングフォーラム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-09-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Quantitative and computational cell division pattern analysis of early embryos2008

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Onami
    • 学会等名
      C. elegans Genomics and Systems Biology Workshop
    • 発表場所
      Cambridge, MA, USA
    • 年月日
      2008-07-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Computational analysis of quantitative cell division patterns of early embryos2008

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda
    • 学会等名
      C. elegans Development & Evolution Meeting 2008
    • 発表場所
      Madison, WI, USA
    • 年月日
      2008-06-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DDX-23, a DEAD-box protein, is involved in the sperm/oocyte switch2008

    • 著者名/発表者名
      Takafumi Konishi
    • 学会等名
      The 3^<rd> East Asia C. elegans Meeting 2008
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 年月日
      2008-04-20
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Domain analysis of PGL-3, a core component of P granules, using cultured mammalian cells2008

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Yonetani
    • 学会等名
      The 3^<rd> East Asia C. elegans Meeting 2008
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 年月日
      2008-04-20
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Dissecting the structure and assembly of P granules in heterologous cells2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      The 3^<rd> East Asia. C.elegans Meeting 2008
    • 発表場所
      Shanghai,China
    • 年月日
      2008-04-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Automatic measurement of nuclear dynamics in DIC microscope movies from public database2008

    • 著者名/発表者名
      Takuya Maeda
    • 学会等名
      The 3rd East Asia C. elegans Meeting
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 年月日
      2008-04-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Dissecting the structure and assembly of C. elegans germ granules in heterologous cells.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      "RNA" Granules Meeting.
    • 発表場所
      Chevy Chase, Maryland, USA
    • 年月日
      2008-04-02
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Dissecting the structure and assembly of C. elegans germ granules in heterologous cells2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      "RNA" Granules Meeting
    • 発表場所
      Chevy Chase, Maryland
    • 年月日
      2008-04-02
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Swiss-Japan Joint Seminar.
    • 発表場所
      Arosa, Switzerland.
    • 年月日
      2008-01-08
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans2008

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      Swiss-Japan Joint Seminar
    • 発表場所
      Arosa, Switzerland
    • 年月日
      2008-01-07
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structure and assembly of germ granules in C. elegans.2007

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Pasteur + CDB Joint Meeting.
    • 発表場所
      Paris, France.
    • 年月日
      2007-11-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Cellular dynamics in early C. elegans embryos2007

    • 著者名/発表者名
      Asako Sugimoto
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences
    • 発表場所
      Andover, USA
    • 年月日
      2007-06-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Cellular dynamics in early C. elegans embryos. Establishment of polarity in C. elegans 1-cell embryos.2007

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference "Developmental Biology"2007 Taiwan- Japan Bi-lateral Symposium.
    • 発表場所
      Andover, NH, USA, Taiwan.
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 線虫発生過程のフェノーム解析2006

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子
    • 学会等名
      日本遺伝学会第78回大会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2006-09-25
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Profiling and cluster analysis of developmental RNAi phenotypes in C. elegans.2005

    • 著者名/発表者名
      Sugimoto, A.
    • 学会等名
      Gordon Research Conference "Developmental Biology"
    • 発表場所
      Andover, NH
    • 年月日
      2005-06-20
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 線虫発生過程のフェノーム解析2005

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子
    • 学会等名
      表現型をどう「表現」するか?日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 蛋白質核酸酵素(線虫における生殖顆粒の形成と配分, 54)2009

    • 著者名/発表者名
      花澤桃世、米谷匡史, 杉本亜砂子
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 文部科学省科学研究費特定領域研究「ゲノム4領域」(ゲノムに書かれた発生プログラムを読み解く--線虫をモデル系として. ゲノムは何をどのように決めているのか? 生命システムの理解に向けて)2007

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子
    • 出版者
      クパブロ
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 比較ゲノム学から読み解く生命システム(線虫の比較ゲノム)2007

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子
    • 出版者
      秀潤社
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 実験医学(体系的表現型解析で探る線虫の発生機構, 25)2007

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] DBRF-MEGN method: An algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles.2007

    • 著者名/発表者名
      Onami, S., Kyoda, K.
    • 出版者
      Humana Press
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] DBRF-MEGN method: an algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles, "Introduction to Systems Biology"2007

    • 著者名/発表者名
      Kyoda, K., and Onami, S.
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      Humana Press
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 線虫の比較ゲノム, 「比較ゲノム学から読み解く生命システム」2007

    • 著者名/発表者名
      杉本 亜砂子
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      秀潤社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] in vivoイメージングのためのプローブ:線虫, 「実験がうまくいく蛍光・発光試薬の選び方と使い方」2007

    • 著者名/発表者名
      小西隆文, 杉本亜砂子
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 蛋白質核酸酵素(コンピュータシミュレーションを利用した核の配置のダイナミクス解析, 51)2006

    • 著者名/発表者名
      木村暁、大浪修一
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 蛋白質核酸酵素(線虫ゲノムの体系的発現・機能解析, 50)2005

    • 著者名/発表者名
      杉本亜砂子、小原雄治
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] RNA工学の最前線 線虫(C. elegans)におけるRNAiの応用2005

    • 著者名/発表者名
      飯田直子、杉本亜砂子
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 蛋白質核酸酵素(発生のシステムバイオロジー, 50)2005

    • 著者名/発表者名
      大浪修一、北野宏明
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/dge/KTmAbDB/KTtop.html

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://so.gsc.riken.jp/cdd/

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/dge/KTmAbDB/KTtop.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/dge/KTmAbDB/Kttop.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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