• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

siRNAライブラリーを用いた刷り込み遺伝子発現調節分子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 17019054
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関佐賀大学

研究代表者

副島 英伸  佐賀大学, 医学部, 助手 (30304885)

研究分担者 三ツ矢 幸造  東北大学, 先進医工学研究機構, 助手 (30375191)
押村 光雄  鳥取大学, 大学院医学系研究科, 教授 (20111619)
研究期間 (年度) 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2005年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードゲノム刷り込み / 刷り込みドメイン / siRNAライブラリー / non-coding RNA / ヒストンメチル化
研究概要

ゲノム刷り込みはエピジェネティクスの代表的現象で、一対の対立遺伝子において一方の親由来の遺伝子のみが発現する。複数の刷り込み遺伝子がドメインを作り、ドメイン内の刷り込み調節領域(ICR)に付けられた刷り込みマークに基づき遺伝子発現が決定されている。しかし、その遺伝子発現調節機構はほとんど未解明のままである。本研究では、ヒト疾患に関連する11p15.5のKIP2/LIT1刷り込みドメインに着目し、刷り込み遺伝子の発現制御機構の解明を目的とする。
1.刷り込み調節分子の同定:KIP2/LIT1ドメインの刷り込み破綻を単純な表現型(GFPの蛍光や薬剤耐性)で判定できる細胞を作製し、この細胞にsiRNAライブラリーを感染させ、表現型の変化で刷り込み破綻細胞を選別する。選別した刷り込み破綻細胞からsiRNAベクターを回収後、塩基配列を決定し、ゲノムデータベースを検索して刷り込み破綻を引きおこした候補遺伝子を同定する。また、non-coding RNAであるLIT1遺伝子の転写物を様々な長さで発現するような細胞を作製し、刷り込み破綻の有無を解析して、刷り込み調節分子としての可能性を検証する。上記目的のために、細胞系構築に必要なベクター合計5種類を作製した。現在、これらのベクターを細胞に導入している。
2.新規刷り込みマークの同定:F1マウス由来線維芽細胞を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP法)によりICRのヒストンH3K9、H3K27、H4K20のモノ、ジ、トリメチル化について解析した。その結果、H3K20のモノメチル化のみが父アレルに優位に存在することが判明した。ヒストンH3のメチル化は遺伝子抑制のマークであり、父アレル上ではLit1を除く他の刷り込み遺伝子は抑制されていることから、H3K20モノメチル化がドメイン内の刷り込み遺伝子の発現を抑制するマークである可能性が示唆された。

報告書

(1件)
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2006 2005

すべて 雑誌論文 (7件)

  • [雑誌論文] Comparative analyses of genomic imprinting and CpG island-methylation in mouse Murrl and human MURR1 loci revealed a putative imprinting control region in mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Zhang Z
    • 雑誌名

      Gene 366・1

      ページ: 77-86

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Imprinting, Chromatin Structure, and Disease.2005

    • 著者名/発表者名
      Soejima H
    • 雑誌名

      J Cell Biochem 95・2

      ページ: 226-233

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] ZAC, LIT1 (KCNQ1OT1) and p57^<KIP2> (CDKN1C) are in an imprinted gene network that may play a role in Beckwith-Wiedemann syndrome.2005

    • 著者名/発表者名
      Arima T
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 33・8

      ページ: 2650-2660

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Neuron-specific relaxation of Igf2r imprinting is associated with neuron-specific histone modifications and lack of its antisense transcript Air.2005

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Y
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet 14・17

      ページ: 2511-2520

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Epigenetic silencing of the MGMT gene in cancer.2005

    • 著者名/発表者名
      Soejima H
    • 雑誌名

      Biochem Cell Biol 83・4

      ページ: 429-437

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Narrowed abrogation of the Angelman syndrome critical interval on human chromosome 15 does not interfere with epigenotype maintenance in somatic cells.2005

    • 著者名/発表者名
      Haruta M
    • 雑誌名

      J Hum Genet 50・3

      ページ: 124-132

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] インプリンティングと先天異常、癌2005

    • 著者名/発表者名
      副島英伸
    • 雑誌名

      Molecular Medicine 42・2

      ページ: 201-208

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

URL: 

公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi