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高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17026014
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋大学

研究代表者

小保方 潤一  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667)

研究分担者 若杉 達也  富山大学, 理学部, 教授 (10212317)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
2006年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2005年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
キーワード高等植物 / 葉緑体 / RNAエディティング / in vitro系 / トランス因子 / RNase感受性 / UVクロスリンク
研究概要

本研究の目的は、生化学的手法によって、高等植物の葉緑体RNAエディティング因子を単離精製し、その構造・機能・進化を解明することである。本年度は、以下の成果が得られた。
(1)RNAエディティング因子の精製
前年度の研究によって改良されたタバコ葉緑体由来のin vitro RNAエディティング系から、psbE mRNAに作用するエディティング因子を含む画分を、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、RNAアフィニティークロマトグラフィー等によって、濃縮・精製した。得られた活性画分を、SDSPAGEによって分離した後、トリプシン分解し、次いで、LC/MS法による質量分析にかけたが、シロイヌナズナのデーターベースを用いた検索では、目的とする蛋白質を同定するには至らなかった。そこで、出発材料をシロイヌナズナの葉緑体に変えて、上記の同様な精製・分析を進めている。
(2)RNAエディティング因子のRNase感受性について
葉緑体抽出液中のRNAエディティング活性がRNase感受性であることを見出した。RNase感受性を示すメカニズムはまだ不明であるが、RNA成分がRNAエディティングの(1)部位認識、(2)触媒活性、(3)活性の促進、などに関わっている可能性について、現在検討を進めている。
(3)部位認識因子の複数部位
RNAエディティング部位と部位認識トランス因子との間には一対一の対応関係があると考えられてきた。しかし、タバコのndhB-9部位とndhF-1部位は同一のトランス因子によって共認識されることを明らかにした。この知見は、RNAエディティング部位の進化・多様化のメカニズムを解明する上で、大きな手掛かりになる。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (8件)

  • [雑誌論文] Identification of plant promoter constituents by analysis of local dstribution of short sequences.2007

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, YY., Ichida, H., Matsui, M., Obokata, J., Sakurai, T., Satou, M., Seki, M., Shinozaki, K., Abe, T.
    • 雑誌名

      BMC Genomics 8

      ページ: 67-89

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Remote control of photosynthetic genes by the mitochondrial respiratory chain.2006

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, M., Obokata, J.
    • 雑誌名

      Plant Journal 47

      ページ: 873-882

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Systematic enrichment of translational regulatory elements.2006

    • 著者名/発表者名
      Nagao, I., Obokata, J.
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 354

      ページ: 1-7

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Rice nuclear genome continuously integrates, shuffles and eliminates the chloroplast genome to cause chioroplast-nuclear DNA flux.2005

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, M., Ito, Y., Yamauchi, R., Obokata, J.
    • 雑誌名

      Plant Cell 17

      ページ: 665-675

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 葉緑体の転写後制御と翻訳.2005

    • 著者名/発表者名
      宮本徹也, 小保方潤一, 杉浦昌弘
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50

      ページ: 1853-1856

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 葉緑体DNAの核への転移.2005

    • 著者名/発表者名
      小保方潤一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50

      ページ: 1843-1844

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] C-to-U RNA編集.2005

    • 著者名/発表者名
      小保方潤一
    • 雑誌名

      医学のあゆみ 215

      ページ: 3511-3514

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Systematic Enrichment of translational regulatory elements.

    • 著者名/発表者名
      Nagao, I., Obokata, J.
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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