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高精細な4次元医用画像の高速計算に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 17032007
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関大阪大学

研究代表者

萩原 兼一  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 (00133140)

研究分担者 伊野 文彦  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助手 (90346172)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
6,900千円 (直接経費: 6,900千円)
2006年度: 3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
2005年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードPCクラスタ / 医用画像処理 / 高速化 / GPU / モルフォロジー演算 / 4次元ボリュームレンダリング
研究概要

本研究の目的は,高精細な4次元医用画像に対する実時間処理を実現することである.この実現のために,GPUやPCクラスタを用いた高性能計算に関して研究してきた.平成18年度の成果として,(1)4次元ボリュームレンダリングの高速化,(2)モルフォロジー演算の高速化,および(3)GPU装備のノートPCによる2次元/3次元剛体位置合わせの性能評価および精度評価について述べる.
(1)512×512××295ボクセルの肺データに対しては,秒間あたり5フレームの性能を達成でき,ほぼ実時間の可視化を実現できている.残りの小規模なデータに対しては30フレームに到達するものもある.一方,技術を何ら用いない安易な実装では,概ね1/5の性能であることから,1台のPCであってもディスク,CPUおよびGPUの多重化,およびデータ圧縮やパイプラインなどの工夫により目標性能を達成できた.
(2)GPUにより数秒程度の実行時間をモルフォロジー演算に対して達成した.集約型は大きい元画像に対して高速であり,ばらまき型は大きい構造要素に対して高速であることを示した.
(3)64個のCPUを持つPCクラスタは,位置合わせに要する計算時間を5分から15秒,15分から58秒に短縮できた.一方,GPUはほぼ30秒以下の実行時間で位置合わせを完了できている.この実行時間は術中用途に耐える短さであるため,提案手法は位置合わせを前処理とする様々な手術支援に貢献できる.PCクラスタが管理や運営などの維持コストを必要とするのに対し,GPUではノートPCを1台のみ手術室に持ち込めばよいので,高性能計算環境を導入するときの敷居は格段に低く,実用性が高い.

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (51件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (51件)

  • [雑誌論文] グリッドアプリケーションの実行時間を短縮するための計算結果再利用機構の評価2007

    • 著者名/発表者名
      松尾 勝則
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2007-EVA-201(発表予定)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Parallel Image Processing Library2007

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Hirano
    • 雑誌名

      Proceedings of the 10th International Workshop on Advanced Image Technology

      ページ: 929-933

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 並列型画像処理ライブラリの高効率化2007

    • 著者名/発表者名
      平野 靖
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2006-87

      ページ: 17-20

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Parallel Adaptive Estimation of Range of Motion Simulation for Total Hip Replacement Surgery2007

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Kawasaki
    • 雑誌名

      IEICE Transactions on Information and Systems E90-D・1

      ページ: 30-39

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 適合格子細分化法を用いる画像処理のための実行時間予測手法2007

    • 著者名/発表者名
      川崎 康博
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2006-145

      ページ: 235-238

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Real-Time Rendering of Time-Varying Volume Data Using a Single COTS PC2007

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Nagayasu
    • 雑誌名

      Proceedings of the 2nd International Conference on Computer Graphics Theory and Applications (採録決定)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 大規模なマルチスケールポリュームレンダリングのための先読み手法の検討2007

    • 著者名/発表者名
      辻 顯
    • 雑誌名

      電子情報通信学会2007総合大会講演論文集 (発表予定)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] GPGPUアプリケーションを開発するための性能モデルの検討2007

    • 著者名/発表者名
      伊藤 信悟
    • 雑誌名

      第7回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンボジウム論文集

      ページ: 67-67

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUを用いたモルフォロジ-演算のベクトル化2007

    • 著者名/発表者名
      前野 滝授
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2007-CG-126

      ページ: 73-78

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Grid Resource Monitoring and Selection for Rapid Turnarround Applications2006

    • 著者名/発表者名
      Kensuke Muraki
    • 雑誌名

      IEICE Transactions on Information and Systems E89-D・9

      ページ: 2491-2501

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A Resource Selection Method for-Cycle Stealing in the GPU Grid2006

    • 著者名/発表者名
      Yuki Kotani
    • 雑誌名

      Proceedings of the 4th International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications Workshops

      ページ: 769-780

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] グリッド環境において遊休GPUを活用するための資源選択手法2006

    • 著者名/発表者名
      小谷裕基
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2006-HPC-108

      ページ: 37-42

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Minimizing Data Size for Efficient Data Reuse in Grid-Enabled Medical Applications2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 7th International Symposium on Biological and Medical Data Analysis

      ページ: 195-206

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] グリッド環境において計算結果を効率よく再利用するための通信量削減2006

    • 著者名/発表者名
      松尾 勝則
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2006-HPC-107

      ページ: 19-24

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Trace Reduction for Performance Improvement Assessment of Message Passing Parallel Programs2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Systems and Computers in Japan 37・5

      ページ: 1-13

    • NAID

      110003203349

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の生成2006

    • 著者名/発表者名
      置田 真生
    • 雑誌名

      情報処理学会 : コンピューティングシステム 47・SIG7

      ページ: 1-11

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 3次元並列型画像処理ライブラリの構築とその性能評価2006

    • 著者名/発表者名
      平野 靖
    • 雑誌名

      第15回日本コンピュータ外科学会大会/第16回コンピュータ支援画像診断学会大会合同論文集

      ページ: 313-314

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A Parallel Implementation of 2-D/3-D Image Registration for Computer-Assisted Surgery2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      International Journal of Bioinformatics Research and Applications 2・4

      ページ: 341-358

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2次元/3次元剛体位置合わせの高速化2006

    • 著者名/発表者名
      五味田 遵
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌 47・10

      ページ: 2947-2958

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Fast 2-D/3-D Registration Using a Laptop PC with Commodity Graphics Hardware2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of Computer Assisted Radiology and Surgery : 20th International Congress and Exhibition

      ページ: 53-54

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A GPGPU Approach for Accelerating 2-D/3-D Rigid Registration of Medical Images2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 4th International Symposium on Parallel and Distributed Processing and Applications

      ページ: 939-950

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Two-Stage Compression for Fast Volume Rendering of Time-Varying Scalar Data2006

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Nagayasu
    • 雑誌名

      Proceedings of the 4th International Conference on Computer Graphics and Interactive Techniques in Australasia and Southeast Asia

      ページ: 275-284

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A Code Motion Technique for Accelerating General-Purpose Computation on the GPU2006

    • 著者名/発表者名
      Takatoshi Ikeda
    • 雑誌名

      Proceedings of the 20th IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium (CD-ROM)

      ページ: 10-10

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] GPU内命令移動のための性能指標の実験的評価2006

    • 著者名/発表者名
      池田 孝利
    • 雑誌名

      第4回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 51-58

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] モルフォロジー演算の高速化のためのGPU実装の比較2006

    • 著者名/発表者名
      前野 滝授
    • 雑誌名

      第10回Visual Computing/グラフィクスとCAD合同シンポジウム予稿集

      ページ: 239-244

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2方向投影による2次元/3次元剛体位置合わせ2006

    • 著者名/発表者名
      五味田 遵
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2005-115

      ページ: 29-32

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 3次元並列型画像処理ライブラリ開発における基礎的検討2006

    • 著者名/発表者名
      平野 靖
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 MI2005-116

      ページ: 33-36

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] グリッド環境における計算結果再利用の検討2006

    • 著者名/発表者名
      田中 裕也
    • 雑誌名

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集告

      ページ: 47-47

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUを装備する計算機を計算資源とするグリッドにおける資源選択手法の検討2006

    • 著者名/発表者名
      小谷 裕基
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2005-EVA-16(発表予定)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 適合格子細分化法のアプリケーションのためのフラクタルに基づく計算量予測手法2006

    • 著者名/発表者名
      川崎 康博
    • 雑誌名

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集

      ページ: 43-43

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUを用いたモルフォロジー演算の高速化手法2006

    • 著者名/発表者名
      前野 滝授
    • 雑誌名

      電子情報通信学会2006総合大会講演論文集 (発表予定)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の作成2006

    • 著者名/発表者名
      置田 真生
    • 雑誌名

      第6回ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集告

      ページ: 129-136

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] メッセージ通信プログラムにおける性能解析のための大規模な実行履歴の作成2006

    • 著者名/発表者名
      置田 真生
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 47・SIG14(採録決定)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 術中二次元/三次元剛体位置合せのための並列化手法2005

    • 著者名/発表者名
      川崎 康博
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 J88-D-I・10

      ページ: 1534-1546

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A Parallel Implementation of 2-D/3-D Image Registration for Computer-Assisted Surgery2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 11th International Conference on Parallel and Distributed Systems, Volume II Workshops

      ページ: 316-320

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Performance Evaluation of Nonrigid Registration Algorithm on Three Off-the-Shelf Supercomputers2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of Computer Assisted Radiology and Surgery : 19th International Congress and Exhibition

      ページ: 1276-1276

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Performance Study of Nonrigid Registration Algorithm for Investigating Lung Disease on Clusters2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 6th International Conference on Parallel and Distributed Computing, Applications and Technologies

      ページ: 820-825

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 汎用グラフィクスハードウェアを用いた2次元/3次元剛体位置合わせの高速化2005

    • 著者名/発表者名
      五味田 遵
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2005-HPC-104

      ページ: 25-30

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] グリッドにおいて短時間処理を実現するための資源選択手法2005

    • 著者名/発表者名
      村木 健介
    • 雑誌名

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 253-254

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Grid Resource Monitoring and Selection for Rapid Turnaround Applications2005

    • 著者名/発表者名
      Kensuke Muraki
    • 雑誌名

      Proceedings of the 17th IASTED International Conference on Parallel and Distributed Computing and Systems

      ページ: 253-254

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] グリッドにおけるGPUの遊休状態を監視するためのシステムの提案2005

    • 著者名/発表者名
      小谷 裕基
    • 雑誌名

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 205-206

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] フラクタル解析による適合格子細分化法の計算量予測2005

    • 著者名/発表者名
      川崎 康博
    • 雑誌名

      電子情報通信学会技術研究報告 COMP2005-20

      ページ: 9-15

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUを用いた時系列ボリュームレンダリングの2段階圧縮による高速化2005

    • 著者名/発表者名
      永安 大輔
    • 雑誌名

      3次元画像コンファレンス講演論文集

      ページ: 21-24

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 時系列ボリュームを高速レンダリングするための2段階データ圧縮方法の性能および画質評価2005

    • 著者名/発表者名
      永安 大輔
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2005-CG-121

      ページ: 115-120

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 医用画像処理の並列処理による高速化について2005

    • 著者名/発表者名
      萩原 兼一
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 2005-AL-102

      ページ: 33-33

    • NAID

      110002812597

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] プログラマブルGPUにおけるLU分解の設計と実装2005

    • 著者名/発表者名
      松井 学
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 46・SIG12

      ページ: 129-139

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Performance Study of LU Decomposition on the Programmable GPU2005

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Ino
    • 雑誌名

      Proceedings of the 12th International Conference on High Performance Computing

      ページ: 83-94

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] プログラマブルGPUにおけるLU分解の設計と実装2005

    • 著者名/発表者名
      松井 学
    • 雑誌名

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 359-367

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUアプリケーションを高速化するための命令割当方式2005

    • 著者名/発表者名
      池田 孝利
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 46・SIG12

      ページ: 140-149

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] GPUアプリケーションを高速化するための命令割当方式2005

    • 著者名/発表者名
      池田 孝利
    • 雑誌名

      第3回先進的計算基盤システムシンポジウム論文集

      ページ: 7-16

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] メッセージ通信プログラムの性能改善可能性を評価するための実行履歴の削減2005

    • 著者名/発表者名
      伊野 文彦
    • 雑誌名

      電子情報通信学会論文誌 J88-D-1・4

      ページ: 780-790

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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