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膜蛋白質の構造解析を推進する試薬の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17048003
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関群馬大学

研究代表者

若松 馨  群馬大学, 工学部, 教授 (40222426)

研究分担者 窪田 健二  群馬大学, 工学部, 教授 (40153332)
飯塚 靖子  群馬大学, 工学部, 技術専門職員 (60375566)
研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
6,600千円 (直接経費: 6,600千円)
2006年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2005年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
キーワード蛋白質 / 凝集 / NDSB / 構造生物学 / NMR / 熱安定性 / X線結晶解析 / 重水素化
研究概要

蛋白質の非特異的な凝集を防止するとともに安定性を向上させる低分子化合物やその使用法を開発し,膜蛋白質研究を推進することを本研究の目的とした.蛋白質が凝集すると質の良い結晶ができないだけでなく,溶液NMRの感度や分解能が著しく低下する.NDSB (non-detergent sulfobetain)という一群の化合物は蛋白質の凝集を防ぐ事が知られているので,NDSBが凝集を防止するメカニズムを検討するとともに,膜蛋白質のNMRにNDSBを応用した.
1.NMR条件下での蛋白質の凝集:動的光散乱測定では単分散状態と判断される蛋白質サンプルの溶液NMRを測定しても,凝集した蛋白質のスペクトルが得られる事がある.これはNMR測定に固有の条件が凝集を促進している事が原因であった.その原因は3つあり(ガラスNMRチューブ,化学シフトの基準物質,重水中の不純物),これらを除去することによって,サンプルの寿命が延び,良質のスペクトルが得られるようになった.
2.NDSB添加によるNMRスペクトルの向上:溶液NMRは測定温度が高いほどシグナルがシャープになり,良質のスペクトルが得られる.しかし,高温にすると蛋白質が凝集しやすくなる.NMRサンプルにNDSBを添加すると高温でも蛋白質が凝集しなくなる事がわかった.この方法を適用する事により,膜蛋白質の一種であるGi1αのシグナルが帰属できるようになり,活性化に伴う立体構造変化も追跡できるようになった.
3.NDSBと蛋白質との結合:NDSB存在下ではユビキチン等の蛋白質の回転半径が大きくなるので,NDSBは蛋白質に結合している事が明らかとなった.

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analyses of the receptor-uncoupled mutant of Gil2007

    • 著者名/発表者名
      T.Morikawaら
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.F 63(2)

      ページ: 139-141

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Cryptides : functional cryptic peptides hidden in protein structures2007

    • 著者名/発表者名
      N.Uekiら
    • 雑誌名

      Peptide Science 88(2)

      ページ: 190-198

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structure of tightly membrane-bound mastoparan-X, a G-protein-activating peptide, determined by solid-state NMR2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Todokoroら
    • 雑誌名

      Biophys.J. 91(4)

      ページ: 1368-1379

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Effect of NDSB on the fibrinogen gelation by thrombin2006

    • 著者名/発表者名
      H.Kogureら
    • 雑誌名

      Trans.Materials Res.Soc.J. 31(3)

      ページ: 787-790

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Direct determination of a membrane-peptide interface using the nuclear magnetic resonance cross-saturation method2005

    • 著者名/発表者名
      T.Nakamura, H.Takahashi, K.Takeuchi, T.Kohno, K.Wakamatsu, I.Shimada
    • 雑誌名

      Biophys.J. 89(6)

      ページ: 4051-4055

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] nm-Scale assembly of phospholipid and detergent mixture2005

    • 著者名/発表者名
      K.Kubota, T.Sato, H.Kawai, Y.Inaoka, K.Wakamatsu
    • 雑誌名

      Trans.Materials Res.Soc.J. 30(3)

      ページ: 839-842

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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