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高度好塩菌の膜インターフェースにおける物質輸送の分子論的義盤

研究課題

研究課題/領域番号 17048008
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関中央大学

研究代表者

宗行 英朗  中央大学, 理工学部, 助教授 (80219865)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
5,900千円 (直接経費: 5,900千円)
2006年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2005年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
キーワードエネルギー全般 / 生物物理 / 分子機械 / 生体分子
研究概要

平成18年度は光イオンポンプの光化学サイクルを測定するための時間分解分光測定の調整などを行い,レーザーパルスの後2μ秒からのデータの取得が可能になった(以前は10μ秒).一方,海洋細菌が産出するレチナールタンパクでプロトンポンプを行うプロテオロドプシン(PR)の発現系を,北海道大学薬学部の加茂直樹博士から恵与していただき,これをもとにPCR法で210E, N220E変異体を作成した.これらの残基はバクテリオロドプシン(bR)のプロトン放出団(E194,E204)に対応するが,この変異導入によって蛋白内部の水環境の変化がおこり,シッフ塩基からプロトンをうけとるD97のpKaにも影響が出る可能性を期待している.大腸菌での発現は順調に成功し,現在,光化学サイクルとプロトンの出入りを測定するための準備を行っている.また昨年度,野生型のpRでpH3でも中性付近の約10%の起電性を持つことを我々の電気測定系で検出して,PRではD97と別のプロトン受容基が酸性領域で働いている可能性を指摘していたが,本年度は加茂博士から恵与していただいたD97N変異体の起電性についても検討した.その結果,中性からpH5付近でも起電性が確認された.我々の測定系では蛋白内部での電荷移動と膜の表から裏への正味の輸送の区別が付かないという難点があるが,シッフ塩基から最初にプロトンを受け取る役目をするD97の変異でも起電性が出ていると言うことは,プロトンの経路について何か他の残基が関与している可能性を強く示唆する.
また,東京大学分子細胞研究所の杉田博士(現 理研)の多大なる協力を得て,分子動力学計算のシステムを立ち上げた.現在比較的小さな蛋白質であるATP合成酵素のεサブユニットについてその構造変化を探るための計算を行っている.

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] Single Molecule Energetics of F_1-ATPase Motor2007

    • 著者名/発表者名
      Muneyuki E, Watanabe-Nakayama T, Suzuki T, Yoshida M, Nishizaka T, Noji H
    • 雑誌名

      Biophys J. 92・5

      ページ: 1806-1812

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] AFM and TEM observations of alpha-helix to beta-sheet conformational change occurring on carbon nanotubes.2006

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama Y, Inoue Y, Muneyuki E, Haneda H, Fujimoto M
    • 雑誌名

      J Electron Microsc (Tokyo) 55・3

      ページ: 143-149

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Kinetic mechanism of quinol oxidation by cytochrome bd studied with ubiquinone-2 analogs2006

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Y, Muneyuki E, Fujita D, Sakamoto K, Miyoshi H, Yoshida M, Mogi T
    • 雑誌名

      J Biochem (Tokyo) 139・4

      ページ: 779-788

    • NAID

      10018845925

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] An Alternative Reaction Pathway of F_1-ATPase Suggested by Rotation without 80°/40° Substeps of a Sluggish Mutant at Low ATP.2006

    • 著者名/発表者名
      Shimabukuro K, Muneyuki E, Yoshida M.
    • 雑誌名

      Biophys J. 90・3

      ページ: 1028-1032

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The Characteristics of the (αV^<371>C)_3(βR^<337>C)_3γ Double Mutant Subcomplex of the TF_1-ATPase Indicate that the Catalytic Site at the α_<TP>-β_<TP> Interface with Bound MgADP in Crystal Structures of MF_1 Represents a Catalytic Site Containing Inhibitory MgADP.2005

    • 著者名/発表者名
      Bandyopadhyay, S., Muneyuki, E., Allison, W.S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44・7

      ページ: 2441-2448

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] One Rotary Mechanism for F_1-ATPase over ATP Concentrations from Millimolar down to Nanomolar.2005

    • 著者名/発表者名
      Sakaki N, Shimo-Kon R, Adachi K, Itoh H, Furuike S, Muneyuki E, Yoshida M, Kinosita K.Jr.
    • 雑誌名

      Biophys J. 88・3

      ページ: 2047-2058

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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