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ヒト細胞におけるM期から複製開始にいたるまでの染色体構成因子のプロテオーム解析

研究課題

研究課題/領域番号 17050012
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関北海道大学 (2006)
京都大学 (2005)

研究代表者

小布施 力史  北海道大学, 大学院先端生命科学研究院, 教授 (00273855)

研究期間 (年度) 2005 – 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
2006年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2005年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
キーワードプロテオーム / 染色体 / 質量分析 / インフォマティクス / ヘテロクロマチン / 定量プロテオミクス / クロマチン / 細胞周期 / 核 / インフォマティックス
研究概要

M期から複製開始にいたるまでの時期は、分配された染色体が説凝縮し核膜が再構成されていくというダイナミックなプロセスが観察されるのみならず、次の細胞周期に進行するか否かのデシジョン、それに伴う複製開始複合体の形成など、細胞核の構造と機能に直結した課題が凝縮されている。本課題は、ヒト染色体の姉妹染色体の分配時期から複製開始にいたるまでの染色体構成因子の量的な変動を、質量分析をもちいたプロテオーム解析により網羅的に明らかすることを目的としている。
これまでに、非イオン性界面活性剤処理、マイクロコッカルヌクレアーゼ処理、塩処理、超音波処理を順に施すことにより、ほとんどの成分を可溶化できることを見いだした。しかしながら、この方法ではヒストン以外のクロマチン結合蛋白質は失われることがあきらかとなった。この間題点を克服するための方法について検討したが、後述のように、質量分析、インフオマティックス技術が向上したため、精製度については意識せず、界面活性剤により得られるラフな分画を解析に用いるのがよいと判断した。
質量分析器を用いたタンバク質の定量解析技術の改良を沖縄大学院大学先行事業の長尾博土と協力して進めている。あるタンパク質に帰属する同定ペプチドの数が、絶対量と相関があることを利用して、検索エンジンの同定結果をプロセスして定量情報を抽出する一連の流れをほぼ確立した。これを用いることにより、大きな(1桁以上の)量的な変化があるタンパク質を見いだすことが可能である。また、この技術を基盤として、染色体の機能的に非常に重要な領域であるヘテロクロマチン領域について解析を行い、細胞周期による構成因子の違い、サブタイプによる構成因子の違いなどが明らかとなり、染色体構成因子のプロテオームの解析に目途がついたと考えられる。

報告書

(2件)
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] Priming of Centromere for CENP-A Recruitment by Human hMis18α, β and M18BP.2007

    • 著者名/発表者名
      Fujita, Y.
    • 雑誌名

      Dev.Cell 12

      ページ: 17-30

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Comprehensive analysis of the ICEN (Interphase Centromere Complex) components enriched in the CENP-A chromatin of human cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Izuta, H.
    • 雑誌名

      Genes Cells 11

      ページ: 673-684

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Two E3 ubiqutin ligase, SCF-Skp2 and DDB1-Cu14, target human Cdt1 for proteolysis.2006

    • 著者名/発表者名
      Nishitani, H.
    • 雑誌名

      EMBO Journal 25

      ページ: 1126-1136

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 染色体分配のための分子ネットワークのプロテオミクス解析2006

    • 著者名/発表者名
      小布施力史
    • 雑誌名

      共立出版株式会社・蛋白質・核酸・酵素 51

      ページ: 2020-2023

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Comprehensive analysis of the Interphase Centromere Complex components enriched in the CENP-A chromatin of human cells2006

    • 著者名/発表者名
      M.Ikeno1, H.Izuta, N.Suzuki1, H.Yang, T.Tomonaga, N.Nozaki, C.Obuse, Y.Kisu, NGoshima, N.Nomura, K.Yoda
    • 雑誌名

      Genes Cells (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Two E3 ubiquitin ligases, SCF-Skp2 and DDB1-Cu14, target human Cdt1 for proteolysis2006

    • 著者名/発表者名
      H.Nishitani1, N.Sugimoto, V.Roukos, Y.Nakanishi, M.Saijo, C.Obuse, T.Tsurimoto, K.I.Nakayama, K.Nakayama, M.Fujita, Z.Lygerou, T.Nishimoto
    • 雑誌名

      EMBO J. (in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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