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遺伝子発現制御におけるDECODE複合体の分子作用機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 17054033
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関横浜市立大学

研究代表者

緒方 一博  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90260330)

研究分担者 佐藤 光  横浜市立大学, 医学研究科, 助教 (90300962)
椎名 政昭  横浜市立大学, 医学研究科, 助教 (30347299)
浜田 恵輔  横浜市立大学, 医学研究科, 助教 (00344052)
連携研究者 椎名 政昭  横浜市立大学, 医学部, 助教 (30347299)
浜田 恵輔  横浜市立大学, 医学部, 助教 (00344052)
佐藤 光  横浜市立大学, 医学部, 助教 (90300962)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
105,600千円 (直接経費: 105,600千円)
2009年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
2008年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
2007年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
2006年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
2005年度: 21,600千円 (直接経費: 21,600千円)
キーワード転写因子 / タンパク質-核酸複合体 / Ets1,Runx1,エンハンサー / 化学修飾 / 連携研究者 / 転写制御因子 / エンハンソソーム / Runx1 / Ets1 / ヒストンシャペロン / クロマチンリモデリング / エンハンセオソーム / ヒストンシヤペロン / リン酸化 / MeCP2
研究概要

特異的転写は、高次転写因子タンパク質-DNA複合体によって制御を受ける。本研究では、Ets1-Runx1-CBFβ-DNA複合体の分子構造を解析し、複合体の安定化機構が、DNAを介したアロステリック制御であることを見いだした。この制御様式は、様々な転写因子-DNA複合体においても適用可能であり、ある程度の一般性を持つと考えられた。さらに、転写因子-DNA複合体形成に与える転写因子の化学修飾の役割が、複合体を構成する他の転写因子タンパク質によって調節を受けていることを、その分子機構とともに明らかにした。

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (49件)

すべて 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 17件) 学会発表 (21件) 図書 (7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] NLRP4 negatively regulates autophagic processes through an association with Beclin12011

    • 著者名/発表者名
      Jounai N, Kobiyama K, Shiina M, Ogata K, Ishii KJ, Takeshita F.
    • 雑誌名

      J Immunol 186

      ページ: 1646-1655

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss-of-function mutations of CHST14 in a new type of Ehlers-Danlos syndrome2010

    • 著者名/発表者名
      Miyake N, Kosho T, Mizumoto S, Furuichi T, Hatamochi A, Nagashima Y, Arai E, Takahashi K, Kawamura R, Wakui K, Takahashi J, Kato H, Yasui H, Ishida T, Ohashi H, Nishimura G, Shiina M, Saitsu H, Tsurusaki Y, Doi H, Fukushima Y, Ikegawa S, Yamada S, Sugahara K, Matsumoto N
    • 雑誌名

      Hum Mutat 31(8)

      ページ: 966-974

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of Ets1 cooperative binding to palindromic sequences on stromelysin-1 promoter DNA2010

    • 著者名/発表者名
      Babayeva ND, Wilder PJ, Shiina M, Mino K, Desler M, Ogata K, Rizzino A, Tahirov TH
    • 雑誌名

      Cell Cycle 9(14)

      ページ: 3054-3062

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dominant-negative mutations in alpha-II spectrin cause West syndrome with severe cerebral hypomyelination, spastic quadriplegia, and developmental delay2010

    • 著者名/発表者名
      Saitsu H, Tohyama J, Kumada T, Egawa K, Hamada K, Okada I, Mizuguchi T, Osaka H, Miyata R, Furukawa T, Haginoya K, Hoshino H, Goto T, Hachiya Y, Yamagata T, Saitoh S, Nagai T, Nishiyama K, Nishimura A, Miyake N, Komada M, Hayashi K, Hirai S, OgOgS, OggS, Oggg, Oga K, Kato M, Fukuda A, Matsumoto N
    • 雑誌名

      Am J Hum Genet 86(6)

      ページ: 881-891

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational approach to the synthesis, evaluation and 68Ga labeling of a novel 4-anilinoquinoline EGFR inhibitor as a new imaging agent that selectively targets the EGFR tyrosine kinase2010

    • 著者名/発表者名
      Theeraladanon C, Takahashi N, Shiina M, Hamada K, Takada Y, Endo H, Tateishi U, Oka T, Ogata K, Inoue T
    • 雑誌名

      Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals 25(4)

      ページ: 479-485

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational approach to the synthesis, evaluation and 68Ga labeling of a novel 4-anilinoquinoline EGFR inhibitor as a new imaging agent that selectively targets the EGFR tyrosine kinase2010

    • 著者名/発表者名
      Theeraladanon C
    • 雑誌名

      Cancer Biotherapy & Radiopharmaceuticals (in press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The 8th and 9th tandem spectrin-like repeats of utrophin cooperatively form a functional unit to interact with polarity-regulating kinase PAR-1b2009

    • 著者名/発表者名
      Yamashita K, Suzuki A, Satoh Y, Ide M, Amano Y, Masuda-Hirata M, Hayashi YK, Hamada K, Ogata K, Ohno S
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 391(1)

      ページ: 812-817

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The 8th and 9th tandem spectrin-like repeats of utrophin cooperatively for a functional unit to interact with polarity-regulating kinase PAR-1b2009

    • 著者名/発表者名
      Yamashita K
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 391

      ページ: 812-817

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] De novo mutations in the gene encoding STXBP1(MUNC18-1)cause early infantile epileptic encephalopathy2008

    • 著者名/発表者名
      Saitsu H, Kato M, Mizuguchi T, Hamada K, Osaka H, Tohyama J, Uruno K, Kumada S, Nishiyama K, Nishimura A, Okada I, Yoshimura Y, Hirai S, Kumada T, Hayasaka K, Fukuda A, Ogata K, Matsumoto N
    • 雑誌名

      Nat Genet 40(6)

      ページ: 782-788

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] De novo mutations in the gene encoding STXBP1 (MUNC18-1) cause early infantile epileptic encephalopathy2008

    • 著者名/発表者名
      Saitsu H
    • 雑誌名

      Nature Genetics 40

      ページ: 782-788

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distant N-terminal and C-terminal domains are required for intrinsic kinase activity of SMG-1, a critical component of nonsense-mediated mRNA decay2007

    • 著者名/発表者名
      Morita T, Yamashita A, Kashima I, Ogata K, Ishiura S, Ohno S
    • 雑誌名

      J Biol Chem 282(11)

      ページ: 7799-7808

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Foxo1 links insulin signaling to C/EBPα and regulates gluconeogenesis during liver development2007

    • 著者名/発表者名
      Sekine K, Chen YR, Kojima N, Ogata K, Fukamizu A, Miyajima A
    • 雑誌名

      The EMBO Journal 26(15)

      ページ: 3607-3615

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distant N-terminal and C-terminal domains are required for intrinsic kinase activity of SMG-1, a critical component of nonsense-mediated mRNA decay2007

    • 著者名/発表者名
      Morita T
    • 雑誌名

      J Biol Chem 282

      ページ: 7799-7808

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Foxol links insulin signaling to C/EBP α and regulates gluconeogenesis during liver development2007

    • 著者名/発表者名
      Sekine K.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal 26

      ページ: 3607-3615

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distant N-terminal and C-terminal domains are required for intrinsic kinase activity of SMG-1, a critical component of nonsense-mediated mRNA decay2007

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Morita
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 16

      ページ: 7799-7808

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Cyclin-dependent kinase(CDK)phosphorylation destabilizes somatic Wee1 via multiple pathways2005

    • 著者名/発表者名
      Watanabe N, Arai H, Iwasaki J, Shiina M, Ogata K, Hunter T, Osada H
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102(33)

      ページ: 11663-11668

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the protein histidine phosphatase SixA in the multistep His-Asp phosphorelay2005

    • 著者名/発表者名
      Hamada K, Kato M, Shimizu T, Ihara K, Mizuno T, Hakoshima T
    • 雑誌名

      Genes Cells 10

      ページ: 1-11

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for recruitment of human flap endonuclease 1 to PCNA2005

    • 著者名/発表者名
      Sakurai S, Kitano K, Yamaguchi H, Hamada K, Okada K, Fukuda K, Uchida M, Ohtsuka E, Morioka H, Hakoshima T
    • 雑誌名

      EMBO J. 24(4)

      ページ: 683-693

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cyclin-dependent kinase (CDK) phosphorylation destabilizes somatic Weel via multiple pathways2005

    • 著者名/発表者名
      Nobumoto Watanabe, Harumi Arai, Jun-ichi Iwasaki, Masaaki Shiina, Kazuhiro Ogata, Tony Hunter, Hiroyuki Osada
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102

      ページ: 11663-11668

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 特集 転写制御と疾患 タンパク質の分子構造異常と癌化.2005

    • 著者名/発表者名
      緒方 一博
    • 雑誌名

      Molecular Medicine 42

      ページ: 64-75

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] 分化細胞特異的エンハンソソーム形成とリン酸化による制御の分子基盤2011

    • 著者名/発表者名
      緒方一博
    • 学会等名
      特定領域研究遺伝情報デコード成果報告シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Context-Dependent Regulation of the Etsl-containing Enhanceosome by Phosphorylation2010

    • 著者名/発表者名
      Shiina M
    • 学会等名
      Decode winter workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa
    • 年月日
      2010-01-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Context-Dependent Regulation of the Ets1-containing Enhanceosome by Phosphorylation.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Hamada K, Uchiyama A, Shimamura M, Inoue-Bungo T, Baba S, Sato K, Ogata K
    • 学会等名
      Decode winter workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Effect of methylations of Runx1 by PRMT1 on its transactivation activity.2010

    • 著者名/発表者名
      Baba S, Shiina M, Bungo T, Shimamura M, Uchiyama A, Ogata K
    • 学会等名
      Decode winter workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of cooperative DNA binding activity between c-Ets1 and Runx1 on various DNA.2010

    • 著者名/発表者名
      Uchiyama A, Shiina M, Hamada K, Bungo T, Shimamura M, Ogata K
    • 学会等名
      Decode winter workshop 2010
    • 発表場所
      Yuzawa
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞内シグナルによるエンハンソソーム制御の分子機構ワークショップ:クロマチン遺伝子制御研究の現状と将来2010

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 浜田恵輔, 豊後泰子, 嶋村麻利子, 内山晃子, 馬場しほ, 佐藤光, 緒方一博
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of cooperative DNA binding activity between c-Ets1 and Runx1 on various enhancers.2010

    • 著者名/発表者名
      Uchiyama A, Shiina M, Hamada K, Bungo T, Shimamura M, Ogata K
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Context-dependent regulation of the Ets1-containing enhanceosome.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Hamada K, Bungo T, Shimamura M, Uchiyama A, Baba S, Sato K, Ogata K
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 分子構造を基盤としたシグナル伝達と転写制御2010

    • 著者名/発表者名
      緒方一博
    • 学会等名
      日本薬学会第130年会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] TCRαエンハンサーにおける転写制御因子複合体形成の制御機構解析2009

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Hamada K, Bungo T, Shimamura M, Uchiyama A, Baba S, Ogata K
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular mechanisms for allosteric regulation of Runxl activity2008

    • 著者名/発表者名
      Shiina M
    • 学会等名
      第21回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      山梨県北杜市
    • 年月日
      2008-06-25
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Regulatory mechanism of assembly of transcription factors on DNA2008

    • 著者名/発表者名
      Ogata K
    • 学会等名
      1st International Conference on Drug Design and Discovery
    • 発表場所
      Dubai
    • 年月日
      2008-02-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 分子構造の揺らぎに注目したRunx1/AML1の活性制御機構解析2008

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 嶋村麻利子, 豊後泰子, 緒方一博
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanisms for allosteric regulation of Runx1 activity.2008

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Shimamura M, Bungo T, Ogata K
    • 学会等名
      第21回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      山梨県北杜市
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Regulatory mechanism of assembly of transcription factors on DNA2008

    • 著者名/発表者名
      Ogata K.
    • 学会等名
      1st International Conference on Drug Design and Discovery
    • 発表場所
      Dubai,UAE
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 分子構造の揺らぎに注目したRunx1/AML1の活性制御機構解析2007

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 嶋村麻利子, 豊後泰子, 緒方一博
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 転写制御異常と白血病2007

    • 著者名/発表者名
      緒方一博
    • 学会等名
      第49回日本小児血液学会/第5回日本小児がん学会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] NMR analyses of molecular fluctuations of Runx1 and its correlation with functional regulations.2006

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Takata S, Bungo T, Shimamura M, Ogata K
    • 学会等名
      NBSJ Forum 2006: Molecular Biology- the next decade- Conference & Scientific Exhibition
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural basis for the diverse DNA sequence recognition by C/EBPαhomodimer.2006

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Takata S, Tahirov TH, Hamada K, Bungo T, Ogata K
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism for the diverse DNA sequence recognition by C/EBPβhomodimer.2005

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Tahir TH, Hamada K, Takata S, Ogata K
    • 学会等名
      第28回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡市
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural basis for the diverse DNA sequence recognition by C/EBPβhomodimer.2005

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Takata S, Hamada K, Ogata K
    • 学会等名
      XX Congress of the International Union of Crystallography, Florence
    • 発表場所
      Italy
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 転写制御とエピジェネティクス2008

    • 著者名/発表者名
      緒方一博, 浜田恵輔
    • 出版者
      南山堂
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 転写制御とエピジェネティクス転写制御因子の分子構造と作用機構2008

    • 著者名/発表者名
      緒方一博
    • 総ページ数
      16
    • 出版者
      南山堂
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] 実験医学別冊生命科学のための機器分析実験ハンドブック2007

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 緒方一博
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 実験医学増刊号「転写因子による生命現象解明の最前線」分子構造を基盤とした転写制御因子の活性制御機構2007

    • 著者名/発表者名
      緒方 一博
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 実験医学別冊 生命科学のための機器分析実験ハンドブツク 第8章 Biacore-タンパク質とリガンドとの相互作用の解析-2007

    • 著者名/発表者名
      椎名 政昭
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 分子生物学実験シリーズ「図・写真で観るタンパク構造・機能解析実験実践ガイド」2005

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 浜田恵輔, 緒方一博
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 分子生物学実験シリーズ「図・写真で観るタンパク構造・機能解析実験実践ガイド」タンパク質の立体構造解析を行うために-分子構造解析のためのタンパク質試料調整法2005

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭, 浜田恵輔, 緒方一博
    • 出版者
      メディカル ドゥ
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.decodesystems.jp/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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