単一細胞における全遺伝子の発現計測と環境応答制御の解析

• 研究課題/領域番号: 17076016
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 法政大学
• 研究代表者: 石浜 明 法政大学, 企画・戦略本部, 特任教授 (80019869)
• 研究分担者: 曲山 幸生 農業食品産業技術総合研究機構, 食品総合研究所, 上席研究員 (40343818) ; 山本 兼由 法政大学, 生命科学部, 准教授 (40351580)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 96,900千円 (直接経費: 96,900千円); 2009年度: 17,800千円 (直接経費: 17,800千円); 2008年度: 19,600千円 (直接経費: 19,600千円); 2007年度: 19,700千円 (直接経費: 19,700千円); 2006年度: 19,900千円 (直接経費: 19,900千円); 2005年度: 19,900千円 (直接経費: 19,900千円)
• キーワード: ナノバイオロジー / システム生物学 / ゲノム / 転写制御 / 一細胞観察 / プロモーター / 転写因子 / 大腸菌 / 環境応答 / プロモーター強度 / マイクロマニュピュレーション / ストレス応答 / 単一細胞 / 転写ネットワーク / 細胞個性学 / 転写因子ネットワーク / 細胞制御 / 転写包括制御 / ゲノム転写 / 転写装置 / 一細胞生命科学

研究概要

環境中の細菌は、細胞間で交信し、集団として環境悪化に対応する。異なった役割を果たしている細菌細胞の個性解明を目標に、「単一細胞観測装置」を開発し、単一細胞での転写の動態観測に初めて成功した。一方、環境に応じたゲノム転写パターン決定機構解明を目標に、大腸菌の300種類転写因子の全てについて、制御支配下遺伝子群の同定と調節機能の解析を実施した。本研究の成果を基盤に、新分野『細胞個性学』の確立を目指す。

研究成果

• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation: Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbial Reviews (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of the Escherichia coli csgD promoter: Interplay between five transcription factors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobic growth conditions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microb.Rev. 34(in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Promoter regulation of the E. coli csgD gene : Interplay between eight transcription factors in promoter binding. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Yamada, K., Kori, A., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 156(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobic growth conditions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S.H., Takeyasu,_K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 38(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Participation of regulator AscG of theβ-glucoside utilization operon in regulation of the propionate catabolism operon. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishida, Y., Kori, A., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 191(19) ページ: 6136-6144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of RNA-binding protein Hfq in the osmotic-response regulation of invE gene expression in Shigella sonnei. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Morita -Ishihara, T., Ishihama, A., Watanabe, H.
  • 雑誌名: BMC Microbiol 9 ページ: 110-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of leucine -response transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa -drug efflux. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 191(14) ページ: 4562-4571
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoE and StpA by polyamines at the level of translation in Escherichia coli under heat shock conditions. (2009)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Tabei, Y., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K., Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J. Baceriol. 191(17) ページ: 5348-5357
  • 査読あり
• [雑誌論文] Participation of regulator AscG of the β-glucoside utilization operon in regulation of the propionate catabolism operon. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishida, Y., Kori, A., Ishihama. A.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 6136-6144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Two modes of autoregulation of the murR repressor in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishii, D., Ishihama. A., Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnonl.Biochem. 73
  • NAID: 10027548218
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of RNA-binding protein Hfq in the osmotic-response regulation of invE gene expression in Shigella sonnei. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Morita-Ishihara, T., Ishihama, A., Watanabe, H.:
  • 雑誌名: BMC Microbiol. 9 ページ: 110-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of the E. coli csgD gene encoding the master regulator of biofilm formation : Interplay between multiple transcription factors (2009)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 186-190
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic SELEX for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : SELEX-clos and SELEX-chip procedures. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, Y., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 175-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of Ieucine-reponse transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa-drug efflux. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 4552-4571
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anaerobiosis-Induced novel nucleoid protein of Escherichia coli : Architectural rofe in genome DNA compaction. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamada, K., Kobayashi, N., Kori, A., Yoshimurd, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 179-182
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation : Escherichia coli gcl promoter. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Nakajima,M., Shimada, T., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama. A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 175-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoE and StpA by polyamines at the level of translation in Escherichia coli under heat shock conditions. (2009)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Tabei, Y., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama. A., Igarashi, K., Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 5348-5357
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of CitA-CitB signal transduction activating genes involved in anaerobiccitrate catabolism in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Minagawa, S., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnonl.Biochem. 73 ページ: 346-350
  • 査読あり
• [雑誌論文] On-chip cell immobilization and monitoring system using thermosensitive gel controlled by suspended polymeric microbridge. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 雑誌名: IEEE Transaction NanoBioscience 8 ページ: 312-317
  • 査読あり
• [雑誌論文] On-chip temperature control under suspended microbridge for cell immobilizsiion and cutture system. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Iahihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 雑誌名: Proc. 13^<th> Internatl. Conf. Miniaturized Systems for Chemist.Life Sci 2009
• [雑誌論文] Characterization of CitA-CitB signal transduction activating genes involved in anaerobic citrate catabolism in Escherichia coil (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, E, Minagawa, S., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 73 ページ: 346-350
  • 査読あり
• [雑誌論文] AllR is the allantoin/glyoxylate sensing master regulator of the genes for degradation and reutilization of purines. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa, A., Ogasawara, H., Kori, A., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 154 ページ: 366-3378
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of RNA binding protein Hfq in the post-transcriptional regulation of invE gene expression in Shigella sonnei. (2008)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Ishihara, T., Ishihama, A., Watanabe, H.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 5738-5747
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli RutR transcription factor binds at targets within genes as well as intergenic regions. (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Ishihama, A., Busby, S.J.W., Grainger, D.C.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36(12) ページ: 3950-3955
  • 査読あり
• [雑誌論文] The uncharacterized YdhM is the regulator of the nemA gene, coding for N-ethylmaleimide reductase. (2008)
  • 著者名/発表者名: Umezawa, Y., Ogasawara, H., Shimada, T., Kori, A., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 190(17) ページ: 5890-5897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anaerobic regulation of citrate fermentation by CitAB in Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 72(11) ページ: 3011-3014
  • NAID: 10027534304
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of multiple transcription factors for metal-induced spy gene expression in Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ogasawara, H., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Biotechnol. 133(16) ページ: 80-6084
  • 査読あり
• [雑誌論文] AIIR is the allantoin/glyoxylate-sensing master regulator of the genes for degradation and reutilization of purines (2008)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa, A., Ogasawara, H., Kori, A. and Ishihama, A
  • 雑誌名: Microbiology 154 ページ: 3366-3378
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of RNA binding protein Hfq in the post-tanscriptional regulation of invE gene expression in Shigella sonnei (2008)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Ishihara, T, Ishihama, A. and Watanabe, H
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 283 ページ: 5738-5747
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coil RutR transcription factor binds at targets within genes as well as intergenic regions (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Ishihama, A., Busby, S.W. and Grainger, D.C
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 36 ページ: 3950-3955
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation (2008)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Hasegawa, A., Kori, A., Magdy, E-S., Nakajima, M.,,Lin, Y-C., Yamanshi, Y., Arai, F., Fukuda,T. and Ishihama, A
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics and Human Science 2008 ページ: 301-306
• [雑誌論文] The uncharacterized YdhM is the regulator of the nemA gene, coding for N-ethylmaleimide reductase (2008)
  • 著者名/発表者名: Umezawa, Y., Ogasawara, H., Shimada, T., Kori, A. and Ishihama, A
  • 雑誌名: J. Bacteriol 190 ページ: 5890-5897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anaerobic regulation of citrate fermentation by CitAB in Escherichia (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N. and Ishihama, A
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnoi. Biochem 72 ページ: 3011-3014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of multiple transcription factors for metal-induced spy gene expression in Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ogasawara, H. and Ishihama, A
  • 雑誌名: J. Biotechnol 133 ページ: 6080-6084
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of the recognition sequences of DNA-binding transcription factors within the Esherichia coil genome using a newly developed 'Promoter Chip" (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Shimada,T. and lshihama, A.
  • 雑誌名: Mcro-Nano Mechatronics and Human Science 2008 ページ: 307-310
• [雑誌論文] On-chip temperature sensing and control for cell immobilization and culture system (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Chow, E., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T. and Arai, F
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics and Human Science 2008 ページ: 295-300
• [雑誌論文] Involvement of RNA binding protein Hfq in the post-tanscriptionat regulation of invE gene expression in Shigella sonnei (2008)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Ishihara, T., Ishihama, A. and Watanabe, H.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 5738-5747
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli RutR transcription factor binds at targetswithin genes as well as intergenic regions (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Ishihama, A., Busby, S. J. W. and Grainger, D.C
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Role of omega subunit of RNA polymerase in expression of the relA Gene in Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatterji, D., Ozoline, O., Ogawa, Y. Shimada, T., Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett. 267(1) ページ: 51-55
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic SELEX search for target genes under the control of PhoQP-RstBA signal relay cascade. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Hasegawa, A., Kanda, E., Miki, T., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189(13) ページ: 4791-4799
  • 査読あり
• [雑誌論文] PdhR (pyruvate dehydrogenase complex regulator) controls the respiratory electron transport system in Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Ishida, Y., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189(15) ページ: 5534-5541
  • 査読あり
• [雑誌論文] RutR is the uracil/thymine -sensing master regulator of a set of genes for synthesis and degradation of pyrimdines. (2007)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Hirao, K., Kori, A., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 66(3) ページ: 744-779
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoN, Cra and H -NS by polyamines at the level of translation Escherichia coli cultured with glucose and glutamate. (2007)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Taniguchi, S., Shigemasa, A., Nishimura, K., Kashiwagi, K., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 189(6) ページ: 2359-2368
  • 査読あり
• [雑誌論文] folA a new member of the TyrR regulon in Escherichia coli K-12. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yang, J., Ogawa, Y., Camakaris, H., Shimada, T., Ishihama, A., Pittard, A.J.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189(16) ページ: 6080-6084
  • NAID: 120000993292
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of omega subunit of RNA polymerase in expression of the relA gene in Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatterji, D., Ozoline, O., Ogawa, Y. Shimada, T. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett. 267 ページ: 51-55
• [雑誌論文] Host factor Ebp1: Selective inhibitor of influenza virus RNA polymerase (2007)
  • 著者名/発表者名: Honda, A., Okamoto, T. and Ishihama, A
  • 雑誌名: Genes Cells 12 ページ: 133-142
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multi-scale genetics towards understandig the regulatory roles of all 300 transcription factors from a single organism Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Teramoto, J., Shimada, T., Hasegawa, A., Umezawa, Y., Yabuki, K., Ishida, Y., Inaba, T., Kori, A., Yamada, K., Kitai, Y., Kobayashi, N., Kato, D. and Yamamoto, K
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics and Human Science 2007 ページ: 35-37
• [雑誌論文] Genomic SELEX search for target genes under the control of PhoQP-RstBA signal relay cascade (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Hasegawa, A., Kanda, E., Miki, T., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189 ページ: 4791-4799
  • 査読あり
• [雑誌論文] PdhR (pyruvate dehydrogenase complex regulator) controls the respiratory electron transport system in Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Ishida, Y., Yamada, K., Yamamoto, K.and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189 ページ: 5534-5541
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preparation and preliminary X-ray diffraction analysis of crystals of bacterial flagellar sigma factor o^<28> in complex with the o^<28>-bindingregion of its anti-sigma factor FlgM (2007)
  • 著者名/発表者名: Okuda, K., Ichihara, H., Takahashi, H., Fujita, N., Ishihama, A. and Hakoshima, T.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F63 ページ: 196-199
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel two-component signaling system that activates transcription of an enerohemorrhagic Escherichia coli effector involved in remodeiing of host actin (2007)
  • 著者名/発表者名: Reading, C.R., Torres, A.G., Kendall, M.M., Huges, D.T., Yamamoto, K. and Sperandio, V.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189 ページ: 2468-2476
  • 査読あり
• [雑誌論文] RutR is the uracil/thymine-sensing master regulator of a set of genes for synthesis and degradation of pyrimdines (2007)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Hirao, K., Kori, A., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 66 ページ: 744-749
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoN, Cra and H-NS bypolyamines at the level of translation Escherichia coli cultured with glucose and glutamate (2007)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Taniguchi, S., Shigemasa, A., Nishimura, K., Kashiwagi, K., Yamamoto, K., Ishihama, A. and Igarashi,
  • 雑誌名: J. Bactereiol. 189 ページ: 2359-2368
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of ‘Promoter Chip' for microarray analysis of regulation targets of transcription factors (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics and Human Science 2007 ページ: 35-40
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of multiple transcription factors for metal-induced spygene expression in Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ogasawara, H. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Biotechnol. 133 ページ: 6080-6084
  • 査読あり
• [雑誌論文] folA a new member of the TyrR regulon in Escherichia coli K-12 (2007)
  • 著者名/発表者名: Yang, J., Ogawa, Y., Camakaris, H., Shimada, T., (shihama, A. and Pittard, A.J.:
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189 ページ: 6080-8084
  • 査読あり
• [雑誌論文] 代謝糸を統合的に制御する包括転写因子-ひとつの生物の全ての転写因子の調節機能同定を目指して- (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 遺伝 21 ページ: 322-332
• [雑誌論文] 大腸菌ゲノム発現カスケードー「細胞個性学」事始め- (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 日本ロボット学会誌 25 ページ: 32-35
  • NAID: 10018869516
• [雑誌論文] 大腸菌ゲノムの転写包括制御 - ひとつの生物の全ての転写因子の調節機能同定をめざして- (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 実験医学 25 ページ: 1531-1538
• [雑誌論文] レーザー暗視野顕微鏡を用いたサルモネラ菌べん毛のらせんパラメータ観測 (2007)
  • 著者名/発表者名: 西鳥羽恵美、曲山幸生、高野泰斉、飯野正昭、工藤成史
  • 雑誌名: 可視化情報学会論文集 27 ページ: 15-21
  • NAID: 130004438187
• [雑誌論文] グラム陽性菌とグラム陰性菌における金属応答機構 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由, J.L. Hobman, 大島 拓
  • 雑誌名: 化学と生物 45 ページ: 164-167
• [雑誌論文] The role of omega subunit of RNA polymerase in expression of the relA gene in Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatterji, D., Ozoline, O., Ogawa, Y., Shimada, T., Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett. 267 ページ: 51-55
• [雑誌論文] Host factor Ebpl : Selective inhibitor of influenza virus RNA polymerase. (2007)
  • 著者名/発表者名: Honda, A., Okamoto, T., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Genes Cells 12 ページ: 133-142
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoN, Cra and H-NS by polyamines at the level of translation Escherichia coli cultured with glucose and glutamate. (2007)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Taniguchi, S., Shigemasa, A., Nishimura, K., Kashiwagi, K., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189 ページ: 2359-2368
• [雑誌論文] Genomic SELEX search for target genes under the control of PhoQP-RstBA signal relay cascade. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Hasegawa, A., Kanda, E., Miki, T., Yamamoto, K, Ishihama.A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189(In press)
• [雑誌論文] PdhR (pyruvate dehydrogenase complex regulator) controls the respiratory electron transport system in Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Ishida, Y., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 189(In press)
• [雑誌論文] Anaerobic regulation of citrate metabolism by CitAB two-component signal transduction in Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N., Ishihama, A
  • 雑誌名: J. Biolechnol. 130(In press)
• [雑誌論文] 大腸菌における金属ホメオスタシス (2007)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由, 石浜 明
  • 雑誌名: バイオサイエンスとバイオインダストリー 64 ページ: 151-154
  • NAID: 10017315807
• [雑誌論文] 代謝系を統合的に制御する包括転写因子-ひとつの生物の全ての転写因子の調節機能同定を目指して- (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 生物の科学 遺伝 別冊21
• [雑誌論文] 大腸菌ゲノムの転写包括制御-ひとつの生物の全ての転写因子の調節機能同定をめざして- (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 転写因子をモデルとしたグローバル制御へのアプローチ(実験医学) 増刊号(印刷中)
• [雑誌論文] Enhancement of +1 frameshift by polyamines during translation of polypeptide release factor 2 in Escherichia coli. (2006)
  • 著者名/発表者名: Higashi, K., Kashiwagi, K., Taniguchi, S., Terui, Y., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 281 ページ: 9527-9537
  • 査読あり
• [雑誌論文] The dynamic state of DNA topology is essential for genome condensation in bacteria. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohniwa, R.L., Morikawa, K., Kim, J., Ohta, T., Ishihama, A., Wada, C., Takeyasu, K.
  • 雑誌名: EMBO J. 25 ページ: 5591-5602
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of copper -inducible promoters regulated by CpxA/CpxR in Escherichia coli. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 70 ページ: 1688-1695
  • NAID: 10018529229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of+1 frameshift by polyamines during translation of polypeptide release factor 2 in Escherichia coli. (2006)
  • 著者名/発表者名: Higashi, K., Kashiwagi, K., Taniguchi, S., Terui, Y., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 281 ページ: 9527-9537
• [雑誌論文] The dynamic state of DNA topology is essential for genome condensation in bacteria. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohniwa, R.L., Mirikawa, K., Kim, J., Ohta, T., Ishihama, A., Wada, C., Takeyasu, K.
  • 雑誌名: EMBO J. 25 ページ: 5591-5602
• [雑誌論文] Characterization of copper-inducible promoters regulated by CpxA/CpxR in Escherichia coli. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 70 ページ: 1688-1695
  • NAID: 10018529229
• [雑誌論文] Multi-scale genetics towards understanding the hierarchy of transcription factor network in genome regulation. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Hasegawa, A., Umezawa, Y., Yabuki, K., Ishida, Y., Inaba, T., Matsui, M., Kori, A., Yamada, K., Hirao, K., Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2006(In press)
• [雑誌論文] Improvement in motion efficiency of a spirochee Bracyspira pilosicoli in viscous environments (2006)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, K., Magariyama, Y., Isobe, S.
  • 雑誌名: Biophys. J. 89 ページ: 513-526
• [雑誌論文] Anisotropic growth of Vibrio alginolyticus colonies affected by their neighboring colobies (2006)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, K., Magariyama, Y., Isobe, S.
  • 雑誌名: Curr. Microbiol.
• [雑誌論文] 大腸菌細胞分化の遺伝子発現カスケード : 「細胞個性学」の幕開け (2006)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 51 ページ: 958-965
  • NAID: 40007357935
• [雑誌論文] Enhancement of +1 frameshift by polyamines during translation of polypeptide release factor 2 in Escherichia coli (2006)
  • 著者名/発表者名: Higashi, K., Kashiwagi, K., Taniguchi, S., Terui, Y., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. (In press)
• [雑誌論文] Gene expression profiling of Escherichia coli and regulatory role of RNA polymerase omega subunit in stringent control of transcription (2006)
  • 著者名/発表者名: Chatterji, D., Ozoline, O., Ogawa, Y., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology (In press)
• [雑誌論文] Systematic search for the Cra-binding promoters using genomic SELEX. (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Maeda, M., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Genes Cells 10(9) ページ: 907-918
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 55(1) ページ: 215-227
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external zinc. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 187(18) ページ: 6333-6340
  • NAID: 120000993462
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional characterization in vitro of all two-component signal transduction systems from Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Hirano, K., Ohshima, T., Aiba, H., Utsumi, R., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 280(2) ページ: 1448-1456
  • 査読あり
• [雑誌論文] Systematic search for the Cra-binding promoters using genomic SELEX (2005)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Maeda, M., Ishihama, A
  • 雑誌名: Genes Cells 10(9) ページ: 907-918
• [雑誌論文] Cross-talks in signal transduction network among all two-component systems in Escherichia coli (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, Y., Hirano, K., Ohshima, T., Aiba, H., Utsumi, R., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280(2) ページ: 1448-1456
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, Y., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. 55(1) ページ: 215-227
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external zinc (2005)
  • 著者名/発表者名: K.Yamamoto, A.Ishihama
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 187(18) ページ: 6333-6340
  • NAID: 120000993462
• [雑誌論文] Negative regulation of DNA repair gene (uvrA) expression by ArcA/ArcB two-component system in Escherichia coli (2005)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Teramoto, J., Hirao, K.Yamamoto, K., Ishihama, A., Utsumi, R.
  • 雑誌名: FEMS Microbi.Letters
• [雑誌論文] Studies of Schizosaccharomyces pombe TFIIE indicate conformational and functional changes in RNA polymerase II at transcription initiation (2005)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, K., Watanabe, T., Tanaka, A., Furumoto, T., Sato-Tsuchiya, C., Kimura, M., Yokoi, M., Ishihama, A., Hanaoka, F., Ohkuma, Y.
  • 雑誌名: Genes Cells 10(1) ページ: 207-224
• [雑誌論文] The fission yeast protein, Ker1p, is an ortholog of RNA polymerase I subunit A14 in Saccharomyces cerevisiae, and is required for stable association of Rrm3 and RPA21 in Pol I (2005)
  • 著者名/発表者名: Imazawa, Y., Hisatake, K., Mitsuzawa, H., Matsumoto, M., Tsukui, T., Nakagawa, K., Nakadai, T., Shimada, M., Ishihama, A., Nori, Y.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280(12) ページ: 11467-11474
• [雑誌論文] Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase associates with RNA polymerase II and interacts with its Rpb7 subunit (2005)
  • 著者名/発表者名: Mitsuzawa, H., Kimura, M., Kanda, E., Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEBS Letters 579(1) ページ: 48-52
• [雑誌論文] Difference in bacterial motion between forward and backward swimming caused by the wall effect (2005)
  • 著者名/発表者名: Kudo, S., Imai, N., Nishitoba, M., Sugiyama, S., Magariyama, Y.
  • 雑誌名: FEMS Microb.Letters 89(6) ページ: 221-225
• [雑誌論文] Asymmetric swimming pattern of Vibrio alginolyticus cells with single polar flagella (2005)
  • 著者名/発表者名: Magariyama, Y., Ichiba, M., Nakata, K., Baba, K., Ohtani, T., Kudo, S., Goto, T.
  • 雑誌名: Biophys.J. 88(5) ページ: 3648-3658
• [雑誌論文] Analysis on deformation of helical flagella of Salmonella (2005)
  • 著者名/発表者名: Takano, Y., Kudo, S., Nishitoba, M., Magariyama, Y.
  • 雑誌名: JSME Internatl.J., Series C 48(4) ページ: 513-520
• [学会発表] rokaryotic genome regulation: Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Japan -India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB), Hyderabad, India
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: CCMB, Hyderabad(India)
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-targetregulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: CDFD, Hyderabad(India)
  • 年月日: 2010-03-16
• [学会発表] 大腸菌新規核様体タンパクDanの発見と構造機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・吉村成弘・山田佳代子・郡彩子・竹安邦夫・石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第8回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-03-11
• [学会発表] 細菌単-細胞での転写制御の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・山西陽子・大山晃太郎・中島正博・新井史人・福田敏男・石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第8回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-03-11
• [学会発表] 細菌ゲノム制御全体像解明のための戦略戦術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本大学学術研究高度化推進事業公開シンポジウム「病原体抑制遺伝子の解明と感染症の制御」
  • 発表場所: 日大・オープンリサーチセンター, 東京
  • 年月日: 2010-02-26
• [学会発表] 細菌ゲノム制御全体像解明のための戦略戦術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本大学学術研究高度化推進事業公開シンポジウム「病原体抑制遺伝子の解明と感染症の制御」
  • 発表場所: 日本大学(東京)
  • 年月日: 2010-02-26
• [学会発表] 細菌細胞の個性:その分子基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 九州大学G-COE「未来分子システム科学」公開セミナー
  • 発表場所: 九州大学先導物質化学研究所、福岡
  • 年月日: 2010-02-09
• [学会発表] 細菌細胞の個性:その分子基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 九州大学G-COE「未来分子システム科学」公開セミナー
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-02-09
• [学会発表] 多様な環境要因に応答するcsgDプロモーターの転写制御に関わる分子機構の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010大会
  • 発表場所: 東京大学(東京)
• [学会発表] 大腸菌転写因子CRPのゲノム上結合部位の全体像:Genomic SELEX法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕, 藤田信之, 山本兼由, 石浜明
  • 学会等名: 第4回ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
• [学会発表] モリブデンを感知する転写因子ModEに制御される新規非翻訳RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第8回微生物研究会
  • 発表場所: 日本大学湘南キヤンパス(神奈川)
  • 年月日: 2009-05-30
• [学会発表] Genomic SELEX search for regulation targets by 100 species of uncharacterized transcription factors from E. coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 12th Transcription Assembly
  • 発表場所: Chandigarh, India
• [学会発表] Growth phase-dependent regulation of csgD, the master regulator of biofilm formation: Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 3 rd Internatl. Conf. Environ. Indust. Appl. Microbiol. (BioMicroWorld2009)
  • 発表場所: Lisbon, Portugal
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本生化学会第82回大会シンポジウム"細菌の生存戦略をめぐる新たな展開"
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
• [学会発表] 大腸菌における環境金属応答のゲノム転写制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: メタルバイオサイエンス研究会2009
  • 発表場所: 東京大学、東京
• [学会発表] Genomic SELEX search for regulation targets by 100 species of uncharacterized transcription factors from E.coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 12^<th> Transcription Assembly
  • 発表場所: Chandigarh(India)
• [学会発表] Growth phase-dependent regulation of csgD, the master regulator of biofilm formation : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama. A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K.
  • 学会等名: 3^<rd> Internatl. Conf. Environ. Indust. Appl. Microbiol.(BioMicroWorld2009)
  • 発表場所: Lisbon(Portugal)
• [学会発表] Regulatory roles of nucleoid-associated proteins in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama. A., Teramoto, J., Ogasawara, H., Shimada, T., Yamamoto, K.
  • 学会等名: 32^<nd> Ann.Meet.Mol.Biol.Soc.Japan
  • 発表場所: Pacifico Yokohama(Japan)
• [学会発表] Control of biofilm formation by Escherichia coli : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya, Univ.(Japan)
• [学会発表] Noveltechnologies for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : Genomic SELEX and SELEX-chip. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20th Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Unv.(Japan)
• [学会発表] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation : Escherichia coli gcl promoter. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Nakajima, M., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama, A.
  • 学会等名: 3^<rd> Internatl.Conf.Environ.Indust.Appl.Microbiol.(BioMicroWorld2009)
  • 発表場所: Lisbon(Portugal)
• [学会発表] Anaeoboriosis-induced novel nucleold protein Dan in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ.(Japan)
• [学会発表] Single live-cell cell assay of promoter activity and regulation. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Shohata, E., Kori, A., Nakajima, M., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ.(Japan)
• [学会発表] A single cell immobilization and culture system under suspenced polymeric microbridge with compartments. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ.(Japan)
• [学会発表] On-chip temperature control under suspended microbridge for cell immobilization and culture system.A (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 学会等名: 3^<th> Internatl.Conf.Miniaturized Systems for Chemist.Life Sci.(mTAS)
  • 発表場所: Jeju(Korea)
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 2008年度「べん毛研究会」
  • 発表場所: 秋保グランドホテル(宮城)
• [学会発表] 細菌の環境金属応答のゲノム制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明・小笠原寛・島田友祐・寺本潤・小林尚貴・郡彩子・山田佳代子・山本兼由
  • 学会等名: メタロチオネインおよびメタルバイオサイエンス研究会2009
  • 発表場所: 東京大学(東京)
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明・小笠原寛・島田友祐・寺本潤・小林尚貴・郡彩子・山田佳代子・山本兼由
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会シンポジウム「細菌の生存戦略をめぐる新たな展開」
  • 発表場所: 神戸ポートピア(神戸)
• [学会発表] 大腸菌転写因子YpdB支配下制御遺伝子群の同定と制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲葉達也・山田佳代子・郡彩子・石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YkgDの制御標的遺伝子群の同定と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大貫章吾・寺本潤・郡彩子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 多因子が関与する大腸菌Curli線毛発現制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 福岡メッセ(福岡)
• [学会発表] Control of biofilm formation by Escherichia coli : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YidZの制御標的遺伝子群の同定と制御機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 片山泰徳・小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YbjKによる転写制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 河北寿一・島田友裕・山田佳代子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YneJによる転写制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 國友雄介・寺本潤・山田佳代子・長谷川明子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Quorum Sensing転写因子QseAの調節機能の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴・寺本潤・五浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] Quorum-sensing transcription factor QseA of Escherichia coli : Search forregulation targets and analysis of regulatory modes. (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴・稲葉達也・山田佳代子・寺本潤・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Genomic SELEXを用いた大腸菌Leu0の転写制御機構解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] 細胞分裂調節因子SdiAに影響するHomoserine Lactone類似体の同定と新規支配下遺伝子群の探索 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田佳織・鍛代悠一・松井誠・島田友裕・五十嵐潤・菅裕明・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友祐・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 福岡メッセ(福岡)
• [学会発表] Genomic SELEXを用いた大腸菌Leu0の転写制御機構解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友祐・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Involvement of the leucine response transcription factor Leu0 in regulation of the genes for sulfa drug efflux. (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] ビフィズス菌の共存時に発現する大腸菌プロモーター (2009)
  • 著者名/発表者名: 田村正典・村田侑子・森田英利・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Identification of promoters induced in Escherichia coli growing with Bifidobacterium. (2009)
  • 著者名/発表者名: 田村正典・村田侑子・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 嫌気条件で誘導される大腸菌新規核様体タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・吉村成弘・竹安邦夫・石浜明
  • 学会等名: 第6回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・山西陽子・Magdy, E-S.H.・長谷川明子・正畑絵理・新井史人・福田敏男・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌転写因子DeoRの新規標的遺伝子群の同定と制御機能解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中川史之・島田友裕・石田雄士・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌全tRNA遺伝子発現プロファイルの解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川喬彬・梅林章・五浜明・前田理久
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Novel non-coding RNA regulated by ModE in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] モリブデンを感知する転写因子ModEに制御される新規非翻訳RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートピア(神戸)
• [学会発表] Autoregulation of the murR repressor that regulate the enzymes for the degradation of N-acetylymuramic acid in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Genomic SELEX search for regulation targets by 100 species of uncharacterized transcription factors from E. coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A
  • 学会等名: 12^<th> Transcription Assembly
  • 発表場所: Chandigarh, India
• [学会発表] Comprehensive analysis for the recognition sequences of DNA-binding transcription factors within the E. coli genome using the newly developed 'Promoter Chip' (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Shimada, T. and Ishihama, A
  • 学会等名: 21st RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: Bristol, UK
• [学会発表] 嫌気条件で誘導される大腸菌新規核様体タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤、吉村成弘、竹安邦夫、石浜明
  • 学会等名: 定領域研究「バイオ操作」第7回公開シンポジウム
  • 発表場所: エレクトローンホール宮城・仙台
• [学会発表] 大腸菌転写因子YpdB支配下制御遺伝子群の同定と制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲葉達也、山田佳代子、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学・東京
• [学会発表] Quorum Sensing転写因子QseAの調節機能の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴、寺本潤、石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学・東京
• [学会発表] Genomic SELEXを用いた大腸菌転写因子LeuOの転写制御機構解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学・東京
• [学会発表] 大腸菌ゲノム転写の包括制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第7回公開シンポジウム
  • 発表場所: ユレクトローンホール宮城・仙台
• [学会発表] 多因子が関与する大腸菌Curli線毛発現制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛, 郡彩子, 山田佳代子, 山本兼由, 石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 国際会議場・福岡
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、平尾貴世、郡彩子、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 国際会議場・福岡
• [学会発表] 新規ゲノム研究資材を用いたゲノム機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2008年関東支部大会
  • 発表場所: 山梨大学・甲府
  • 年月日: 2008-10-11
• [学会発表] 大腸菌における全りボゾーム蛋白質遺伝子の発現解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 梅林章、片寄純也、石浜明、前田理久
  • 学会等名: 日本農芸化学会2008年関東支部大会
  • 発表場所: 山梨大学・甲府
  • 年月日: 2008-10-11
• [学会発表] 還元条件下における大腸菌センサーキナーゼ活性の変化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由
  • 学会等名: 第7回微生物研究会
  • 発表場所: 東京工業大学・横浜
  • 年月日: 2008-06-14
• [学会発表] 20 years of progress with RNA polymerase. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 20 th RNA Polymerase Workshop.
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Multi-factor promoters and multi-factor networks. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 20 th RNA Polymerase Workshop.
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Multi-scale genetics towards understanding the regulatory roles of all transcription factors from a single organism Escherichia coli. Asian Conference on Transcription (ACT) (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 10th Meeting, Jan.
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] Transcription factor-promoter interaction networks. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 2005 Internatl. Symp. Micro-Nano Mechatronics & Human Science
  • 発表場所: Nagoya, Japan.
• [学会発表] 20 years of progress with RNA polymerase (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: 20^<th> RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Multi-factor promoters and multi-factor networks. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Hasegawa, A., Umezawa, Y., Kori, A., Yamada, K. and Yamamoto, K.
  • 学会等名: 20^<th> RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Single live-cell assay of promoter activity and regulation. (2008)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Hasegawa, A., Shohata, E., Kori, A., Magdy, E-S. H. Nakajima, M., Lin, Y-C., Yamanishi, Y., Magariyama, Y, Arai,F., Fukuda, T. and Ishihama, A.
  • 学会等名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. Symp.
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] Distribution of a DNA-binding Protein using the Novel 'Promoter Chip' (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 学会等名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. Symp.
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] On-chip temperature sensing and control for cell immobilization and culture system (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamaristj Y, Chow, E, Teramdo, J., Magariyarta, Y., Ishisma, A, Ftiatia, T and Arai, F
  • 学会等名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. Symp.
  • 発表場所: Napova, Japan
• [学会発表] Global regulation of genome transcription : Multi-factor promoters and multi-factor networks (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A
  • 学会等名: 2008 Asian Academic Seminar(AAS)
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] Stress response to sub-lethal metals in Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K
  • 学会等名: 2008 Asian Academic Seminar(AAS)
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] 単一細胞観測系による大腸菌遺伝子プロモーター強度測定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤、長谷川明子、E-SH Magdy、郡彩子、中島正博、林育菁、小笠原寛、新労史人、福田敏男、石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作]第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: キャンパスプラザ・京都
• [学会発表] 大腸菌転写因子AsoGの制御機能の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石田雄士, 郡彩子, 石浜明
  • 学会等名: 2008年日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 大学セミナーハウス・八王子
• [学会発表] 大腸菌csgDプロモーターの制御 : 原核生物の多因子支配プロモーター (2008)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛, 郡彩子, 山田佳代子, 山本兼由, 石浜明
  • 学会等名: 2008年日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 大学セミナーハウス・八王子
• [学会発表] Genomio SELEXとCh1P-chip法による大腸菌機能未知転写因子YcdCのゲノム上結合領域の同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、Grainger. D.、Busby, S.J. W. 山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 2008年日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 大学セミナ-ハウス・八王子
• [学会発表] ポリマー製マイクロブリッジを用いた細胞固定培養システム (2008)
  • 著者名/発表者名: 山西陽子、寺本潤、曲山幸生、石浜明、福田敏男、新井史人
  • 学会等名: 第18回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
  • 発表場所: 京都大学・京都
• [学会発表] 植物由来の配糖体取り込み系を制御する大腸菌転写因子AscGの機能解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石田雄士、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] 大腸菌転写因子YpdBによる制御遺伝子の同定と制御機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 稲葉達也、山田佳代子、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] 多因子が関与するCurli繊毛発現調節の分子機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛、山田佳代子、郡彩子、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] Quorum Sensing転写因子QseAの調節機能の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴、寺本潤、山田佳代子、石浜明
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] ChlP-chip法による大腸菌転写因子RutRのゲノム上結合領域の同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、石浜明、Busby, S.J.W., Grainger, D.
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] 大腸菌の嫌気条件下発現新規核様体蛋白質の同定と特性解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤、吉村成弘、郡彩子、竹安邦夫、石浜明
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] 定常期におけるポリアミンの大腸菌の生存率維持に果たす役割 (2008)
  • 著者名/発表者名: 照井祐介、東恭平、田部井譲、秋山真律子、富取秀行、山本兼由、石浜明、五十嵐一衛、柏木敬子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国際展示場・神戸
• [学会発表] Multi-Scale Genetics towards Understanding the Regulatory Roles of All Transcription Factors from a Single Organism Escherichra coli (2008)
  • 著者名/発表者名: A, Ishihama
  • 学会等名: 10th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] Identification of a Novel Nucleoid Protein(NNP)with Enhancing Activity of Nuclease Sensitivity in Escherichia coli Grown under Anaerobic Conditions (2008)
  • 著者名/発表者名: J. Teramoto, N. Kobayashi, A. Kori and A. Ishihama
  • 学会等名: 10th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] RutR is the Uracil/Thymine Sensing Master Regulator of a Set of Genes for Synthesis and Degradation of Pyrimidines (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Hirao, K., Kori, A., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 学会等名: 10th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] Transcriptional Response of Escherichia coli to External Metals (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Yamamoto and A, Ishihama
  • 学会等名: 10th Asian Conference on Transcription
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] 20 years of progress with RNA polymerase (2008)
  • 著者名/発表者名: A. Ishihama
  • 学会等名: 20th RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] Multi-factor promoters and multi-factor networks (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Hasegawa, A., Umezawa, Y., Yabuki, K., Ishida, Y., Inaba, T., Kori, A., Yamada, K. and Yamamoto, K
  • 学会等名: 20th RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: York, UK
• [学会発表] 大腸菌金属感知転写因子群のGenomic SELEX法による機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 寛、渡邊智行、跡部裕之、片山泰徳、山田 佳代子、郡 彩子、山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 第二回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪大学、大阪
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 島田 友裕、平尾 貴世、郡 彩子、山本 兼由、石浜 明
  • 学会等名: 第二回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪大学、大阪
• [学会発表] 細菌の金属ストレスに対する転写応答の包括的な制御機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 名城大学、名古屋
• [学会発表] ゲノムの転写制禦:ひとつの生物のすべての転写因子の調節機能同定の試み (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会マスターズレクチャー
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
• [学会発表] 細菌の環境金属応答の転写包括制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜明・山本兼由・小笠原寛・島田友裕・寺本潤
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会ワークショップ「金属イオンのChemical Biology」
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
• [学会発表] Multi-scale genetics of transcription network: Understanding the regulatory roles of all 300 transcription factors from a single organism Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 2007 Micro-Nano Mechatronics and Human Science Symp.
  • 発表場所: Nagoya Univ.
• [学会発表] RutR is the uracil/thymine sensing regulator of a set of genes forsynthesis and degradation of pyrimidines (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Shimada, K. Hirao, A. Kori, K. Yamamoto, D. C. Grainger, S.J.W. Busby and A. Ishihama
  • 学会等名: RNA Polymerase Workshop
  • 発表場所: London, UK
• [学会発表] Involvement of RNA binding protein Hfq in the post-transcriptionairegulation of invE gene expression in Shigella sonnei (2007)
  • 著者名/発表者名: J. Mitobe, T. Morita-lshihara, A. Ishihama and H. Watanabe
  • 学会等名: US-Japan Conference on Pathogenic Bacteria
  • 発表場所: Washington, USA
• [学会発表] Multi-Scale Genetics of Transcription Network: Understanding the Regulatory Roles of All 300 Transcription Factors from a Single Organism Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: A. Ishihama, H. Ogasaawra, J. Teramoto, T. Shimada, A. Hasegawa, Y. Umezawa, K. Yabuki, Y. Ishida, T. Inaba, A. Kori, K. Yamada, Y. Kitai, N. Kobayashi, D. Katoand K. Yamamoto
  • 学会等名: 2007 Micro-Nano Mechatronics and Human Science Symp
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] Construction of a Novel 'Promoter Chip'for DNA Microarray (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Yamamoto and A. Ishihama
  • 学会等名: 2007 Micro-Nano Mechatronics and Human Science Symp
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] 大腸菌全転写因子の調節機能解明:PdhRとYhfRの機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石田雄士、小笠原 寛、山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: かずさアカデミアパーク、千葉
• [学会発表] 大腸菌単一細胞のプロモーター強度の測定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 寺本 潤、長谷川明子、曲山幸生、市川明彦、Elshimy Haitham、新井史人、福田敏男、石浜 明
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: かずさアカデミアパーク、千葉
• [学会発表] 宿主環境への細菌の適応に関与する共通遺伝子群の探索 (2007)
  • 著者名/発表者名: 皆川 周、藺牟田結衣、澤田真嗣、山本兼由、石浜明、後藤直正
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: かずさアカデミアパーク、千葉
• [学会発表] 嫌気条件でクエン酸に応答する大腸菌センサーキナーゼCitAの活性化機構 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由、大島 拓、藤田信之, 小笠原直毅、石浜 明
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: かずさアカデミアパーク、千葉
• [学会発表] ピルビン酸応答転写制御因子PdhRの機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 寛, 石田雄司, 山田佳代子, 石浜 明
  • 学会等名: 日本農芸化学会
  • 発表場所: 東京大学、東京
• [学会発表] ピルビン酸応答転写制御因子PdhRの転写抱括制御機能 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 寛, 石田雄司, 山田佳代子, 山本兼由, 石浜 明
  • 学会等名: 第4回大腸菌研究会
  • 発表場所: 藤枝エミナース、静岡
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 島田 友裕・平尾 貴世・郡 彩子・山本 兼由・石浜 明
  • 学会等名: 第4回大腸菌研究会
  • 発表場所: 藤枝エミナース、静岡
• [学会発表] 大腸菌単-細胞観測系の構築とプロモーター強度測定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長谷川明子、寺本 潤、曲山幸生、新井史人、福田敏男、石浜 明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」女性シンポジウム
  • 発表場所: 法政大学、東京
• [学会発表] Genomic SELEX法による大腸菌転写因子標的プロモーターの探索 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 寛、島田友祐、寺本 潤、長谷川明子、梅澤喜正、矢吹光史郎、石田雄士、稲葉達也、鍛代悠一、加藤大策、小林尚貴、山田佳代子、郡 彩子、山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 2007年日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 八王子セミナーハウス、東京
• [学会発表] ゲノムの転写制禦:ひとつの生物のすべての転写因子の調節機能同定の試み (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会マスターズレクチャー
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 細菌の環境境金属応答の転写包括制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明、山本兼由、小笠原 寛、島田友裕、寺本 潤
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会ワークショップ「金属イオンのChemical Biology」
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 大腸菌転写因子TorRの新規標的遺伝子群の探索と制御機構 (2007)
  • 著者名/発表者名: 稲葉達也、寺本 潤、三木健良、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YdhMの転写調節機能の解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: 梅澤喜正、小笠原 寛、山田佳代子、三木健良、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 大腸菌核様体構造蛋白質H-NSのゲノム包括制御における役割 (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢吹光史郎、島田友裕、三木健良、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 大腸菌新規核様体タンパク質の同定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 寺本 潤.吉村成弘、郡 彩子、竹安邦夫、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] Gurli繊毛発現調節の分子機構の解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小笠原 寛、山田佳代子、郡 彩子、山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] 大腸菌単一細胞観測系の構築とプロモーター強度測定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長谷川明子、寺本 潤、郡 彩子、曲山幸生、El-Shimy H. Magdy, 、中島正博、林 育菁、新井史人、福田敏男、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、平尾貴世、郡 彩子、山本兼由、石浜 明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会
  • 発表場所: みなとみらい、横浜
• [学会発表] マルチスケール遺伝学:大 腸菌全転写因子の機能同定 (2006)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: シンポジウム「マルチスケール操作によるシステム細胞工学」
  • 発表場所: 名古屋大学野依学術交流館
  • 年月日: 2006-06-30
• [学会発表] Transcription in E. coli: the big picture. (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: UK Integrated Biology of Escherichia coli Meeting
  • 発表場所: Birmingham, UK
  • 年月日: 2005-12-30
• [学会発表] ゲノム転写包括制御研究の戦略と戦術 (2005)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 東京大学化学生命工学セミナー
  • 発表場所: 東京大学、東京
• [学会発表] ノム全遺伝子で対応する細菌の環境応答 (2005)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第1回公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学、東京
• [学会発表] Genomic SELEX search for the genes and promoters under the control of E. (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: coli transcription factors. Transcription Assembly
  • 発表場所: Hyderabad, India
• [図書] The Nucleoid:an Overview.(A. Beak, R .Curtiss III, J. B. Kaper, P. D. Karp, F. C. Neidhardt, T.Nystree, J. M. Slauch, C. L. Squires, and D. Ussery, eds., In:EcoSal-Escherichia coliand Salmonella:cellular and molecular biology., Chapter 2.6) (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: ASM Press
  • URL: http://www.ecosal.org
• [図書] EcoSal-Escherichia coli and Salmonella : cellular and molecular biology. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: ASM (American Society for Mibrobiology) Press
• [図書] Escherichia coli and Salmonella (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A
  • 総ページ数: 1050
  • 出版者: American Society for Microbiology(ASM), Washington, USA
• [図書] Escherichia coli and Salmonella (2008)
  • 著者名/発表者名: A. Ishihama and S. Adhya
  • 出版者: American Society of Microbiology
• [図書] Methods in Enzymology, Vol. 422 (2007)
  • 著者名/発表者名: Okada, A., Gotoh, Y., Watanabe, T., Furuta, E., Yamamto, K. and Utsumi, R.
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Escherichia coli and Salmonella Cellular and Molecular Biology (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: American Society for Microbiology Press, Washington, DC(In press)
• [図書] バイオインフォマティクス事典 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 出版者: 共立出版,東京(印刷中)
• [図書] タンパク質の事典 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 出版者: 朝倉書店、東京(印刷中)
• [図書] タンパク質化学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石浜 明
  • 出版者: 広川書店、東京(印刷中)
• [図書] Micro-Nano Mechatronics and Human Science (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Shimada, T., Ogasawara, H., Teramoto, J., Yamamoto, K
  • 総ページ数: 130
  • 出版者: Transcription factor-promoter interaction networks