複製停止複合体によるS期とM期の連携機構の解明

• 研究課題/領域番号: 17080001
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 白髭 克彦 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 連携教授 (90273854)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 84,900千円 (直接経費: 84,900千円); 2009年度: 17,000千円 (直接経費: 17,000千円); 2008年度: 25,500千円 (直接経費: 25,500千円); 2007年度: 17,000千円 (直接経費: 17,000千円); 2006年度: 12,700千円 (直接経費: 12,700千円); 2005年度: 12,700千円 (直接経費: 12,700千円)
• キーワード: DNAチップ / 染色体分配 / 染色体動態 / 染色体複製 / 複製チェックポイント / ヘリカーゼ / MCM複合体 / チェックポイント因子 / ラギング鎖 / リーディング鎖 / ポリメラーゼ / 複製停止

研究概要

複製チェックポイントシグナル伝達系はゲノム情報の恒常性維持のために必須の機構である。本研究では複製チェックポイントのメディエーターとしての役割を持つTof1、Mrc1、Csm3による3者複合体がDNA2本鎖の巻き戻し酵素であるヘリカーゼとDNA合成酵素であるポリメラーゼを連結し、複製装置全体の構造を維持しつつ、複製過程を監視していることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] SCF(Dia2) regulates DNA replication forks during S-phase in budding yeast. (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Mimura, M. Komata, T. Kishi, K. Shirahige, T. Kamura
  • 雑誌名: EMBO J. 28 ページ: 3693-3705
  • 査読あり
• [雑誌論文] Csm3, Tof1, and Mrc1 form a heterotrimeric mediator complex that associates with DNA replication forks. (2009)
  • 著者名/発表者名: M. B, o, Y.M. Katou, M. Komata, H. Tanaka, T. Itoh, T. Sutani,, K. Shirahige
  • 雑誌名: J Biol Chem. 284 ページ: 34355-34365
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChIP-on-Chip Analysis of DNA Topoisomerases. (2009)
  • 著者名/発表者名: R. Bermejo, Y.M. Katou, K. Shirahige,, M. Foiani
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 582 ページ: 103-118
• [雑誌論文] Involvement of a chromatin remodeling complex in damage tolerance during DNA replication Nat. (2009)
  • 著者名/発表者名: K.B. Falbo*, C. Alabert*, Y. Katou*, S. Wu, J. Han, T. Wehr, J. Xiao, X. He, Z. Zhang, Y. Shi, K. Shirahige, P. Pasero,, X. Shen
  • 雑誌名: Struct. Mol. Biol. 16 ページ: 1167-1172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-Organizing Factors Top2 and Hmo1 Prevent Chromosome Fragility at Sites of S phase Transcription Cell (2009)
  • 著者名/発表者名: R. Bermejo, T. Capra, V. Gonzales-Huici, D. Fachinetti, A. Cocito, G. Natoli, Y. Katou, H. Mori, K. Kurokawa, K. Shirahige,, M. Foiani
  • 雑誌名: 138 ページ: 870-884
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Direct Binding of Mrc1, a Checkpoint Mediator, to Mcm6, a Replication Helicase, is Essential for Replication Checkpoint Against Methyl Methanesulfonate-induced Stress. (2009)
  • 著者名/発表者名: M. Komata, M. B, o, H. Araki,, K. Shirahige
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 29 ページ: 5008-5019
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rec8 guides canonical Spo11 distribution along yeast meiotic chromosomes. (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Kugou, T. Fukuda, S. Yamada, M. Ito, H. Sasanuma, S. Mori, Y. Katou, T. Itoh, K. Matsumoto, T. Shibata, K. Shirahige,, K. Ohta
  • 雑誌名: Mol Biol Cell. 20 ページ: 3064-3076
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ctf4 coordinates the progression of helicase and DNA polymerase alpha. (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Tanaka, Y. Katou, M. Yagura, K. Saitoh, T. Itoh, H. Araki, M. B, o#,, K. Shirahige#
  • 雑誌名: Genes Cells. 14 ページ: 807-820
  • 査読あり
• [雑誌論文] Budding Yeast Wpl1(Rad61)-Pds5 Complex Counteracts Sister Chromatid Cohesion- Establishing Reaction. (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Sutani, T. Kawaguchi, R. Kanno, T. Itoh,, K. Shirahige
  • 雑誌名: Curr. Biol. 19 ページ: 492-497
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Direct Binding of Mrc1, a Checkpoint Mediator, to Mcm6, a Replication Helicase, is Essential for Replication Checkpoint Against Methyl Methanesulfonate-induced Stress (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Komata, M.Bando, H.Araki, K.Shirahige
  • 雑誌名: Mol Biol Cell. 29 ページ: 5008-5019
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of a chromatin remodeling complex in damage tolerance during DNA replication (2009)
  • 著者名/発表者名: K.B.Falbo, C.Alabert, Y.Katou, S.Wu, J.Han, T.Wehr, J.Xiao, X.He, Z.Zhang, Y.Shi, K.Shirahige, P.Pasero, X.Shen
  • 雑誌名: Nat.Struct.Mol.Biol. 16 ページ: 1167-1172
  • 査読あり
• [雑誌論文] SCF(Dia2)regulates DNA replication forks during S-phase in budding yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Mimura, M.Komata, T.Kishi, K.Shirahige, T.Kamura
  • 雑誌名: Embo J 28 ページ: 3693-3705
  • 査読あり
• [雑誌論文] H. Tanaka#, Y. Katou#, M. Yagura, K. Saitoh, T. Itoh, H. Araki, M. Bando* and K. Shirahige* (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Tanaka#, Y. Katou#, M. Yagura, K. Saitoh, T. Itoh, H. Araki, M. Bando* and K. Shirahige*
  • 雑誌名: Genes Cells (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rad51 suppresses gross chromosomal rearrangement at centromere in Schizosaccharomyces pombe. (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Nakamura, A. Okamoto, Y. Katou, C. Yadani, T. Shit, a, C. Kaweeteerawat, T.S. Takahashi, T. Itoh, K. Shirahige, H. Masukata,, T. Nakagawa
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 3036-3046
  • 査読あり
• [雑誌論文] Balance between distinct HP1 family proteins controls heterochromatin assembly in fission yeast. (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Sadaie, R. Kawaguchi, Y. Ohtani, F. Arisaka, K. Tanaka, K. Shirahige, J. Nakayama
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 28 ページ: 6973-6988
  • 査読あり
• [雑誌論文] polymeraseεfunction together in linking DNA replication and the S phase checkpoint Mol. (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Lou, M. Komata, Y. Katou, Z. Guan, C.C. Reis, M. Budd, K. Shirahige, J.L. Campbell1, Mrc1, DNA
  • 雑誌名: Cell 32 ページ: 106-117
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nutrient-regulated antisense and intragenic RNAs modulate a signal transduction pathway in yeast (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Nishizawa, T. Komai, Y. Katou, K. Shirahize, T. Itoh, and A. Toh-E
  • 雑誌名: PLoS Biol 6 ページ: 2817-2830
  • 査読あり
• [雑誌論文] Balance between distinct HP1 family proteins controls heterochromatin assembly in fission yeast (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Sadaie, R. Kawaguchi, Y. Ohtani,F. Aiisaka, K. Tanaka, K. Shirahige, J. Nakayama
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 28 ページ: 6973-6988
  • 査読あり
• [雑誌論文] A DNA polymerase alpha accessory protein, Mcll, is required for propagation of centromere structures in fission yeast (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Natsume, Y. Tsutsui, T. Sutani, E. M. Dunleavy, A.L. Pidoux, H. Iwasaki, K. Shirahige, R.C. Allshire, F. Yamao
  • 雑誌名: PLoS ONE 3
  • 査読あり
• [雑誌論文] A DNA Polymerase {lower case alpha} Accessory Protein, Mcll, is Required for Propagation of Centromere Structures in Fission Yeast. (2008)
  • 著者名/発表者名: Toyoaki Natsume, Yasuhiro Tsutsui, Takashi Sutani, Elaine M.Dunleavy, Alison L. Pidoux, Hiroshi Iwasaki, Katsuhiko Shirahige, Robin C. Allshire, Fumiaki Yamao
  • 雑誌名: PLoS One In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Abnormality in initiation program of DNA replication is monitored by the highly repetitive rDNA array on chromosome XII in budding yeast, Mol. (2007)
  • 著者名/発表者名: S. Ide, K. Watanabe, H. Watanabe, K. Shirahige, T. Kobayashi,, H. Maki
  • 雑誌名: Cell. Biol. 27 ページ: 568-578
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide localization of pre-RC sites and identification of replication origins in fission yeast. (2007)
  • 著者名/発表者名: M. Hayashi, Y. Katou, T. Itoh, M. Tazumi, Y. Yamada, T. Takahashi, T. Nakagawa, K. Shirahige,, H. Masukata
  • 雑誌名: EMBO J. 26 ページ: 1327-1339
  • 査読あり
• [雑誌論文] Displacement and re-accumulation of centromeric cohesin during transient pre-anaphase centromere splitting. (2007)
  • 著者名/発表者名: M.T. Ocampo-Hafalla, Y. Katou, K. Shirahige, F. Uhlmann
  • 雑誌名: Chromosoma. 116 ページ: 531-544
  • 査読あり
• [雑誌論文] Displacement and re-accumulation of centromeric cohesin during transient pre-anaphase centromere splitting. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ocampo-Hafalla MT, Katou Y, Shirahige K, Uhimann F.
  • 雑誌名: Chromosoma 116 ページ: 531-544
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mrell mediates gene regulation in yeast spore development, (2007)
  • 著者名/発表者名: Kugou K, Sasanuma H, Matsumoto K, Shirahige K, Ohta K.
  • 雑誌名: Genes Genet Syst 82 ページ: 21-33
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide localization of pre-RC sites and identification of replication origins in fission yeast. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi M, Katou Y, Itoh T, Tazumi A, Yamada Y, Takahashi T, Nakagawa T, Shirahige K, Masukata H.
  • 雑誌名: EMBO J. 26 ページ: 1327-1339
  • 査読あり
• [雑誌論文] Abnormality in initiation program of DNA replication is monitored by the highly repetitive rDNA array on chromosome XII in budding yeast (2007)
  • 著者名/発表者名: S.Ide, K.Watanabe, H.Watanabe, K.Shirahige, T.Kobayashi, H.Maki
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 27 ページ: 568-578
• [雑誌論文] Perturbation of the activity of replication origin by meiosis specific transcription (2007)
  • 著者名/発表者名: S.Mori, K.Shirahige
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 282 ページ: 4447-4452
• [雑誌論文] Meiotic recombination-related DNA synthesis and its implications for cross-over and non-cross-over recombinant formation. (2007)
  • 著者名/発表者名: M.Terasawa, H.Ogawa, Y.Tsukamoto, Shinohara, K.Shirahige, N.Kleckner, T.Ogawa
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. Mar 23
• [雑誌論文] Meiotic cohesins modulate chromosome compaction during meiotic prophase in fission yeast. (2006)
  • 著者名/発表者名: D.Q. Ding, N. Sakurai, Y. Katou, T. Itoh, K. Shirahige, T. Haraguchi,, Y. Hiraoka.
  • 雑誌名: J Cell Biol. 174 ページ: 499-508
  • 査読あり
• [雑誌論文] Establishment of Sister Chromatid Cohesion at the S. cerevisiae Replication Fork. (2006)
  • 著者名/発表者名: A. Lengronne, J. McIntyre, Y. Katou, Y. Kanoh, K.P. Hopfner, K. Shirahige,, F. Uhlmann
  • 雑誌名: Mol Cell. 23 ページ: 787-799
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic Approach for the Understanding of Dynamic Aspect of Chromosome Behavior. (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Katou, K. Kaneshiro, H. Aburatani,, K. Shirahige
  • 雑誌名: Methods in Enzymology, Elsevier Life Sciences (CA), vol. 409, chapter 23 ページ: 389-410
• [雑誌論文] Different requirements for the association of ATR-ATRIP and 9-1-1 to the stalled replication forks. (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Kanoh, K. Tamai,, K. Shirahige.
  • 雑誌名: Gene. 377 ページ: 88-95
  • 査読あり
• [雑誌論文] Different requirements for the association of ATR-ATRIP and 9-1-1 to the stalled replication forks. (2006)
  • 著者名/発表者名: Y.Kanoh, K.Tamai, K.Shirahige
  • 雑誌名: Gene 377 ページ: 88-95
• [雑誌論文] Establishment of Sister Chromatid Cohesion at the S. cerevisiae Replication Fork. (2006)
  • 著者名/発表者名: A.Lengronne, J.McIntyre, Y.Katou, Y.Kanoh, K.P.Hopfner, K.Shirahige, F.Uhlmann
  • 雑誌名: Mol Cell. 23 ページ: 787-799
• [雑誌論文] Evidence that Loading of Cohesin Onto Chromosomes Involves Opening of Its SMC Hinge (2006)
  • 著者名/発表者名: S.Gruber, P.Arumugam, Y.Katou, D.Kuglitsch, W.Helmhart, K.Shirahige, K.Nasmyth
  • 雑誌名: Cell 127 ページ: 523-537
• [雑誌論文] Protein Phosphatase 2A protects centromeric sister chromatid cohesion. (2006)
  • 著者名/発表者名: C.G.Riedel, V.L.Katis, Y.Katou, S.Mori, W.Helmhart, M.Galova, M.Petronczki, J.Gregan, B.Cetin, I.Mudrak, E.Ogris, K.Mechtler, L.Pelletier, F.Buchholz, K.Shirahige, K.Nasmyth
  • 雑誌名: Nature (article) (In press)
• [雑誌論文] A checkpoint control linking meiotic S phase and recombination initiation in fission yeast. (2005)
  • 著者名/発表者名: Y. Tonami, H. Murakami, K. Shirahige,, M. Nakanishi.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 ページ: 5797-801
  • 査読あり
• [学会発表] Role of Cohesin acetylation in transcription (2010)
  • 著者名/発表者名: 白髭克彦
  • 学会等名: International Conference on Radiation and Cancer Biology at Nagasaki 2010
  • 発表場所: Nagasaki University Medical School, Matsumoto Ryojun Auditotturn, Bauduin Hall
  • 年月日: 2010-02-20
• [学会発表] 複製と分配の連携機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 白髭克彦
  • 学会等名: 遺伝学会シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学
  • 年月日: 2009-11-10
• [備考]
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/chromosomeinformatics/index.html