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トランポートソームを対象とした分子実態を伴った相互作用ネットワークの解析に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 17081003
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東北大学

研究代表者

木下 賢吾  東北大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 (60332293)

研究分担者 中村 春木  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (80134485)
連携研究者 中村 春木  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (80134485)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
53,100千円 (直接経費: 53,100千円)
2009年度: 11,000千円 (直接経費: 11,000千円)
2008年度: 11,500千円 (直接経費: 11,500千円)
2007年度: 11,500千円 (直接経費: 11,500千円)
2006年度: 12,600千円 (直接経費: 12,600千円)
2005年度: 6,500千円 (直接経費: 6,500千円)
キーワード膜輸送複合体 / トランスポートソーム / DNAマイクロアレイ / 遺伝子共発現 / タンパク質立体構造 / タンパク質間相互作用 / 膜分子輸送複合体 / 共発現 / 蛋白質立体構造 / タンパク質問相互作用 / トランスポートゾーム / バイオインフォマティクス / 蛋白質 / 分子間相互作用 / トランスポーター / シグナル伝達 / 立体構造 / 分子表面 / リガンド結合部位 / 静電ポテンシャル / ドッキングシュミレーション
研究概要

相互作用ネットワークの解析は、複雑な生命システムを理解する第一歩である。これまで相互作用ネットワークというと、要素としてのタンパク質を「点」、相互作用を「線」で著す抽象度の高いものであった。これに対して我々は、タンパク質の実体である立体構造を保持したままの状態で相互作用ネットワークの構築を行い分子レベルで生命を理解する基盤を構築するために、遺伝子共発現に基づいた相互作用ネットワークの推定法とタンパク質複合体構造の予測法の開発を行った。

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (85件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (53件) (うち査読あり 43件) 学会発表 (16件) 図書 (8件) 備考 (8件)

  • [雑誌論文] Coexpression landscape in ATTED-II : usage of gene list and gene network for various types of pathways2010

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, K Kinoshita
    • 雑誌名

      J.Plant Res. (in press)

    • NAID

      10027218882

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rank of correlation coefficient as a comparable measure for biological significance of gene coexpression2009

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, K Kinoshita
    • 雑誌名

      DNA research 16,5

      ページ: 249-260

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of hetero-dimer interfaces using docking models and construction of scoring functions for the complex structure prediction2009

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, E Kanamori, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv. Appl. Bioinfo. Chem 2,1

      ページ: 79-100

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analyses on hydrophobic characteristics and attractive effects induced by the different reference states in all-atom-distance-dependent potentials2009

    • 著者名/発表者名
      M Shirota, T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci 18,9

      ページ: 1906-1915

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multi-dimensional correlations for gene coexpression and application to the large-scale data of Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, T Obayashi
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25,20

      ページ: 2677-2684

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of new indices to evaluate protein-protein interfaces: Assembling space volume, assembling space distance, and global shape descriptor2009

    • 著者名/発表者名
      M Maeda, K Kinoshita
    • 雑誌名

      J. Mol. Graph. Mod 27,6

      ページ: 706-711

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATTED-II provides coexpressed gene networks for Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, S Hayashi, M Saeki, H Ohta, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 37

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PiSite: a database of protein interaction sites using multiple binding states in the PDB2009

    • 著者名/発表者名
      M Higurashi, T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 37

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rank of correlation coefficient as a comparable measure for biological significance of gene coexpression2009

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, K Kinoshita
    • 雑誌名

      DNA research 16

      ページ: 249-260

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of hetero-dimer interfaces using docking models and construction of scoring functions for the complex structure prediction2009

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, E Kanamori, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv.Appl.Bioinfo.Chem. 2

      ページ: 79-100

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analyses on hydrophobic characteristics and attractive effects induced by the different reference states in all-atom-distance-dependent potentials2009

    • 著者名/発表者名
      M Shirota, T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci. 18

      ページ: 1906-1915

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multi-dimensional correlations for gene coexpression and application to the large-scale data of Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita T Obayashi
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25

      ページ: 2677-2684

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of new indices to evaluate proteinprotein interfaces : Assembling space volume, assembling snace distance, and global shape descrintor2009

    • 著者名/発表者名
      M Maeda and K Kinoshit a
    • 雑誌名

      J. Mol. Graph. Mod 27

      ページ: 706-711

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATTED-II provides coexpressed gene networks for Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, S Hayashi, M Saeki, H Ohta and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 37

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PiSite : a database of protein interaction sites using multiple binding states in the PDB2009

    • 著者名/発表者名
      M Higurashi, T Ishida, and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 37

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discrimination between biological interfaces and crystal-packing contacts2008

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv. Appl. Bioinfo. Chem 1,1

      ページ: 99-113

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of surface-to-volume ratio of proteins on hydrophilic residues, decrease in occurrence and increase in buried fraction2008

    • 著者名/発表者名
      M Shirota, T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci 17,9

      ページ: 1596-1602

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prediction of disordered protein regions based on meta-approach2008

    • 著者名/発表者名
      T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24,11

      ページ: 1344-1348

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A cavity with an appropriate size is the basis of the PPIase activity2008

    • 著者名/発表者名
      T Ikura, K Kinoshita, N Ito
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel 21,2

      ページ: 83-89

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] COXPRESdb: a database of coexpressed gene networks in mammals2008

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, S Hayashi, M Shibaoka, M Saeki, H Ohta, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of transient hub proteins and the possible structural basis for their multiple interactions2008

    • 著者名/発表者名
      M Higurashi, T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci 17,1

      ページ: 72-78

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discrimination between biological interfaces and crystalpacking contacts2008

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, H Nakamura and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Compt Biol Chem 1

      ページ: 99-113

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of surfacetovolume ratio of proteins on hydrophilic residues, decrease in occurrence and increase in buried fraction2008

    • 著者名/発表者名
      M Shirota, T Ishida, and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci 17

      ページ: 1596-1602

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prediction of disordered protein regions based on metaapproach2008

    • 著者名/発表者名
      T Ishida and K Kinoshit a
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24

      ページ: 1344-1348

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Weak correlation between sequence conservation in promoter regions and protein-coding regions of human-mouse orthologous gene pairs2008

    • 著者名/発表者名
      H Chiba, R Yamashita, K Kinoshita, and K Nakai
    • 雑誌名

      BMC Genomics 9

      ページ: 152-152

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel strategy to search concerted transcription factor activities using gene expression profile and genomic data2008

    • 著者名/発表者名
      Y Hatanaka, M Nagasaki, R Yamaguchi, T Obayashi, K Numata, S Imoto, T Shimamura, K Kinoshita, K Nakai, S Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics 21

      ページ: 101-103

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A cavity with an appropriate size is the basis of the PPIase activity2008

    • 著者名/発表者名
      T Ikura, K Kinoshita, and N Ito
    • 雑誌名

      PEDS (in press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] COXPRESdb: a database of coexpressed gene networks in mammals2008

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, S Hayashi, M Shibaoka, M Saeki, H Ohta and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

      ページ: 77-82

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of transient hub proteins and genthe possible structural basis for their multiple interactions2008

    • 著者名/発表者名
      M Higurashi, T Ishida and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Protein Sci 17

      ページ: 72-78

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Docking of protein molecular surfaces with evolutionary trace analysis2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, DM Standley, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Proteins 69,4

      ページ: 832-838

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] eF-seek: prediction of the functional sites of proteins by searching for similar electrostatic potential and molecular surface shape2007

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, Y Murakami, H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PrDOS: prediction of disordered protein regions from amino acid sequence2007

    • 著者名/発表者名
      T Ishida, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutational analysis of block and facilitation of HERG current by a class III anti-arrhythmic agent, nifekalant2007

    • 著者名/発表者名
      Y Hosaka, M Iwata, N Kamiya, M Yamada, K Kinoshita, Y Fukunishi, K Tsujimae, H Hibino, Y Aizawa, A Inanobe, H Nakamura, Y Kurachi
    • 雑誌名

      Channels 1,1

      ページ: 198-208

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATTED-II: a database of co-expressed genes and cis elements for identifying co-regulated gene groups in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, K Kinoshita, K Nakai, M Shibaoka, S Hayashi, M Saeki, D Shibata, K Saito, H Ohta
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Docking of protein molecular surfaces with evolutionary trace analysis2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, DM Standley, H Nakamura and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Proteins 69

      ページ: 832-838

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ATTED-II: a database of co-expressed genes and cis elements for identifying co-regulated gene groups in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      T Obayashi, K Kinoshita, K Nakai, M Shibaoka, S Hayashi, M Saeki, D Shibata, K Saito and H Ohta
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

      ページ: 863-869

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Probabilistic alignment detects remote homology in a pair of protein sequences without homologous sequence information2007

    • 著者名/発表者名
      R Koike, K Kinoshita and A Kidera
    • 雑誌名

      Proteins 66

      ページ: 655-663

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] eF-seek: prediction of the functional sites of proteins by searching for similar electrostatic potential and molecular surface shape2007

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, Y Murakami and H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

      ページ: 398-402

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PrDOS: prediction of disordered protein regions from amino acid sequence2007

    • 著者名/発表者名
      T Ishida and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

      ページ: 460-464

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutational analysis of block and facilitation of HERG current by a class III anti-arrhythmic agent, nifekalant2007

    • 著者名/発表者名
      Y Hosaka, M Iwata, N Kamiya, M Yamada, K Kinoshita, Y Fukunishi, K Tsujimae, H Hibino, Y Aizawa, A Inanobe, H Nakamura and Y Kurachi
    • 雑誌名

      Channels 1

      ページ: 198-208

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] タンパク質間相互作用に関するデータベースの構築2007

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 雑誌名

      生体の科学 58

      ページ: 334-337

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Probablistic alignment detects remote homology in a pair of protein sequences without homologous sequence information2007

    • 著者名/発表者名
      Ryotaro Koike, Kengo Kinoshita, Akinori Kidera,
    • 雑誌名

      Proteins 66,

      ページ: 655-663

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] ATTED-II: a database of co-expressed genes and cis elements for identifying co-regulated gene groups in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita, Kenta Nakai, Masayuki Shibaoka, Shinpei Hayashi, Motoshi Saeki, Daisuke Shibata, Kazuki Saito, Hiroyuki Ohta
    • 雑誌名

      Nuc Acid Rec 35

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] PreBI: prediction of biological interfaces of proteins in crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, K Kinoshita, N Ito, H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 34

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analyses of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity2006

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, K Kinoshita, H Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel 19,9

      ページ: 421-429

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity2006

    • 著者名/発表者名
      Yuko Tsuchiya, Kengo Kinoshita, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel. 19

      ページ: 421-429

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Pre BI: Prediction of biological interfaces of proteins in crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Yuko Tsuchiya, Kengo Kinoshita, Nobutoshi Ito, Haruki Nakamura,
    • 雑誌名

      Nuc Acid Res, 34

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] eF-siteを利用した機能部位の予測2006

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 雑誌名

      バイオテクノロジージャーナル 6

      ページ: 444-447

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of the three- dimensional structure of the "C-X-G-X-C" motif in the CMGCC and CAGYC regions of alpha- and beta-subunits of human chorionic gonadotropin : Importance of Glycine Residue (G) in the Motif in beta-subunit2006

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, K., Kusunoki, M., Miyai, K.
    • 雑誌名

      Endocrine J. 53

      ページ: 51-58

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Disordered domains and high surface charge confer hubs with the ability to interact with multiple proteins in interaction networks2006

    • 著者名/発表者名
      Patil A, Nakamura H
    • 雑誌名

      FEBS Letters in press

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] プロテインインフォマティクスによるタンパク質の機能推定2005

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 47

      ページ: 341-347

    • NAID

      10018280602

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Protein Structure Databases with new web services for structural biology and biomedical research

    • 著者名/発表者名
      S Daron, A Kinjo, K Kinoshita, H Nakamura
    • 雑誌名

      Brief. Bioinform (in press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] タンパク質の機能部位の予測

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 雑誌名

      実験医学増刊号(バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線) (印刷中)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Multi-dimensional correlations for gene coexpression and application to the large-scale data of Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      Bioinformatics beyond omics data analyses
    • 発表場所
      Ochanomizu University
    • 年月日
      2009-12-04
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Web services for function prediction of proteins2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      Bioinfo2009
    • 発表場所
      The Haeundae Grand Hotel, Busan, Korea
    • 年月日
      2009-11-04
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 機能未知タンパク質の機能推定法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      第82回日本生化学大会
    • 発表場所
      神戸ポートピアアイランド
    • 年月日
      2009-10-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] COXPRESdb: gene coexpression database for Human, mouse and rat2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      XXXVI International congress of Physiological Sciences
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2009-07-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] COXPRESdb : gene coexpression database for Human, mouse and rat2009

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      XXXVI International congress of Physiological Sciences
    • 発表場所
      Kyoto International conference center
    • 年月日
      2009-07-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Classification of hetero-dimer interfaces and development of multiple scoring functions for complex structure predictions of proteins2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      International symposium on multi-scale dynamics of protein complex formation and function
    • 発表場所
      Sanjo Conference Hall, The University of Tokyo
    • 年月日
      2009-07-14
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 類似性検索による遺伝子機能推定2009

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      情報処理学会アルゴリズム研究会・特別講演
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所
    • 年月日
      2009-05-11
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A new multi-dimensional index for gene coexpression and application to the large-scale data of Arabidopsis2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      The 1299th Biological Symposium at National Institute of Genetics
    • 発表場所
      National Institute of Genomics
    • 年月日
      2009-03-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Coexpressed gene database for human, mouse, rat and Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      Japan-UK symposium on protein informatics toward interactome analysis
    • 発表場所
      大阪・千里ライクサイエンスセンター
    • 年月日
      2008-09-02
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Coexpressed gene database for human, mouse, rat and Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita
    • 学会等名
      Japan-UK symposium on protein informatics toward interactome analysis
    • 発表場所
      Senri Life science center
    • 年月日
      2008-09-01
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ヒト・マウスをターゲットとしたデータベース : COXPRESdbとSAHG2008

    • 著者名/発表者名
      杢下賢吾、太田元規
    • 学会等名
      蛋白質科学会ワークショップ
    • 発表場所
      東京・タワーホール船堀
    • 年月日
      2008-06-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Ordered and Disordered Structure of Proteins2008

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      タンパク質研究の未来像
    • 発表場所
      東海大学
    • 年月日
      2008-03-07
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質の配列・構造・機能相関の博物学2007

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質立体構造情報を利用した機能推定2007

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 学会等名
      第41回遺伝医学研究会
    • 発表場所
      東京女子医科大学
    • 年月日
      2007-11-02
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Prediction of protein-protein interaction using evolutionary trance method and molecular surface complementarity2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, D Standley, K Kinoshita, H Nakamura
    • 学会等名
      CAPRI evaluation meeting
    • 発表場所
      Toronto Canada
    • 年月日
      2007-04-21
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Prediction of protein-protein interaction using evolutionary trance method and molecular surface complementarity2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, D Standley, K Kinoshita, H Nakamura
    • 学会等名
      CAPRI evaluation meeting
    • 発表場所
      Canada
    • 年月日
      2007-04-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Prediction of proetin structures, functions and interactions2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, H Kono, K Yura
    • 出版者
      Wiley and Sons
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] 立体構造からのタンパク質機能予測:現状と展望、遺伝子医学MOOK2009

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] ペプチジルプロリルイソメラーゼの構造・機能相関、蛋白質核酸酵素2009

    • 著者名/発表者名
      伊倉貞吉、木下賢吾、伊藤暢聡
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] Prediction of proetin structures, functions and interactions(第7章: Prediction of molecular interactions from 3D-structures : from small ligands to large protein complexes)2009

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, H Kono, K Yura
    • 総ページ数
      287
    • 出版者
      Wiley and Sons
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] Prediction of molecular interactions from 3D-structures : from small ligands to large protein complexes2009

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, H Kono, K Yura
    • 出版者
      Wiley and Sons(in press)
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] タンパク質の機能部位の予測、実験医学増刊号(バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線)2008

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] Prediction of molecular interactions from 3D-structures: from small ligands to large protein complexes2008

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, H Kono, K Yura Janusz Bujnicki ed
    • 出版者
      Wiley and Sons
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] タンパク質間相互作用に関するデータベースの構築、生体の科学2007

    • 著者名/発表者名
      木下賢吾
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://coxpresdb.jp

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pisite.hgc.jp

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://coxpresdb.jp

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pisite.hgc.jp

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考] Meta-PrDOS

    • URL

      http://prdos.hgc.jp/meta

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] COXPRESdb

    • URL

      http://coxpresdb.hgcjp

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.coxpresdb.hgc.jp

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://prdos.hgc.jp

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2018-03-28  

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