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ダイニン組換え体と、その構造・動態に基づくエネルギー変換機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17107003
研究種目

基盤研究(S)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関東京大学

研究代表者

須藤 和夫  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (20111453)

研究分担者 栗栖 源嗣  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (90294131)
昆 隆英  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (30332620)
大岩 和弘  情報通信研究機構, 生体物性グループ, リーダー (10211096)
連携研究者 昆 隆英  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (30332620)
研究期間 (年度) 2005 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
107,250千円 (直接経費: 82,500千円、間接経費: 24,750千円)
2009年度: 14,950千円 (直接経費: 11,500千円、間接経費: 3,450千円)
2008年度: 17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2007年度: 29,900千円 (直接経費: 23,000千円、間接経費: 6,900千円)
2006年度: 34,060千円 (直接経費: 26,200千円、間接経費: 7,860千円)
2005年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
キーワード細胞質ダイニン / AAA+ファミリー / 微小管 / ATP加水分解酵素 / FRET / 電子顕微鏡 / パワーストローク / ダイニン / ATP加水分解反応 / プロセシビティー / AAAリング / ストップトフロー / モータードメイン / ヘテロダイマータグ / モータータンパク質 / AAA+タンパク質 / クライオ電子顕微鏡法 / レバーアーム / ATP加水分解 / X線結晶解析 / 電子顕微鏡法 / 微小管滑り運動 / 蛍光エネルギー遷移(FRET) / GFP / アロステリック相互作用
研究概要

細胞内で物質輸送を駆動したり細胞分裂時の染色体分離を担ったりする細胞質ダイニンがどのようにしてATPの加水分解エネルギーを力学的仕事に変換するか、その分子機構をあきらかにすることが本研究の目的である.本研究の成果としてはつぎのことがあげられる.(1)遺伝子操作を駆使してダイニンの最小モータードメインを同定し、電子顕微鏡法でその構造をあきらかにした.(2)ATP加水分解キネティックスをもとに、1個のダイニンモータードメインは3か所のATP加水分解部位と1か所のADP結合部位をもつことをあきらかにした.そして、このうち1個の主要なATP加水分解部位がダイニンのモーター機能を駆動しており、残りのATP加水分解部位は、この主要部位を制御する部位であることもあきらかにした.(3)主要ATP加水分解部位での反応ステップをストップトフロー法で詳細に解析した.(4)主要ATP加水分解部位の反応ステップに呼応して、モータードメインから突き出ているリンカーが大きくスイングし、レバーアームとして機能することをFRET法や電子顕微鏡法であきらかにした(5)主要ATP加水分解部位の加水分解ステップに呼応して、ダイニン上の微小管結合部位に構造変化がおこり、微小管とダイニンが会合と解離を繰り返すことをあきらかにした.このような成果に基づいて、ダイニンの作動機構のモデルを作り上げた.

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2009 2008 2007 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (23件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (19件)

  • [雑誌論文] Biomolecular-Motor-Based Nano-or Microscale Particle Translocations on DNA Microarrays.2009

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Hiyama,, Riho Gojo, Tomohiro Shima, Shoji Takeuchi, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      Nano Letters.Publication on Web on

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] AAA+ Ring and Linker Swing Mechanism in the Dynein Motor2009

    • 著者名/発表者名
      Anthony J. Roberts, Naoki Numata, Matt L. Walker, Yusuke S. Kato, Bara Malkova, Takahide Kon, Reiko Ohkura, Fumio Arisaka, Peter J. Knight, Kazuo Sutoh, Stan A. Burgess.
    • 雑誌名

      Cell 136

      ページ: 485-595

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Helix sliding in the stalk coiled coil of dynein couples ATPase and microtubule binding.2009

    • 著者名/発表者名
      Takahide Kon, Kenji Imamula, Anthony J Roberts, Reiko Ohkura, Peter J Knight, I R Gibbons, Stan A Burgess, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      Nature Structural and Molecular Biology 16

      ページ: 325-333

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] AAA+ring and linker swing mechanism of the dynein motor2009

    • 著者名/発表者名
      Roberts, A., Numata, N., 等
    • 雑誌名

      Cell 136

      ページ: 485-495

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helix sliding of stalk coiled coil of dynein couples ATPase and microtubule bindin2009

    • 著者名/発表者名
      Kon, T., Imamula, K., 等
    • 雑誌名

      Nature Structutal & Molecular Biology 16

      ページ: 325-333

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] AAA+ Ring and Linker Swing Mechanism in the Dynein Motor2009

    • 著者名/発表者名
      Anthony J. Roberts, Kazuo Sutoh, Stan A. Burgess, et al.
    • 雑誌名

      Cell 136

      ページ: 485-595

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helix sliding in the stalk coiled coil of dynein couples ATP ase and microtubule bind2009

    • 著者名/発表者名
      Takahide Kon, Stan A Burgess, Kazuo Sutoh, et al.
    • 雑誌名

      Nature Structural and Molecular Biology 16

      ページ: 325-333

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Autonomous Loading/Unloading and Transport of Specified Cargoes Using DNA Hybridization and Biological Motor-Based Motility.2008

    • 著者名/発表者名
      Hiyama, S., Inoue, T., Shima, T., Moritani, Y., Suda, T., Sutoh, K.
    • 雑誌名

      Small 4

      ページ: 410-415

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Three-dimensional structure of cytoplasmic dynein bound to microtubules.2007

    • 著者名/発表者名
      Naoko Mizuno, Akihiro Narita, Takahide Kon, Kazuo Sutoh, Masahide Kikkawa
    • 雑誌名

      PNAS 104

      ページ: 20832-20837

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The coordination of cyclic microtubule association/dissociation and tail swing of cytoplasmic dynein.2007

    • 著者名/発表者名
      Kenji Imamula, Takahide Kon, Reiko Ohkura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      PNAS 104

      ページ: 16134-16134

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Kinetic characterization of tail swing steps in the ATPase cycle of Dictyostelium cytoplasmic dynein.2007

    • 著者名/発表者名
      Toshifumi Mogami, Takahide Kon*, Kohji Ito, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      J.Bio.Chem 282

      ページ: 21639-21639

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Three-dimensional structure of cytoplasmic dynein bound to microtubules2007

    • 著者名/発表者名
      Naoko Mizuno, Akihiro Narita, Takahide Kon, Kazuo Sutoh, and Masahide Kikkawa
    • 雑誌名

      PNAS 104

      ページ: 20832-20837

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The coordination of cyclic microtubule association/dissociation and tail swing of cytoplasmic2007

    • 著者名/発表者名
      Kenji Imamula, Takahide Kon, Reiko Ohkura, and Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      PNAS 104

      ページ: 16134-16139

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Kinetic characterization of tail swing steps in the ATPase cycle of Dictyostelium cytoplasmic2007

    • 著者名/発表者名
      Toshifumi Mogami, Takahide Kon, Kohji Ito, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      J.Bio.Chem 282

      ページ: 21639-21644

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two modes of microtubule sliding driven by cytoplasmic dynein.2006

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Shima, Takahide Kon, Kenji Imamula, Reiko Ohkura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      PNAS 103

      ページ: 17736-17740

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Functional characterization of the amino-terminal region of myosin 2.2006

    • 著者名/発表者名
      Setsuko Fujita-Becker, Georgios Tsiavaliaris, Reiko Ohkura, Takashi Shimada, Dietmar Manstein, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      J.Bio.Chem. 281

      ページ: 36102-36109

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Head-head coordination is required for the processive motion of cytoplasmic dynein, an AAA+ molecular motor.2006

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Shima, Kenji Imamula, Takahide Kon, Reiko Ohkura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      J.Struc.Biol. 156

      ページ: 182-189

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Two modes of microtubule sliding driven by cytoplasmic dynein2006

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Shima, Takahide Kon, Kenji Imamula, Reiko Ohkura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      PNAS 103

      ページ: 17736-17740

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Head-head coordination is required for the processive motion of cytoplasmic dynein, an AAA+ molecular motor2006

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Shima, Kenji Imamula, Takahide Kon, Reiko Ohkura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      J. Struc. Biol. 156

      ページ: 182-189

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] ATP-hydrolysis cycle-dependent stem motions in cytoplasmic dynein.2005

    • 著者名/発表者名
      Takahide Kon, Toshifumi Mogami, Reiko Ohkura, Masaya Nishiura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      Nature Structural and Molecular Biology 12

      ページ: 513-519

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] ATP-hydrolysis cycle-dependent stem motions in cytoplasmic dynein2005

    • 著者名/発表者名
      Takahide Kon, Toshifumi Mogami, Reiko Ohkura, Masaya Nishiura, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      Nature Structural and Molecular Biology 12

      ページ: 513-519

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Distinct functions of nucleotide-binding/hydrolysis sites in the four AAA modules of cytoplasmic dynein, as revealed by biochemical characterizations of recombinant fragments.2004

    • 著者名/発表者名
      Takahide Kon, Masaya Nishiura, Reiko Ohkura, Yoko Y. Toyoshima, Kazuo Sutoh
    • 雑誌名

      Biochemistry 43

      ページ: 11266-11274

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A single-headed recombinant fragment of Dictyostelium cytoplasmic dynein can drive the robust sliding of microtubules.2004

    • 著者名/発表者名
      Nishiura, M., Kon, T., Shiroguchi, K., Ohkura, R., Shima, T., Toyoshima, Y. Y., Sutoh, K.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 22799-22802

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Dynein-The old but still mysterious motor protein2009

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society subgroup meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Elucidation of structural states of dimeric motor domain of dynein using Cys-light construct2009

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa Y., Shima T., Kon T., Sutoh K., Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] How does the two-headed dynein processively walk on a microtubule?2009

    • 著者名/発表者名
      Shima T., Numata N., Kon T., Ohkura R., Higuchi H., Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Communication of multiple ATPase sites of the dynein motor domain.2008

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      Gordon Conference on Muscle and Molecular Motors
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Dissection of Inter-modular Communication among Multiple Nucleotide-binding/hydrolysis Sites of Cytoplasmic Dynein.2008

    • 著者名/発表者名
      Mogami T., Imamula K., Ohkura R., Sutoh K., Kon T.
    • 学会等名
      The American Society of Cell Biology annual meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Biochemical Dissection of Motor Functions of Cytoplasmic Dynein.2007

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Force generation by cytoplasmic dynein, a microtubule-based motor protein that belongs to the AAA+ family.2007

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      The 6^<th> International Conference on AAA proteins
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Kinetic analysis of dynein-MT interaction.2007

    • 著者名/発表者名
      Imamula K, Kon T, Ohkura R, Sutoh, K.
    • 学会等名
      Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Two modes of microtubule-sliding driven by cytoplasmic dynein.2007

    • 著者名/発表者名
      Shima T, Kon T, Imamula K, Ohkura R., Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Are six AAA modules sufficient to form the AAA ring of dynein?2007

    • 著者名/発表者名
      Numata N, Roberts A, Burgess SA, Kon, T., Ohkura, R., Knight, P. Sutoh, K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Structure and Function of Dynein, A Huge Microtubule-based AAA+ Motor.2006

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Dissection of Intra-molecular Communications between the Catalytic Head and Microtubule-binding Site in the Dynein Heavy Chain.2006

    • 著者名/発表者名
      Kon T., Imamura K., Okura R., Sutoh K.
    • 学会等名
      The American Society of Cell Biology annual meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Roles of multiple nucleotide-binding/hydrolysis sites of the cytoplasmic dynein motor domain in microtubule sliding2006

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K., Mogami T., Imamula K., Ohkura R., Kon T.
    • 学会等名
      The Biophysical Society Discussion Meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Dissection of Intra-molecular Communications between the Catalytic Head and Microtubule-binding Site in the Dynein Heavy Chain.2006

    • 著者名/発表者名
      Kon T., Imamura K., Okura R., Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society Discussion Meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of force generation by cytoplasmic dynein as revealed by fully active recombinant motor domain.2005

    • 著者名/発表者名
      Sutoh K.
    • 学会等名
      Gordon Conference on Muscle and Molecular Motors
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Active participation of the stalk coiled-coil in communication between ATPase and MT-binding sites of cytoplasmic dynein2005

    • 著者名/発表者名
      Okura R, Kon T, Shima T., Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ATP-hydrolysis cycle dependent stem motions in cytoplasmic dynein.2005

    • 著者名/発表者名
      Kon T, Mogami T, Ohkura R, Sutoh K.
    • 学会等名
      Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Kinetic analysis of FRET changes of recombinant dynein motor domain.2005

    • 著者名/発表者名
      Mogami T, Kon T, Ohkura R, Sutoh K.
    • 学会等名
      The Biophysical Society annual meeting
    • 発表場所
      USA
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Distinct roles of the four nucleotide-binding/hydrolysis sites in the motor activities of cytoplasmic dynein.2004

    • 著者名/発表者名
      Kon T, Mogami T, Nishiura M, Sutoh K.
    • 学会等名
      The American Society of Cell Biology annual meeting
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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