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コイ目魚類の大系統解明:ミトコンドリアゲノム分析による国際的イニシアチブの確立

研究課題

研究課題/領域番号 17207007
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関千葉県立中央博物館

研究代表者

宮 正樹  千葉県立中央博物館, 動物学研究科, 上席研究員 (30250137)

研究分担者 西田 睦  東京大学, 海洋研究所, 教授 (90136896)
斎藤 憲治 (斉藤 憲治)  独立行政法人水産総合研究センター, 東北区水産研究所, 室長 (80371798)
研究期間 (年度) 2005 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
50,440千円 (直接経費: 38,800千円、間接経費: 11,640千円)
2008年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2007年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2006年度: 13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
2005年度: 25,350千円 (直接経費: 19,500千円、間接経費: 5,850千円)
キーワード遺伝子 / 動物 / ゲノム / 進化 / 分類学 / 大系統 / ミトコンドリアゲノム / 最尤法 / 分子系統 / 生物地理 / 淡水性魚類 / 高次分類群 / 分岐年代分 / ベイズ解析 / 生物地理学 / コイ目魚類 / ロングPCR
研究概要

コイ目魚類は世界の淡水魚の中で最も多様性の高い分類群であり,6科350属に分類される約3500種を含む.本研究の第一の目的は,この莫大な多様性をもつコイ目魚類の大系統を,ミトコンドリアゲノム全長配列(約16,500塩基対)の比較分析によって網羅的かつ迅速に解明することである.また,並行して解明される他魚種の系統進化とあわせて,魚類の分子系統進化学的研究において国際的イニシアチブを確立することを第二の目的とした.第一の目的は,Saitoh et al.(2006)を国際誌Journal of Molecular Evolutionに出版することによってその第一段階が達成された.本論文は,コイ目魚類53種のミトゲノム全長配列を分析することにより世界に先駆けて本目魚類の高次系統関係を明らかにしただけでなく,わずか3年間で45件もの被引用数を誇るこの分野の中心的存在となった.また,本研究期間中に400種を超えるコイ目魚類のミトゲノム全長配列を決定することができ,現在その比較分析を行っている.第二の目的(国際的イニシアチブの確立)については,ミトゲノム全長配列の比較分析に基づく一連の研究の被引用件数が2,000件を超えたことからも,十分に達成されたことが明らかであろう.さらには「深海魚の三つの科が一つに」(Johnson et al.2009),「メダカの分岐年代」(Setiamarga et al.2009),「深海起源のウナギ」(Inoue et al.2010)など,最近マスメディアで話題になった一連の研究がいずれも本研究グループから出されたことからも,一般社会への還元も積極的かつ十分に行われたといえよう.

報告書

(5件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (92件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (58件) (うち査読あり 22件) 学会発表 (32件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Evidence from mitochondrial genomics supports the lower Mesozoic of South Asia as the time and place of basal divergence of cypriniform fishes (Actinopterygii : Ostariophysi)2010

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, K., T. Sado, M.H. Doosey, H.L. Bart, Jr., Jun G. Inoue, R.L. Mayden, M. Nishida, M. Miya
    • 雑誌名

      (In press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships of catostomid Fishes (Actinopterygii : Cypriniformes) based on mitochondrial ND4/ND5 gene sequences2010

    • 著者名/発表者名
      Doosey, M.H., H.L. Bart, Jr., K. Saitoh, M. Miva
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol (In press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mitochondrial phylogenomics of anchovies (family Engraulidae) and recurrent origins of pronounced miniaturization in the order Clupeiformes2010

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miva, M. Nishida
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol (In press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Deep-ocean origin of the freshwater eels2010

    • 著者名/発表者名
      Inoue, J.G., M. Miva, M.J. Miller, T. Sado, R. Hanel, K. Hatooka, J. Aoyama, Y. Minegishi, M. Nishida, K. Tsukamoto
    • 雑誌名

      Biol. Lett (In press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Divergence time of the two regional medaka populations in Japan as a new time scale for comparative genomics of vertebrates2009

    • 著者名/発表者名
      Setiamarga, D.H.E., M. Miva, J.G. Inoue, N.B. Ishiguro, K. Mabuchil, M. Nishida
    • 雑誌名

      Biol. Lett 5(5)

      ページ: 812-816

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Reconstructing the phylogenetic relationships of the Earth's most diverse Glade of freshwater fishes-Order Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi) : A case study using multiple nuclear loci and the mitochondrial genome2009

    • 著者名/発表者名
      Mayden, R.L., W.-J. Chen, H.L. Bart, M.H. Doosey, A.M. Simons, K.L. Tang, R.M. Wood, M.K. Agnew, L. Yang, M.V. Hirt, M.D. Clements, K. Saitoh, M. Miva, M. Nishida
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol 51(3)

      ページ: 500-514

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Deep-sea mystery solved : Astonishing larval transformations and extreme sexual dimorphism unite three fish families2009

    • 著者名/発表者名
      Johnson, G.D., J.R. Paxton, T.T. Sutton, T.P. Satoh, T. Sado, M. Nishida, M. Miva
    • 雑誌名

      Biol. Lett 5(2)

      ページ: 235-239

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Unique patterns of pelvic fin evolution : a case study of balistoid fishes (Pisces : Tetraodontiformes) based on whole mitochondrial genome sequences2009

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M. Miya, K. Matsuura, M. Katoh, H. Sakai, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 50(1)

      ページ: 179-189

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stickleback phylogenies resolved : Evidence from mitochondrial genomes and 11 nuclear genes2009

    • 著者名/発表者名
      Kawahara, R., M. Miya, K. Mabuchi, T. J. Near, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 50(2)

      ページ: 401-404

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Explosive speciation of Takifugu : Another use of the fugu as a model system for evolutionary biology2009

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M. Miya, K. Matsuura, S. Miyazawa, N. Miyamoto, H. Doi, H. Takahashi, K. Mabuchi, M. Nishida, H. Sakai
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution 26(3)

      ページ: 623-629

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deep-sea mystery solved : Astonishing larval transformations and extreme sexual dimorphism unite three fish families2009

    • 著者名/発表者名
      Johnson, G. D., J. R. Paxton, T. T. Sutton, T. P. Satoh, T. Sado, M. Nishida, M. Miya
    • 雑誌名

      Biology Letters 5(2)

      ページ: 235-239

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reconstructing the phylogenetic relationships of the Earth's most diverse clade of freshwater fishes-Order Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi) : A case study using multiple nuclear loci and the mitochondrial genome2009

    • 著者名/発表者名
      Mayden, R. L., W. -J. Chen, H. L. Bart, M. H. Doosey, A. M. Simons, K. L. Tang, R. M. Wood, M. K. Agnew, L. Yang, M. V. Hirt, M. D. Clements, K. Saitoh, M. Miya, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 51(3)

      ページ: 500-514

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic utility of two existing and four novel nuclear gene loci in reconstructing Tree of Life of ray-finned fishes : The order Cypriniformes (Ostariophysi) as a case study2008

    • 著者名/発表者名
      Chen, W.-J., M. Miya, K. Saitoh, R.L. Mayden
    • 雑誌名

      Gene 423(2)

      ページ: 125-134

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mitogenomic evaluation of the historical biogeography of cichlids toward reliable dating of teleostean divergences2008

    • 著者名/発表者名
      Azuma, Y., Y. Kumazawa, M. Miya, K. Mabuchi, M. Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evol. Biol 8

      ページ: 215-215

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A new perspective on phylogeny and evolution of tetraodontiform fishes (Pisces : Acanthopterygii) based on whole mitochondrial genome sequences : Basal ecological diversification?2008

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M. Miva, K. Matsuura, M. Katoh, H. Sakai, M. Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evol. Biol 8

      ページ: 212-212

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Inferring the Tree of Life of the order Cypriniformes, the earth's most diverse Glade of freshwater fishes : Implications of varied taxon and character sampling2008

    • 著者名/発表者名
      Mayden, R.L., K.L. Tang, R. M. Wood, W.-J. Chen, M.K. Agnew, K.W. Conway, L. Yang, A.M. Simons, H.L. Bart, P.M. Harris, L.I. Junbing, X. Wang, K. Saitoh, S. He, H. Liu, Y. Chen, M. Nishida, M. Miva
    • 雑誌名

      J. Syst. Evol 46(3)

      ページ: 424-438

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Monophyly, phylogenetic position and inter-familial relationships of the Alepocephaliformes (Teleostei) based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miya, J.Y. Poulsen, P.R. Moller, M. Nishida
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol 47(3)

      ページ: 1111-1121

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Interrelationships of the 11 gasterosteiform families (sticklebacks, pipefishes, and their relatives) : a new perspective based on the whole mitogenome sequences from 75 higher teleosts2008

    • 著者名/発表者名
      Kawahara, R., M. Miya, K. Mabuchi, S. Lavoue, J. G. Inoue, T. P. Satoh, A. Kawaguchi, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 46(1)

      ページ: 224-236

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Heterotypy in N-terminal region of Growth/Differentiation Factor 5 (GDF5) mature protein during evolution of teleosts2008

    • 著者名/発表者名
      Fujimura, K., Y. Terai, N. B. Ishiguro, M. Miya, M. Nishida, N. Okada
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution 25(5)

      ページ: 797-800

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monophyly, phylogenetic position and inter-familial relationships of the Alepocephaliformes (Teleostei) based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miya, J. Y. Poulsen, P. R. Moller, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 47(3)

      ページ: 1111-1121

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inferring the Tree of Life of the order Cypriniformes, the earth's most diverse clade of freshwater fishes : Implications of varied taxon and character sampling2008

    • 著者名/発表者名
      Mayden, R. L., K. L. Tang, R. M. Wood, W. -J. Chen, M. K. Agnew, K. W. Conway, L. Yang, A. M. Simons, H. L. Bart, P. M. Harris, L. I. Junbing, X. Wang, K. Saitoh, S. He, H. Liu, Y. Chen, M. Nishida, M. Miya
    • 雑誌名

      Journal of Systematics and Evolution 46(3)

      ページ: 424-438

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new perspective on phylogeny and evolution of tetraodontiform fishes (Pisces : Acanthopterygii) based on whole mitochondrial genome sequences : Basal ecological diversification?2008

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M. Miya, K. Matsuura, M. Katoh, H. Sakai, M. Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology 8

      ページ: 212-212

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitogenomic evaluation of the historical biogeography of cichlids toward reliable dating of teleostean divergences2008

    • 著者名/発表者名
      Azuma, Y., Y. Kumazawa, M. Miya, K. Mabuchi, M. Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology 8

      ページ: 215-215

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      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic utility of two existing and four novel nuclear gene loci in reconstructing Tree of Life of ray-finned fishes : The order Cypriniformes (Ostariophysi) as a case study2008

    • 著者名/発表者名
      Chen, W. -J., M. Miya, K. Saitoh, R. L. Mayden
    • 雑誌名

      Gene 423(2)

      ページ: 125-134

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      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The phylogenetic position of a new paedomorphic clupeiform : Mitogenomic evidence2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miya, T. Yoshino, A. Kawaguchi, M. Nishida
    • 雑誌名

      Ichthyological Research 55(4)

      ページ: 328-334

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      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interrelationships of Atherinomorpha (medakas, flyingfishes, killifishes, silversides, and their relatives) : The first evidence based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Setiamarga, D. H. E. M. Miya, Y. Yamanoue, K. Mabuchi, T. P. Satoh, J. G. Inoue, M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 49(2)

      ページ: 598-605

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interrclationships of the 11 gasterosteiform families(sticklebacks,pipefrshes,and their relatives):a new perspective based on the whole mitogenome sequences from 75 higher teleosts2008

    • 著者名/発表者名
      Kawahara, R., M.Miya, K.Mabuchi, S.Lavoue, J.G.Inoue, T.P.satoh, A.Kawchi & M.Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 46(1)

      ページ: 224-236

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monophyly,phylogenetic position and inter-famihal relationships of the Alepocephaliformes(Teleostei)based on whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya, J.Y.Poulsan, P.R.Moller & M.Nishida
    • 雑誌名

      Molccular Phylogenetics and Evolution (In press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The phylogerietic position of a new paedomorphic clupeiform:Mitogenomic evidence2008

    • 著者名/発表者名
      Levoue, S., M.Mlya, T.Yoshino, A.Kawchi & M.Nishida
    • 雑誌名

      Ichthyological Research (In press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial genome and a nuclear gene indicate a novel phylogenetic position of deep-sea tube-eye fish (Stylephoridae)2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., N. I. Holcroft, T.P. Satoh, M. Yamaguchi, M. Nishida, E.O. Wiley
    • 雑誌名

      Ichthyol. Res 54(4)

      ページ: 323-332

    • NAID

      10020005298

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships of Danio within the order Cypriniformes : A framework for comparative and evolutionary studies of a model species2007

    • 著者名/発表者名
      Mayden, R.L., K.W. Conway, K. Tang, J. Freyhof, S. Chamberlain, M. Haskins, L. Schneider, M. Sudkamp, R.M. Wood, M. Agnew, A. Bufalino, Z. Sulaiman, M. Miya, K. Saitoh, S. He
    • 雑誌名

      J Exp. Zool. Part B, Mol. Devel. Evol 308B(5)

      ページ: 642-654

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships among anchovies, sardines, herrings and their relatives (Clupeiformes), inferred from whole mitogenome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miya, J. G. Inoue, K. Saitoh, N. B. Ishiguro, M. Nishida
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol 43(3)

      ページ: 1096-1105

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Independent evolution of the specialized pharyngeal jaw apparatus in cichlid and labrid fishes2007

    • 著者名/発表者名
      Mabuchi, K., M. Miya, Y. Azuma, M. Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evol. Biol 7

      ページ: 10-10

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      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Independtnt evolution of the specialized pharyngeal jaw apparatus in cichlid and labrid fishes2007

    • 著者名/発表者名
      Mabuchi, K., M.Miya, Y., Azuma & M.Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology 7

      ページ: 10-10

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    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya, J.G.Inoue, K.Saitoh, N.B.Ishiguro & M.Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 43(3)

      ページ: 1096-1105

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  • [雑誌論文] Phylogenetic position of tetraodontiform fishes within the higher teleosts:Bayesian inferences based on 44 whole mitochondril genome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M.Miya, K. Matsuura, N. Yagishita, K. Mabuchi, H. Sakai, M. Katoh & M. Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 45(1)

      ページ: 89-101

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  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships of Danio within the order Cypriniformes:A framewodk for comparative and evolutionary studies of a model species2007

    • 著者名/発表者名
      Mayderi, R.L., K.W.Conway, K.Tang, J.Freyhof, S.Chamberlain, M.Haskins, L.Schneider, M.Sudkamp, R.M.Wood, M.Agnew, A.Bufalino, Z.Sulaiman, M.Miya, K.Saitoh, S.He
    • 雑誌名

      Journal of Experimeatal Zoology, Part B, Molecular and Develomental Evolution 308B(5)

      ページ: 323-332

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    • 著者名/発表者名
      Miya, M., N.I.Holcroft, T.P.Satoh, M.Yamaguchi, M.Nishida & E.O.Wiley
    • 雑誌名

      Ichthyological Research 54(4)

      ページ: 323-332

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    • 著者名/発表者名
      Mabuchi, K., M.Miya, Y.Azuma, M.Nishida
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology 7

      ページ: 10-10

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    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S, M.Miya, J.G.Imoue, K.Saitoh, N.B.Ishiguro, M.Nishida
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      Molecular Phylogenetics and Evolution (in press)

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      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Phylogenetic position of tetraodonifrom fishes within the higher teleosts : bayesian inferences based on 44 whole mitochondrial genome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y, M.Miya, K.Matsuura, N.Yagishita, K.Mabuchi, H.sakai, M.Katoh, M.Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution (in press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mitogenomic evolution and interrelationships of the Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi) : The first evidence towards resolution of higher-level relationships of the World's largest freshwater-fish Glade based on 59 whole mitogenome sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, K., T. Sado, R.L. Mayden, N. Hanzawa, K. Nakamura, M. Nishida, M. Miya
    • 雑誌名

      J. Mol. Evol 63(6)

      ページ: 826-841

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] New primers for amplifying and sequencing the mitochondrial ND4/ND5 gene region of the Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi)2006

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., K. Saitoh, R. Wood, M. Nishida, R. L. Mayden
    • 雑誌名

      Ichthyol. Res 53(1)

      ページ: 75-81

    • NAID

      10017288731

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The mitochondrial genome of spotted green pufferfish Tetraodon nigroviridis(Teleostei : Tetraodontifourmes)and divergence time estimation among modcl organisms in fishes2006

    • 著者名/発表者名
      Ymanoue, Y., M.Miya, J.G.Inoue, K.Matsuura, M.Nishida
    • 雑誌名

      Gene and Genetic Systems 81(1)

      ページ: 29-39

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Round and pointed-head grenadier fishes(Actinopterygii : Gadiformes)represent a single sister-group : Evidence from the complete mitochondrial genome sequences and gene order2006

    • 著者名/発表者名
      Satoh, T.p., M.Miya, H.Endo, M.Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 40(1)

      ページ: 129-138

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Complete mitochondrial DNA sequence of the Lake Biwa wild strain of commomcarp(Cyprinus carpio L.) : Further evidence for an ancient origin2006

    • 著者名/発表者名
      Mabuchi, K., M.Miya, H.Senou, T.Suzuki, M.Nishida
    • 雑誌名

      Aquaculture 257

      ページ: 68-77

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mitogenomic evolution and interrelationships of the Cypriniformes(Actinopterygii : Ostariophysi) : The first evidence towards resolution of higher-level relationships of the World's largest freshwater-fish clade based on 59 whole mitogenome sequences2006

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, K, T.Sado, R.L.Mayden, N.Hanazawa, K.Nakamura, M.Nishida, M.Miya
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Evolition 63(2)

      ページ: 826-841

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] New primers for amplifying and sequencing the mitochondrial ND4/ND5 gene region of the Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi)2006

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., K.Saitoh, R.Wood, M.Nishida, R.L.Mayden
    • 雑誌名

      Ichthyological Research 53(1)

      ページ: 75-81

    • NAID

      10017288731

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The mitochondrial genome of spotted green pufferfish Tetraodon nigroviridis (Teleostei : Tetraodontiformes) and divergence time estimation among model organisms in fishes2006

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M.Miya, J.G.Inoue, K.Matsuura, M.Nishida
    • 雑誌名

      Gene and Genetic Systems (In press)

    • NAID

      10017408146

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular systematics of the gonorynchiform fishes (Teleostei) based on whole mitogenome sequences : Implications for higher-level relationships within the Otocephala2005

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M. Miya, J. G. Inoue, K. Saitoh, N. B. Ishiguro, M. Nishida
    • 雑誌名

      Mol. Phylogenet. Evol 37(1)

      ページ: 165-177

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Sundasalanx (Sundasalangidae) is a progenetic clupeiform, not a closely-related group of salangids (Osmeriformes) : Mitogenomic evidence2005

    • 著者名/発表者名
      Ishiguro, N.B., M. Miya, J. G. Inoue, M. Nishida
    • 雑誌名

      J. Fish Biol 67(2)

      ページ: 561-569

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The phylogenetic position of toadfishes (order Batrachoidiformes) in the higher ray-finned fish as inferred from partitioned Bayesian analysis of 102 whole mitochondrial genome sequences2005

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., T. P. Satoh, M. Nishida
    • 雑誌名

      Biol. J. Linn. Soc 85(3)

      ページ: 289-306

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The mitochondrial genome of Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis (Sarcopterygii : Coelacanthiformes) and divergence time estimation between the two coelacanths2005

    • 著者名/発表者名
      Inoue, J. G., M. Miya, B. Venkatesh, M. Nishida
    • 雑誌名

      Gene 349

      ページ: 227-235

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny and evolution of the freshwater eels genus Anguilla based on the whole mitochondrial genome sequences2005

    • 著者名/発表者名
      Minegishi, Y., J.Aoyama, J.G.Inoue, M.Miya, M.Nishida, K.Tsukamoto
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 34(1)

      ページ: 134-146

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The mitochondrial genome of Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis (Sarcopterygii : Coelacanthiformes) and divergence time estimation between the two coelacanths2005

    • 著者名/発表者名
      Inoue, J.G., M.Miya, B.Venkatesh, M.Nishida
    • 雑誌名

      Gene 349

      ページ: 227-235

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The phylogenetic position of toadfishes (order Batrachoidiformes) in the ray-finned fish as inferred from partitioned Bayesian analysis of 102 whole mitochondrial genome sequences2005

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., T.P.Satoh, M.Nishida
    • 雑誌名

      Biological Journal of the Linnean Society 85(3)

      ページ: 289-306

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Sundasalanx (Sundasalangidae) is a progenetic clupeiform, not a closely-related group of salangids (Osmeriformes) : Mitogenomic evidence2005

    • 著者名/発表者名
      Ishiguro, N.B., M.Miya, J.G.Inoue, M.Nishida
    • 雑誌名

      Journal of Fish Biology 67(2)

      ページ: 561-569

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular systematics of the gonorynchiform fishes (Teleostei) based on whole mitogenome sequences : Implications for higher-level relationships within the Otocephala2005

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya, J.G.Inoue, K.Saitoh, N.B.Ishiguro, M.Nishida
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 37(1)

      ページ: 165-177

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノム全長配列を用いた魚類の大系統解析と分類への応用2009

    • 著者名/発表者名
      宮正樹
    • 学会等名
      日本分類学会連合公開シンポジウム「分類学におけるDNA情報の活用」
    • 発表場所
      国立科学博物館新宿分館
    • 年月日
      2009-01-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] フグ類の進化2008

    • 著者名/発表者名
      山野上祐介, 宮正樹, 松浦啓一, 西田睦, 酒井治己
    • 学会等名
      水産大学校公開シンポジウム「本場・下関で「ふく」を語る〜意外に知らないフグの秘密〜」
    • 発表場所
      水産大学校
    • 年月日
      2008-11-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノムと11の核遺伝子配列から明らかになったトゲウオ亜目魚類の系統関係2008

    • 著者名/発表者名
      川原玲香, 宮正樹, 馬渕浩司, 西田睦
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2008-09-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ハゼ亜目シラスウオ属魚類の起源:ミトコンドリアゲノム全長配列による分子系統解析2008

    • 著者名/発表者名
      昆健志, 宮正樹, Lukas Ruber, 中谷将典, 吉野哲夫, 西田睦
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2008-09-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ダルマガレイ科魚類におけるミトコンドリアゲノムの進化2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤崇, 宮正樹, 西田睦
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2008-09-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノム全塩基配列に基づくトウゴロウイワシ系魚類の分子系統2008

    • 著者名/発表者名
      Davin H. E. Setiamarga, 宮正樹, 山野上祐介, 馬渕浩司, 井上潤, 佐藤崇, 西田睦
    • 学会等名
      2008年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2008-09-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Patterns of diversification in modern ray-finned fishes : An overview based on 327 whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Miya, M
    • 学会等名
      EEB Seminar
    • 発表場所
      Yale University
    • 年月日
      2008-09-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Higher-level relationships of the Cypriniformes (Actinopterygii : Ostariophysi) inferred from 238 whole mitochondrial genome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., T. Sado, K. Saitoh, H. H. Bart, Jr., M. H. Doosey, I. Doadrio, Y, Keivany, J. Shrestha, V. Lheknim, R. Zardoya, M. Nishida, R. L. Mayden
    • 学会等名
      Joint Meeting of Ichthyologists and Herpetologists
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2008-07-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Mitogenomic evaluation of historical biogeography of cichlids toward reliable dating of teleostean divergences2008

    • 著者名/発表者名
      Azuma, Y. Y. Kumazawa, M. Miya, K. Mabuchi, M. Nishida
    • 学会等名
      Annual Meeting of Society for Molecular Biology and Evolution. Barcelona
    • 発表場所
      Barcelona, Spain
    • 年月日
      2008-06-08
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 東南アジアのコイ目魚類採集調査2008

    • 著者名/発表者名
      佐土哲也, 宮正樹
    • 学会等名
      日本生物地理学会シンポジウム「新たな時代の生物地理学-海外学術調査の現状・成果・体験記-」
    • 発表場所
      立教大学
    • 年月日
      2008-04-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary history of modern ray-finned fishes:An overview based on 327 whole mitogenome sequencees2008

    • 著者名/発表者名
      Miya, M & M.Nishida
    • 学会等名
      International Symposium on Systematics and Diversity of Fishes
    • 発表場所
      National Museum of Nature and Science,Tokyo
    • 年月日
      2008-03-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Higher-level relationships of the Otocephala(Teleostei)inferred from whole mitogenome sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya & M.Nishida
    • 学会等名
      International Symposium on Systernatics and Diversity of Fishes
    • 発表場所
      National Museum of Nature and Science,Tokyo
    • 年月日
      2008-03-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 東アジア産ハリガネキノリ属地衣類の分類学的検討(3)2008

    • 著者名/発表者名
      原田浩・王立松
    • 学会等名
      日本地衣学会第7回大会
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 地衣類の分類2008

    • 著者名/発表者名
      原田浩
    • 学会等名
      日本植物学会第72回大会シンポジウム「日本地衣学の過去と現在, 未来
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Collecting trips of the Cypriniformes to South and Southeast Asian countries2007

    • 著者名/発表者名
      Sado, T.& M.Miya
    • 学会等名
      Special Symposium:Biology of Cypriniformes
    • 発表場所
      Chiang Rai,Thailand
    • 年月日
      2007-11-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Resolving powor of mitochondrial genomic data for interrelationsihips among cypriniform fishes(Actinopteygii:Oshtariophysi)2007

    • 著者名/発表者名
      Saitoh, K, T, Sado, M.H.Doosey, H.L.Bart, Jr., R.L.Mayden, M.Nishida & M.Miya
    • 学会等名
      Special Symposium:Biology of Cypriniformes
    • 発表場所
      Chiang Rai,Thailand
    • 年月日
      2007-11-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Higher-level relationships of the Otoccphala(Teleostei)inferred from whole mitogenome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya & M.Nishida
    • 学会等名
      SpeciaI Symposium:Biology of Cypriniformes
    • 発表場所
      Chiang Rai.Thailand
    • 年月日
      2007-11-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Molecular systematics of the deep-sea alepocephaliform fishes(Teleostei)based on whole mitogenome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya, J.Poulsen, P.Moller & M.Nishida
    • 学会等名
      2007年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      北海道大学,札幌
    • 年月日
      2007-10-07
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアゲノム全長配列から推定されたソコダラ科魚類の系統関係2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤 崇・宮 正樹・遠藤 広光・西田 睦
    • 学会等名
      2007年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      北海道大学,札幌
    • 年月日
      2007-10-07
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Patterns of diversification in modem ray-finned fishes:An overview based on 327 whole mitogenome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M & M.Nishida
    • 学会等名
      International Symposium"The Origin and Evolution of Natural Diversity"
    • 発表場所
      Hokkaido University,Sapporo
    • 年月日
      2007-10-05
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary history of fishes:An overview based on >1000 whole mitochondrial genome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M & M.Nishida
    • 学会等名
      The Second International Barcode of Life Conference
    • 発表場所
      Taipei,Taiwan
    • 年月日
      2007-09-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Phylogeny of Leuciscinae fishes widely distributed in northern hemisphere basedon mitochondrial genome2007

    • 著者名/発表者名
      Imoto, J., K.Saitoh, Y.P.Kartavtsev, K.Nakamura, M.Miya, M.Nishida & N.Hanzawa
    • 学会等名
      Modern Achieveoments in Population, Evolutionary and Ecological Genetics 2007
    • 発表場所
      Vradivostok Marine Biological Station,Russia
    • 年月日
      2007-09-12
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 硬骨魚類の分岐年代推定におけるシクリッド系統地理の有効性2007

    • 著者名/発表者名
      東陽一郎, 熊澤慶伯, 宮正樹, 馬渕浩司, 西田睦
    • 学会等名
      日本進化学会第10回京都大会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2007-08-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] シクリッドとベラ科魚類にみられる特殊な咽頭顎器官は独立に進化した2007

    • 著者名/発表者名
      馬渕 浩司・宮 正樹・東 陽一郎・西田 睦
    • 学会等名
      日本進化学会第9回京都大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2007-08-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 動物ミトコンドリアゲノムの遺伝子配置の保存性は何によってもたらされているか2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤 行人・佐藤 崇・宮 正樹・西田 睦
    • 学会等名
      日本進化学会第9回京都大会
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2007-08-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] A phylogenetic tirnescale applied to evolution of the electric sense in the Notopteroidei(Osteolossomorpha)2007

    • 著者名/発表者名
      Lavoue, S., M.Miya. M.E.Arnegard, P.B.McIntyre,V.Mamonekene & M.Nishida
    • 学会等名
      Evolutionary Biology in the 21st Century:Tracing Patterns of Evolution through the Tree of Life
    • 発表場所
      Eighth International Congress of Neuroethology, Vancouver,Canada
    • 年月日
      2007-07-25
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Cypriniformes Tree of Life(CToL):Higher-level relationships of the Cypriniformes(Actinopterygii:Ostariophysi)inferred from 152 whole mitochondrial genome sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., T.Sado, K.Saitoh, H.L.Bart, Jr, M.H.Doosey, I..Doadrio, Y.Keivany, J.Shrestha, R.Zardoya, M.Nishida, R.L..Mayden
    • 学会等名
      Evolutionary Biology in the 21st Century:Tracing Patterns of Evolution through the Tree of Life
    • 発表場所
      Joint Meeting of Ichthyologists and Her petoIogists.St,Louis,Missouri,USA
    • 年月日
      2007-07-10
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Patterns of diverSification in modern ray-finned fishes:A mitogenomic overview2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M., J.G.Inoue, K.Mabuchi & M.Nishida
    • 学会等名
      Evolution 2007
    • 発表場所
      Christchurch Convention Center,Christchurch,New Zealand
    • 年月日
      2007-06-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Patterns of diversification in modem ray-finned fishes2007

    • 著者名/発表者名
      Miya, M
    • 学会等名
      Evolutionary Biology in the 21st Century:Tracing Patterns of Evolution through the Tree of Life
    • 発表場所
      The Chinese Academy of Sciences,Beijiing,China
    • 年月日
      2007-06-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Rapid radiation and Speciation of Takifugu species in marine waters of East Asia:Another use of the fugu,Takifugu rubripes as a model2007

    • 著者名/発表者名
      Yamanoue, Y., M.Miya, K.Matsuura, H.SakaiMKatOh & Mutsumi Nishida
    • 学会等名
      International Syrnposium on Systernatics and Diversity of Fishes
    • 発表場所
      National Museum of Nature and Science,Tokyo
    • 年月日
      2007-03-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 東アジア産ハリガネキノリ属地衣類の分類学的検討(2)2007

    • 著者名/発表者名
      原田浩・王立松
    • 学会等名
      日本地衣学会第6回大会
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 東アジア産ハリガネキノリ属地衣類の分類学的検討(1)2006

    • 著者名/発表者名
      原田浩
    • 学会等名
      日本植物学会第70回大会
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考] 魚類ミトコンドリアゲノムデーターベス(MitoFish)

    • URL

      http://mitofish.ori.u-tokyo.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] 魚類ミトコンドリアゲノムデータベース(MittFish)

    • URL

      http://mitofish.ori.u-tokyo.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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