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日本産野生ドブネズミ由来の近交系ラットを用いた交雑群による毒性評価システムの構築

研究課題

研究課題/領域番号 17300132
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 実験動物学
研究機関北海道大学

研究代表者

北田 一博  北海道大学, 理学研究院, 准教授 (70263093)

研究期間 (年度) 2005 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
16,100千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 900千円)
2007年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2006年度: 7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
2005年度: 4,800千円 (直接経費: 4,800千円)
キーワード安全性試験 / ラット / クローズドコロニー / 野生ドブネズミ / NIG-III / マイクロサテライトマーカー / 4元交雑 / 毒性評価 / 交雑群 / 感受性遺伝子 / マイクロサテライトマー
研究概要

新規化合物に対する安全性試験に、クローズドコロニーのラットが汎用される。しかし、クローズドコロニーの遺伝モニタリングは容易でなく、集団の一部で毒性が観察された場合であっても、遺伝解析が適用困難である。そこで、新たな安全性試験のためのツールとして、当施設で維持している日本産野生ドブネズミ由来の近交系ラットNIG-III等を用いた交雑群の有用性を検討することにした。既存ラット系統から遺伝的に離れているNIG-IIIを用いるため、遺伝的多様性が供給されるし、交雑群を採用するため、前もって多型性を示すマイクロサテライトマーカーを用意しておけば、遺伝モニタリングの実施は容易であり、家系分析が可能となるため副作用感受性遺伝子の同定も可能となる。既存のクローズドコロニーとNIG-IIIを用いた交雑群を併用することにより、より確実な毒性評価、副作用感受性遺伝子の同定の実現が期待される。
本研究においては、4つの近交系(BN、F344、NIG-III、SHR)に対してPCRを行い、オートシークエンサーを用いた電気泳動を行ったところ、多型性を示すマイクロサテライトマーカーが得られた。続いて、出生時体重をモデルとして遺伝解析を実施した。すなわち、4つの近交系(BN、F344、NIG-III、SHR)から実際に4元交雑の新生仔を作出するとともに、体重を測定した。さらに、常染色体上の32のマイクロサテライトマーカーを用いてそれぞれの遺伝子型を決定し、1系統の対立遺伝子とその他の対立遺伝子のフォーマットで4つのデータセットでQTL解析を実施した。しかし、今回採用したQTL解析では有意な遺伝子座が検出されなかった。これは、遺伝的多様性はもつものの、組換えを生ずる世代は1世代しか経ていないこと、また、遺伝子型についてはホモ化を含め、多様な遺伝子型がそろっていなかったことに起因する可能性が考えられた。

報告書

(4件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2007 2006 2005

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Transposon-tagged mutagenesis in the rat2007

    • 著者名/発表者名
      Kitada K, et al
    • 雑誌名

      Nat Methods 4

      ページ: 131-3

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Absence-like and tonic seizures in aspartoacylase/attractin double-mutant mice.2007

    • 著者名/発表者名
      H. Goma, et. al.
    • 雑誌名

      Exp Anim. 56

      ページ: 161-165

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] WTC deafness Kyoto(dfk) : a rat model for extensive investigations of Kcnq1 functions2006

    • 著者名/発表者名
      Gohma H, et al
    • 雑誌名

      Physiol Genomics 24

      ページ: 198-206

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] WTC deafness Kyoto(dfk): a rat model for extensive investigations of Kcnq1 functions2006

    • 著者名/発表者名
      Gohma H, et al
    • 雑誌名

      Physiol Genomics 24

      ページ: 198-206

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] WTC deafness Kyoto (dfk) : a rat model for extensive investigations of Kcnql functions.2006

    • 著者名/発表者名
      Gohma, H., et al.
    • 雑誌名

      Physiol Genomics. 24(3)

      ページ: 198-206

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mutation at the Lmxla locus provokes aberrant brain development in the rat2005

    • 著者名/発表者名
      Kuwamura M, et al
    • 雑誌名

      Brain Res Dev Brain Res 155

      ページ: 99-106

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutation at the Lmx1a locus provokes aberrant brain development in the rat.2005

    • 著者名/発表者名
      Kuwamura, M. et al.
    • 雑誌名

      Brain Res Dev Brain Res 155(2)

      ページ: 99-106

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [学会発表] SUCCESSFUL TRANSPOSON-TAGGED MUTAGENESIS IN THE RATGERM AND SOMOTIC LINES2007

    • 著者名/発表者名
      K. Kitada, et. al.
    • 学会等名
      Rat Genomics and Models
    • 発表場所
      Cold Spring Haborアメリカ・ニューヨーク州
    • 年月日
      2007-12-09
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] SUCCESSFUL TRANSPOSON-TAGGED MUTAGENESIS IN THE RAT GERM AND SOMOTIC LINES2007

    • 著者名/発表者名
      Kitada K, et al
    • 学会等名
      Conference on Rat Genomics and Models
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Lab
    • 年月日
      2007-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] SUCCESSFUL TRANSPOSON-TAGGED MUTAGENESIS IN THE RAT GERM AND SOMOTIC LINES2007

    • 著者名/発表者名
      Kitada K
    • 学会等名
      Rat Genomics and Models
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Lab
    • 年月日
      2007-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2005-04-01   更新日: 2016-04-21  

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