クロロフィルdの分布とAcaryochlorisの微生物生態学的解析

• 研究課題/領域番号: 17370009
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生態・環境
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 宮下 英明 京都大学, 大学院・人間環境学研究科, 准教授 (50323746)
• 研究期間 (年度): 2005 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 10,850千円 (直接経費: 10,100千円、間接経費: 750千円); 2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2007年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円); 2005年度: 6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
• キーワード: クロロフィル d / Acaryochloris / PCR-DGGE / 分布 / 多様性 / 微生物生態 / クロロフィルd

研究概要

本研究では, クロロフィルdを有する唯一のシアノバクテリアAcaryochloris spp.が, 海藻などへの付着生物, あるいは浮遊生物として世界中の海洋沿岸に広範に分布すること, 2種程度に分けることのできる遺伝的多様性をもつこと、地理的な遺伝的分化がみられないことなどを明らかにした。さらに、海洋沿岸環境ではクロロフィルdの量が,クロロフィルaの量に対して平均1%前後存在し一次生産に一定の寄与をしていることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] nique photosystems in Acaryochloris marina (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohashi, S., Miyashita, H., Okada, N., Iemura, T., Watanabe, T., & Kobayashi, M
  • 雑誌名: Photosynth Res 98 ページ: 141-149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence for global Chlorophyll d (2008)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama, Y., Miyashita, H., Ohkubo, S., Ogawa,N. O., Chikaraishi, Y., Takano, Y., Suga, H., Toyohuku, T., Nomaki, H., Kitazato, H., Nagata, T., & Ohkouchi,N
  • 雑誌名: Science 321 ページ: 658-658
  • 査読あり
• [雑誌論文] Niche adaptation and genome expansion in the chlorophyll d-producing cyanobacterium Acaryochloris marina (2008)
  • 著者名/発表者名: Swingley, W.D., Chen, M., Cheung, P.C., Conrad, A.L., Dejesa, L.C., Hao, J., Honchak, B.M., Karbach, L.E., Kurdoglu, A., Lahiri, S., Mastrian, S.D., Miyashita, H., Page, L., Ramakrishna, P., Satoh, S., Sattley, W.M., Shimada, Y., Taylor, H.L., Tomo, T., Tsuchiya, T., Wang, Z.T., Raymond, J., Mimuro, M., Blankenship, R.E., & Touchman, J.W
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 105 ページ: 2005-2010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence of Global Chlorophyll d (2008)
  • 著者名/発表者名: Yuichiro Kashiyama, 他11名
  • 雑誌名: Science 321 ページ: 658-658
  • 査読あり
• [雑誌論文] Uniqe photosystems in Acaryochloris marina (2008)
  • 著者名/発表者名: Shunsuke Ohhashi, 他5名
  • 雑誌名: Photosynthesis Research 98 ページ: 141-149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Niche adaptation and genome expansion in the chlorophyll d-producing cyanobacterium Acaryochloris marina. (2008)
  • 著者名/発表者名: Wesley D. Swingley, ほか24名
  • 雑誌名: Proceedings of National Academy of Science USA. 105 ページ: 2005-2010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular detection of epiphytic Acaryochloris spp. on marine macroalgae. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohkubo, S., Miyashita, H., Murakami, A., Takeyama, H., Tsuchiya, T., Mimuro, M
  • 雑誌名: Appl. Environ. Microbiol 72 ページ: 7912-7915
  • 査読あり
• [雑誌論文] シアノバクテリアに見られるクロロフィルの多様性 (2006)
  • 著者名/発表者名: 宮下英明
  • 雑誌名: 遺伝 6巻6号 ページ: 33-39
• [雑誌論文] Molecular detection of chlorophyll d-dominating epiphytic cyanobacteia, Acaryochloris spp., on macroalgae (2006)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Ohkubo, Hideaki Miyashita, Akio Murakami, Haruko Takeyama, Tohru Tsuchiya, Mamoru Mimuro
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology Vol.72, No.12 ページ: 7921-7915
• [雑誌論文] Detection of cyanobacteria in Antarctic samples using PCR-DGGE (2005)
  • 著者名/発表者名: Miyashita, H., Ohkubo, S., Naganuma, T., Imura S
  • 雑誌名: Proceedings of the Seminar on Antarctic Research in the University of Malaya
• [雑誌論文] クロロフィルdを使うシアノバクテリアAcaryochlorisの光合成と系統発生過程の推定 (2005)
  • 著者名/発表者名: 宮下英明
  • 雑誌名: 光合成研究会会報 44号
• [学会発表] Possible impacts of chlorophyll d on global carbon cycle (2008)
  • 著者名/発表者名: Miyashita, H., Ohkubo, S., Kashiyama, Y., & Ohkouchi, N.
  • 学会等名: 8th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  • 発表場所: Busan, Korea
  • 年月日: 2008-11-15
• [学会発表] Ecological distribution of Acaryochloris spp. and chlorophyll d (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohkubo, S., & Miyashita, H
  • 学会等名: 12th International Symposium on Microbial Ecology
  • 発表場所: Cairns, Australia
  • 年月日: 2008-08-17
• [学会発表] 海藻から抽出されるクロロフィルdの検出と定量 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明
  • 学会等名: 第11回マリンバイオテクノロジー学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2008-05-24
• [学会発表] 海藻から抽出されるクロロフィル dの検出と定量 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明
  • 学会等名: 第11回マリンバイオテクノロジー学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2008-05-24
• [学会発表] 海藻に検出されるクロロフィルdの定量 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明
  • 学会等名: 日本藻類学会第32回大会
  • 発表場所: 東京海洋大学
  • 年月日: 2008-03-23
• [学会発表] クロロフィルdを主要色素とするシアノバクテリアAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • 学会等名: 第27回微生物系統分類研究会年次大会
  • 発表場所: 地方職員共催組合富士保養所富士桜荘
  • 年月日: 2007-11-16
• [学会発表] クロロフィルdを主要色素とするシアノバクテリアAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司、宮下英明、土屋徹、三室守
  • 学会等名: 第27回品微生物系統分類研究会年次大会
  • 発表場所: 地方職員共催組合 富士保養所 富士桜荘
  • 年月日: 2007-11-16
• [学会発表] Acaryochloris spp.の分布 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • 学会等名: 第23回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 愛媛大学
  • 年月日: 2007-09-16
• [学会発表] Wide dsitribution of Acaryochloris spp., chlorophyll d-dominating cyanobacteria (2007)
  • 著者名/発表者名: Miyashita, H., Ohkubo, S., Tsuchiya, T, & Mimuro, M.
  • 学会等名: 21st Pacific Science Congress(PSC21)
  • 発表場所: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan
  • 年月日: 2007-06-14
• [学会発表] Wide dsitribution of Acaryochloris spp., chlorophyll d-dominating cyanobacteria (2007)
  • 著者名/発表者名: Hideaki Miyashita, Satoshi Ohkubo, Tohru Thuchiya and Mamoru Mimuro
  • 学会等名: 21st Pacific Science Congress (PSC21)
  • 発表場所: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan
  • 年月日: 2007-06-14
• [学会発表] Acaryochloris spp. の地理分布と生態分布 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • 学会等名: 日本藻類学会第31回大会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2007-03-25
• [学会発表] シアノバクテリアの多様化 (2006)
  • 著者名/発表者名: 宮下英明
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー(共催 : 日本光合成研究会第6回ワークショップ)
  • 発表場所: 大阪大学
  • 年月日: 2006-10-12
• [学会発表] 群体ホヤに検出されるAcaryochloris spp.の遺伝的多様性 (2006)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 竹山春子, 三室守
  • 学会等名: 日本藻類学会第30回大会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 年月日: 2006-03-27
• [学会発表] PCR-DGGE 法を用いたAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性の解析 (2005)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • 学会等名: かずさDNA 研究所研究会「ラン藻の分子生物学」
  • 発表場所: 木更津かずさアカデミアホール
  • 年月日: 2005-12-05
• [学会発表] シアノバクテリアの多様性と不思議 (2005)
  • 著者名/発表者名: 宮下英明
  • 学会等名: かずさDNA研究所研究会「ラン藻の分子生物学」
  • 発表場所: 木更津かずさアカデミアホール
  • 年月日: 2005-12-05
• [学会発表] Acaryochloris spp.の光化学系I反応中心タンパク質の進化速度は速い (2005)
  • 著者名/発表者名: 宮下英明, 細谷直史, 土屋徹, 三室守
  • 学会等名: 第21回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2005-11-02
• [学会発表] Palauの群体ホヤから検出されるAcaryochloris spp.の遺伝的多様性 (2005)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • 学会等名: 第21回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2005-10-31
• [学会発表] Wide distribution of epiphytic Acaryochloris on red macroalgae (2005)
  • 著者名/発表者名: Miyashita, H., Ohkubo, S., Tsuchiya, T, & Mimuro, M.
  • 学会等名: The 8^<th> International Phycological Congress
  • 発表場所: Durban, South Africa
  • 年月日: 2005-08-16
• [学会発表] 日本沿岸に生息するAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性 (2005)
  • 著者名/発表者名: 大久保智司, 宮下英明, 村上明男, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • 学会等名: 第12回日本光生物学協会年会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2005-08-06
• [学会発表] パパインによるクロロフィルa → クロロフィルd 変換の発見-Acaryochloris marina でのChl d 生合成との関連 (2005)
  • 著者名/発表者名: 小泉創, 細田定正, 宮下英明, 三室守, 白岩善博, 山下俊, 小林正美
  • 学会等名: 第8回マリンバイオテクノロジー学会大会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2005-05-29
• [備考] 平成19年8月1日新聞掲載(朝日新聞、フジサンケイビジネスアイ、日経産業新聞、日刊工業新聞、化学工業日報,京都新聞)